106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1186 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1186  type I secretion target GGXGXDXXX repeat-containing protein  100 
 
 
618 aa  1227    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1199  hemolysin-type calcium binding protein  42.21 
 
 
532 aa  359  9.999999999999999e-98  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.506347  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0594  type I secretion target GGXGXDXXX repeat-containing protein  44.28 
 
 
466 aa  321  1.9999999999999998e-86  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.353541  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1201  type I secretion target GGXGXDXXX repeat-containing protein  55.41 
 
 
377 aa  288  2e-76  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.12617  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1191  ApxIVA Var3  44.03 
 
 
428 aa  276  6e-73  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.171556  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0597  ApxIVA Var3  36.27 
 
 
548 aa  268  2e-70  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1194  type I secretion target GGXGXDXXX repeat-containing protein  40.9 
 
 
928 aa  208  2e-52  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1438  type I secretion target GGXGXDXXX repeat-containing protein  41.23 
 
 
677 aa  175  1.9999999999999998e-42  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.191778  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0589  peptidase M10A and M12B, matrixin and adamalysin  40.49 
 
 
288 aa  167  5.9999999999999996e-40  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.340966  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1000  Hemolysin-type calcium-binding region  43.37 
 
 
844 aa  137  4e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.862975  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0991  hypothetical protein  48.26 
 
 
679 aa  137  5e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1250  hypothetical protein  46.51 
 
 
541 aa  137  5e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06446  hypothetical protein  41.04 
 
 
959 aa  127  4.0000000000000003e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06448  hemolysin A  40.4 
 
 
1112 aa  124  4e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1648  hemolysin-type calcium binding protein  39.18 
 
 
940 aa  120  9.999999999999999e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1592  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  38.6 
 
 
1789 aa  119  1.9999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2550  putative outer membrane adhesin like protein  39.88 
 
 
3598 aa  117  5e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0997  hypothetical protein  48.18 
 
 
582 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  35.8 
 
 
1499 aa  109  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0994  hypothetical protein  46.72 
 
 
585 aa  108  2e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1433  hypothetical protein  56.19 
 
 
320 aa  108  2e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0949231  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6773  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  36.42 
 
 
1925 aa  108  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395302  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0327  hemolysin-type calcium binding protein  35.09 
 
 
1814 aa  102  1e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0391395  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2962  hypothetical protein  34.43 
 
 
326 aa  103  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0055172  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1512  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  35.09 
 
 
2107 aa  102  2e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.821841  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0586  hypothetical protein  56 
 
 
225 aa  100  8e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2298  hemolysin-type calcium binding protein  40 
 
 
1480 aa  98.2  4e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.880239  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2204  peptidase M23  36.48 
 
 
999 aa  98.2  4e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1963  hypothetical protein  35.23 
 
 
1306 aa  93.6  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  31.76 
 
 
4687 aa  87.4  8e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1754  large exoprotein involved in heme utilization or adhesion  32.16 
 
 
1809 aa  86.7  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0481615 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0299  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  32.75 
 
 
1607 aa  84  0.000000000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0822  membrane protein  34.08 
 
 
310 aa  80.9  0.00000000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000142099  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0104  putative hemolysin-type calcium-binding protein  33.53 
 
 
960 aa  80.5  0.00000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1189  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  53.66 
 
 
233 aa  77.8  0.0000000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.730459  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3695  proprotein convertase P  31.35 
 
 
2911 aa  77.4  0.0000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.523637 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1572  bacteriocin  42.22 
 
 
435 aa  77  0.000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.301349  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4924  serine protease  30.06 
 
 
1805 aa  75.1  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  44.83 
 
 
4798 aa  72.4  0.00000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3833  hypothetical protein  35.71 
 
 
364 aa  68.2  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0885  hypothetical protein  27.32 
 
 
788 aa  68.2  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.854858  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0371  hypothetical protein  33.99 
 
 
345 aa  67.8  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2746  hypothetical protein  30.52 
 
 
359 aa  67  0.0000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0050  hemolysin-type calcium-binding region  33.57 
 
 
2296 aa  66.2  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.133604 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1018  hypothetical protein  26.9 
 
 
2767 aa  65.9  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.556407 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1931  hypothetical protein  28.86 
 
 
354 aa  65.5  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.349657  normal  0.547729 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4716  hypothetical protein  31.01 
 
 
337 aa  65.5  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.147365 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0768  hypothetical protein  33.33 
 
 
346 aa  63.5  0.00000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000331369  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0332  membrane protein  33.81 
 
 
422 aa  63.2  0.00000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.797962  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1995  hypothetical protein  31.07 
 
 
371 aa  63.2  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.153544  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4242  hemolysin-type calcium-binding protein  30.6 
 
 
1544 aa  61.6  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1901  hypothetical protein  25 
 
 
435 aa  61.2  0.00000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  27.74 
 
 
3209 aa  60.8  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2875  hypothetical protein  30.63 
 
 
435 aa  59.7  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.140163  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0571  hypothetical protein  31.64 
 
 
2682 aa  57.8  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0514  hypothetical protein  26.04 
 
 
351 aa  57  0.0000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.241085  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6671  hypothetical protein  24.84 
 
 
755 aa  55.8  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.538949  normal  0.529559 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0927  hypothetical protein  26.62 
 
 
351 aa  54.7  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03672  putative hemolysin-type calcium-binding protein  42.42 
 
 
589 aa  53.1  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0340906 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0588  hypothetical protein  32.32 
 
 
93 aa  52.4  0.00002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.26826  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0591  hypothetical protein  32.32 
 
 
93 aa  52.8  0.00002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.813935  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3089  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  32.48 
 
 
2689 aa  52  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.470754 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2715  VCBS  50 
 
 
3026 aa  50.8  0.00008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0034  hypothetical protein  29.75 
 
 
327 aa  50.4  0.00009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.749355 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2201  hypothetical protein  41.38 
 
 
265 aa  49.7  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.139825  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6224  endo-1,3-1,4-beta-glycanase, C-terminal secretion signal protein  29.46 
 
 
475 aa  50.4  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.380521  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0886  hypothetical protein  25.43 
 
 
2113 aa  49.3  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0583  putative Ig  46.3 
 
 
1055 aa  48.9  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4728  endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.26 
 
 
2346 aa  48.5  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4725  polymorphic membrane protein  45.61 
 
 
1037 aa  48.5  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.708929  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1897  Nidogen, extracellular region  51.06 
 
 
1557 aa  48.1  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3808  outer membrane adhesin like proteiin  51.02 
 
 
2524 aa  48.1  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000355585 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0430  metallophosphoesterase  63.89 
 
 
2701 aa  48.1  0.0005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0436  putative outer membrane adhesin like proteiin  52.08 
 
 
5787 aa  47.8  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0188  hypothetical protein  45.68 
 
 
9030 aa  47.4  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0220008 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3709  hemolysin-type calcium-binding region  36.36 
 
 
2704 aa  47.4  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.406778 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0313  putative outer membrane adhesin like proteiin  62.86 
 
 
4836 aa  47.4  0.0009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.971398 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1215  type 1 secretion target domain protein  47.92 
 
 
2542 aa  47.4  0.0009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0168  surface adhesion protein, putative  44.44 
 
 
8682 aa  47  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.810778 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3059  hemolysin-type calcium-binding region:peptidase M10A and M12B, matrixin and adamalysin  54.76 
 
 
535 aa  46.6  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3855  hemolysin-type calcium-binding protein  50 
 
 
1029 aa  47  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.460711  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4185  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  50 
 
 
1029 aa  47  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.610735 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3886  hemolysin-type calcium-binding region  42.47 
 
 
540 aa  46.6  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.559219  normal  0.150584 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4254  Hemolysin-type calcium-binding region  42.47 
 
 
540 aa  47  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.129402  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3060  von Willebrand factor type A  62.86 
 
 
4678 aa  46.6  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0133  von Willebrand factor, type A  50 
 
 
5218 aa  46.2  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.809343 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0384  hypothetical protein  51.16 
 
 
4285 aa  46.2  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3435  hemolysin-type calcium-binding region  32.5 
 
 
219 aa  45.8  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.489484  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1441  Ig family protein  35.38 
 
 
2245 aa  46.2  0.002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.195412  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0186  hypothetical protein  50 
 
 
6753 aa  45.8  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.306412 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5060  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  46.43 
 
 
5962 aa  46.2  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.943676 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1161  Hemolysin-type calcium-binding region  40.58 
 
 
2537 aa  46.2  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2246  VCBS  60 
 
 
5769 aa  45.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0722  hemolysin-type calcium-binding region  31.93 
 
 
851 aa  45.4  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0122  hemolysin-type calcium-binding region  44.62 
 
 
534 aa  45.1  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.589398  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  56.41 
 
 
2105 aa  45.1  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0632  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  50 
 
 
1415 aa  45.1  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4084  mannuronan C-5-epimerase, putative  52.17 
 
 
1610 aa  44.7  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.202459  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0082  hypothetical protein  27.75 
 
 
295 aa  44.7  0.006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.590083  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4357  Hemolysin-type calcium-binding region  41.1 
 
 
546 aa  44.3  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>