76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1201 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1201  type I secretion target GGXGXDXXX repeat-containing protein  100 
 
 
377 aa  754    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.12617  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1186  type I secretion target GGXGXDXXX repeat-containing protein  54.72 
 
 
618 aa  301  1e-80  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1199  hemolysin-type calcium binding protein  56.04 
 
 
532 aa  207  2e-52  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.506347  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0594  type I secretion target GGXGXDXXX repeat-containing protein  48.94 
 
 
466 aa  156  7e-37  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.353541  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0597  ApxIVA Var3  34.42 
 
 
548 aa  152  1e-35  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1189  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  37.02 
 
 
233 aa  118  9.999999999999999e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.730459  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0589  peptidase M10A and M12B, matrixin and adamalysin  65.88 
 
 
288 aa  110  5e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.340966  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0586  hypothetical protein  32.83 
 
 
225 aa  88.6  2e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0991  hypothetical protein  45.69 
 
 
679 aa  79.7  0.00000000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1191  ApxIVA Var3  37.32 
 
 
428 aa  79  0.0000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.171556  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  44.17 
 
 
4798 aa  75.9  0.000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0994  hypothetical protein  43.97 
 
 
585 aa  72.8  0.000000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0997  hypothetical protein  43.97 
 
 
582 aa  72  0.00000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1438  type I secretion target GGXGXDXXX repeat-containing protein  41.56 
 
 
677 aa  70.5  0.00000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.191778  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1194  type I secretion target GGXGXDXXX repeat-containing protein  41.56 
 
 
928 aa  69.7  0.00000000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1000  Hemolysin-type calcium-binding region  33.77 
 
 
844 aa  57.8  0.0000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.862975  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03672  putative hemolysin-type calcium-binding protein  43.94 
 
 
589 aa  56.2  0.0000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0340906 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1897  Nidogen, extracellular region  53.19 
 
 
1557 aa  50.8  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4728  endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.26 
 
 
2346 aa  51.6  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4357  Hemolysin-type calcium-binding region  40.23 
 
 
546 aa  49.7  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0583  putative Ig  46.3 
 
 
1055 aa  49.3  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4004  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.33 
 
 
2239 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.328168  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1215  type 1 secretion target domain protein  32.26 
 
 
2542 aa  48.1  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4254  Hemolysin-type calcium-binding region  42.47 
 
 
540 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.129402  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3886  hemolysin-type calcium-binding region  42.47 
 
 
540 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.559219  normal  0.150584 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4098  outer membrane adhesin like proteiin  34.06 
 
 
6662 aa  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3808  outer membrane adhesin like proteiin  56.41 
 
 
2524 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000355585 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5060  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  50 
 
 
5962 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.943676 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0168  surface adhesion protein, putative  50 
 
 
8682 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.810778 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0188  hypothetical protein  52.08 
 
 
9030 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0220008 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3982  putative outer membrane adhesin like proteiin  34.06 
 
 
6683 aa  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3905  outer membrane adhesin like proteiin  34.06 
 
 
6779 aa  47.8  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0122  hemolysin-type calcium-binding region  44.93 
 
 
534 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.589398  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  56.41 
 
 
2105 aa  47  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3548  glycoside hydrolase family 16  48.89 
 
 
486 aa  47  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2715  VCBS  46.67 
 
 
3026 aa  46.6  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1161  Hemolysin-type calcium-binding region  28.42 
 
 
2537 aa  46.6  0.0007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4725  polymorphic membrane protein  40 
 
 
1037 aa  46.6  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.708929  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3709  hemolysin-type calcium-binding region  38.36 
 
 
2704 aa  46.6  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.406778 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0186  hypothetical protein  50 
 
 
6753 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.306412 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3615  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.17 
 
 
868 aa  45.4  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.705484  normal  0.0425486 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4185  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  41.43 
 
 
1029 aa  46.2  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.610735 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3855  hemolysin-type calcium-binding protein  41.43 
 
 
1029 aa  46.2  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.460711  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20961  hemolysin-type calcium-binding domain-containing protein  33.33 
 
 
2082 aa  46.2  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0436  putative outer membrane adhesin like proteiin  50 
 
 
5787 aa  45.4  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  55.56 
 
 
1279 aa  45.1  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  56.41 
 
 
1795 aa  45.1  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3089  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  37.38 
 
 
2689 aa  45.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.470754 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4084  mannuronan C-5-epimerase, putative  50 
 
 
1610 aa  45.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.202459  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1349  hemolysin-type calcium-binding region  42.86 
 
 
744 aa  45.1  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.156878  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0384  hypothetical protein  65.52 
 
 
4285 aa  44.7  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  45.28 
 
 
1019 aa  45.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4711  putative secreted calcium-binding protein  51.85 
 
 
219 aa  45.1  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.779916  normal  0.14825 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3435  hemolysin-type calcium-binding region  38.71 
 
 
219 aa  45.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.489484  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0722  hemolysin-type calcium-binding region  53.66 
 
 
851 aa  44.7  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1441  Ig family protein  47.06 
 
 
2245 aa  44.3  0.003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.195412  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  46.77 
 
 
2954 aa  44.3  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3059  hemolysin-type calcium-binding region:peptidase M10A and M12B, matrixin and adamalysin  27.07 
 
 
535 aa  44.3  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0313  putative outer membrane adhesin like proteiin  62.86 
 
 
4836 aa  44.7  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.971398 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  58.54 
 
 
1855 aa  44.7  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0380  VCBS  46.51 
 
 
1586 aa  44.3  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.101859  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0594  von Willebrand factor, type A  48.84 
 
 
686 aa  44.3  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.855968  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0274  Hemolysin-type calcium-binding region  35.42 
 
 
232 aa  44.3  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3823  putative hemolysin-type calcium-binding region  50 
 
 
1610 aa  43.9  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00466543 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1666  von Willebrand factor type A  52.17 
 
 
1232 aa  43.9  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.854406  normal  0.168302 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3060  von Willebrand factor type A  60 
 
 
4678 aa  43.5  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1710  hemolysin-type calcium-binding region  44.23 
 
 
1582 aa  43.1  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  44.23 
 
 
1883 aa  43.5  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33710  Secreted mannuronan C5-epimerase  32.29 
 
 
998 aa  43.1  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4079  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  46.3 
 
 
485 aa  43.1  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.237943  normal  0.0279439 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2246  VCBS  57.14 
 
 
5769 aa  43.1  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2298  hemolysin-type calcium binding protein  38.18 
 
 
1480 aa  43.1  0.008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.880239  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4705  peptidase M10A and M12B, matrixin and adamalysin  41.94 
 
 
1133 aa  43.1  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0427656 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3353  heme peroxidase  47.73 
 
 
3608 aa  43.1  0.009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4884  serralysin  32.73 
 
 
727 aa  42.7  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0133  von Willebrand factor, type A  33.33 
 
 
5218 aa  42.7  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.809343 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>