154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0594 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0594  type I secretion target GGXGXDXXX repeat-containing protein  100 
 
 
466 aa  918    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.353541  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1199  hemolysin-type calcium binding protein  58.18 
 
 
532 aa  402  9.999999999999999e-111  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.506347  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0597  ApxIVA Var3  51.02 
 
 
548 aa  382  1e-105  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1194  type I secretion target GGXGXDXXX repeat-containing protein  57.92 
 
 
928 aa  328  1.0000000000000001e-88  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1186  type I secretion target GGXGXDXXX repeat-containing protein  44.28 
 
 
618 aa  317  4e-85  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1191  ApxIVA Var3  51.13 
 
 
428 aa  308  2.0000000000000002e-82  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.171556  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1438  type I secretion target GGXGXDXXX repeat-containing protein  52.94 
 
 
677 aa  261  1e-68  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.191778  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1433  hypothetical protein  77.57 
 
 
320 aa  164  2.0000000000000002e-39  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0949231  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1201  type I secretion target GGXGXDXXX repeat-containing protein  48.94 
 
 
377 aa  155  1e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.12617  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1648  hemolysin-type calcium binding protein  42.34 
 
 
940 aa  113  7.000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1592  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  42.65 
 
 
1789 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1000  Hemolysin-type calcium-binding region  41.21 
 
 
844 aa  109  9.000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.862975  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  45.26 
 
 
4798 aa  109  1e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0327  hemolysin-type calcium binding protein  37.25 
 
 
1814 aa  108  3e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0391395  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2204  peptidase M23  43.31 
 
 
999 aa  107  6e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2298  hemolysin-type calcium binding protein  44.09 
 
 
1480 aa  107  6e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.880239  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1250  hypothetical protein  44.2 
 
 
541 aa  106  9e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1512  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  39.71 
 
 
2107 aa  105  1e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.821841  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0589  peptidase M10A and M12B, matrixin and adamalysin  48.82 
 
 
288 aa  104  3e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.340966  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  41.35 
 
 
1499 aa  103  8e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0997  hypothetical protein  30.51 
 
 
582 aa  102  1e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2550  putative outer membrane adhesin like protein  38.62 
 
 
3598 aa  101  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6773  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  40.58 
 
 
1925 aa  95.1  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395302  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06448  hemolysin A  37.86 
 
 
1112 aa  94.4  4e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1189  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  44.44 
 
 
233 aa  94  5e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.730459  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0299  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  39.47 
 
 
1607 aa  93.6  7e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06446  hypothetical protein  38.1 
 
 
959 aa  90.5  5e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0994  hypothetical protein  49.12 
 
 
585 aa  90.1  7e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2962  hypothetical protein  37.07 
 
 
326 aa  90.1  7e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0055172  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0591  hypothetical protein  55.95 
 
 
93 aa  87.8  3e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.813935  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0588  hypothetical protein  55.95 
 
 
93 aa  87.8  4e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.26826  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0991  hypothetical protein  47.37 
 
 
679 aa  85.5  0.000000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  33.33 
 
 
4687 aa  84.7  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0104  putative hemolysin-type calcium-binding protein  37.98 
 
 
960 aa  80.9  0.00000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1754  large exoprotein involved in heme utilization or adhesion  31.5 
 
 
1809 aa  76.3  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0481615 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4716  hypothetical protein  34.56 
 
 
337 aa  75.5  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.147365 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3833  hypothetical protein  38.76 
 
 
364 aa  73.6  0.000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0927  hypothetical protein  32.41 
 
 
351 aa  72.8  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4242  hemolysin-type calcium-binding protein  34.78 
 
 
1544 aa  72.8  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0332  membrane protein  39.47 
 
 
422 aa  71.2  0.00000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.797962  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0050  hemolysin-type calcium-binding region  35.43 
 
 
2296 aa  70.5  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.133604 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1572  bacteriocin  37.86 
 
 
435 aa  70.5  0.00000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.301349  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4924  serine protease  33.33 
 
 
1805 aa  68.6  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0586  hypothetical protein  62.96 
 
 
225 aa  68.2  0.0000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1963  hypothetical protein  33.33 
 
 
1306 aa  68.2  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0034  hypothetical protein  35.25 
 
 
327 aa  67  0.0000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.749355 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0514  hypothetical protein  33.64 
 
 
351 aa  66.6  0.0000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.241085  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1995  hypothetical protein  35.78 
 
 
371 aa  65.9  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.153544  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2746  hypothetical protein  32.11 
 
 
359 aa  65.5  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0371  hypothetical protein  38.98 
 
 
345 aa  63.9  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0768  hypothetical protein  36.7 
 
 
346 aa  63.2  0.00000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000331369  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1931  hypothetical protein  24.55 
 
 
354 aa  62.8  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.349657  normal  0.547729 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0822  membrane protein  31.3 
 
 
310 aa  61.6  0.00000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000142099  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1901  hypothetical protein  29.01 
 
 
435 aa  56.2  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0082  hypothetical protein  34.86 
 
 
295 aa  56.2  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.590083  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1018  hypothetical protein  25 
 
 
2767 aa  55.5  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.556407 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0885  hypothetical protein  30.4 
 
 
788 aa  55.8  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.854858  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2201  hypothetical protein  31.19 
 
 
265 aa  55.1  0.000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.139825  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1897  Nidogen, extracellular region  54.17 
 
 
1557 aa  53.5  0.000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  36.89 
 
 
3209 aa  53.5  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2875  hypothetical protein  30.43 
 
 
435 aa  53.5  0.000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.140163  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0583  putative Ig  54.17 
 
 
1055 aa  50.8  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1215  type 1 secretion target domain protein  32.33 
 
 
2542 aa  50.4  0.00006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03672  putative hemolysin-type calcium-binding protein  31.54 
 
 
589 aa  50.1  0.00009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0340906 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4655  hemolysin-type calcium-binding region  42.19 
 
 
375 aa  50.1  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3695  proprotein convertase P  27.92 
 
 
2911 aa  48.9  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.523637 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  54.17 
 
 
1019 aa  48.9  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1161  Hemolysin-type calcium-binding region  48.39 
 
 
2537 aa  48.9  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.78 
 
 
1795 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1495  von Willebrand factor type A  65.71 
 
 
2478 aa  47.8  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2063  type I secretion target repeat-containing protein  47.69 
 
 
3204 aa  47.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2201  cable pili-associated 22 kDa adhesin protein  47.69 
 
 
2911 aa  47.8  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.266239  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0122  hemolysin-type calcium-binding region  48.28 
 
 
534 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.589398  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6876  Hemolysin-type calcium-binding region  49.21 
 
 
547 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3615  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  55.81 
 
 
868 aa  47.4  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.705484  normal  0.0425486 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0186  hypothetical protein  54.55 
 
 
6753 aa  47.4  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.306412 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0133  von Willebrand factor, type A  64.71 
 
 
5218 aa  47  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.809343 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2246  VCBS  41.57 
 
 
5769 aa  47  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0632  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  48.08 
 
 
1415 aa  47  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3665  endonuclease/exonuclease/phosphatase  47.83 
 
 
1052 aa  47  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.27613 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0714  Cadherin  56.41 
 
 
1134 aa  47  0.0008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.48369  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4884  serralysin  45.1 
 
 
727 aa  47  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0382  putative outer membrane adhesin like proteiin  64.71 
 
 
5839 aa  46.2  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3855  hemolysin-type calcium-binding protein  47.17 
 
 
1029 aa  46.2  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.460711  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4185  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  47.17 
 
 
1029 aa  46.2  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.610735 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4254  Hemolysin-type calcium-binding region  48.15 
 
 
540 aa  45.8  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.129402  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0484  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  48 
 
 
2668 aa  45.8  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4079  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  45.45 
 
 
485 aa  45.8  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.237943  normal  0.0279439 
 
 
-
 
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  58.33 
 
 
4106 aa  45.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0281  protein of unknown function DUF839  48 
 
 
686 aa  45.8  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  47.83 
 
 
2667 aa  45.8  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0488  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  48.21 
 
 
577 aa  45.8  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.718847  normal  0.491604 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  46.97 
 
 
2954 aa  45.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0822  peptidase domain-containing protein  52.83 
 
 
820 aa  45.8  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0188  hypothetical protein  53.33 
 
 
9030 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0220008 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6816  Hemolysin-type calcium-binding region  50.85 
 
 
526 aa  45.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3353  heme peroxidase  47.17 
 
 
3608 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2121  hemolysin-type calcium-binding region  46.3 
 
 
368 aa  45.8  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.190728  normal  0.343329 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1227  cadherin domain-containing protein  41.18 
 
 
2251 aa  45.1  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3521  hypothetical protein  50 
 
 
161 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0357588  normal  0.598556 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>