31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1189 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1189  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  100 
 
 
233 aa  466  9.999999999999999e-131  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.730459  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0597  ApxIVA Var3  98.69 
 
 
548 aa  452  1.0000000000000001e-126  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1201  type I secretion target GGXGXDXXX repeat-containing protein  37.02 
 
 
377 aa  118  6e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.12617  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0594  type I secretion target GGXGXDXXX repeat-containing protein  44.44 
 
 
466 aa  94  2e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.353541  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1199  hemolysin-type calcium binding protein  32.81 
 
 
532 aa  88.6  7e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.506347  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0589  peptidase M10A and M12B, matrixin and adamalysin  57.83 
 
 
288 aa  83.6  0.000000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.340966  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1186  type I secretion target GGXGXDXXX repeat-containing protein  53.66 
 
 
618 aa  78.2  0.0000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0991  hypothetical protein  60.32 
 
 
679 aa  60.8  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0994  hypothetical protein  58.73 
 
 
585 aa  58.2  0.0000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0997  hypothetical protein  58.73 
 
 
582 aa  57.8  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0586  hypothetical protein  33.85 
 
 
225 aa  53.5  0.000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  58.33 
 
 
4798 aa  52.4  0.000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03672  putative hemolysin-type calcium-binding protein  49.15 
 
 
589 aa  50.4  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0340906 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1000  Hemolysin-type calcium-binding region  53.19 
 
 
844 aa  46.2  0.0005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.862975  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0188  hypothetical protein  55.56 
 
 
9030 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0220008 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0133  von Willebrand factor, type A  55.56 
 
 
5218 aa  45.1  0.0009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.809343 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0168  surface adhesion protein, putative  55.56 
 
 
8682 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.810778 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0186  hypothetical protein  55.56 
 
 
6753 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.306412 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5060  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  53.33 
 
 
5962 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.943676 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0798  hypothetical protein  52.83 
 
 
1538 aa  44.3  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1349  hemolysin-type calcium-binding region  49.09 
 
 
744 aa  43.1  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.156878  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  49.15 
 
 
1883 aa  43.5  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0158  Hemolysin-type calcium-binding protein  61.54 
 
 
1145 aa  43.1  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0055  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  54.35 
 
 
3314 aa  42.7  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3709  hemolysin-type calcium-binding region  64.71 
 
 
2704 aa  42.7  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.406778 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  55.1 
 
 
1019 aa  42.7  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  48.44 
 
 
3954 aa  42.4  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0745  hypothetical protein  54.29 
 
 
615 aa  42  0.009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.676987  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1512  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  33.33 
 
 
2107 aa  41.6  0.01  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.821841  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3823  putative hemolysin-type calcium-binding region  60 
 
 
1610 aa  41.6  0.01  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00466543 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2246  VCBS  40 
 
 
5769 aa  41.6  0.01  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>