71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0597 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0597  ApxIVA Var3  100 
 
 
548 aa  1091    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1191  ApxIVA Var3  94.02 
 
 
428 aa  615  1e-175  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.171556  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1189  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  98.69 
 
 
233 aa  452  1.0000000000000001e-126  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.730459  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0594  type I secretion target GGXGXDXXX repeat-containing protein  51.02 
 
 
466 aa  379  1e-104  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.353541  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1199  hemolysin-type calcium binding protein  43.41 
 
 
532 aa  337  2.9999999999999997e-91  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.506347  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1194  type I secretion target GGXGXDXXX repeat-containing protein  47.53 
 
 
928 aa  276  5e-73  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1186  type I secretion target GGXGXDXXX repeat-containing protein  43.46 
 
 
618 aa  268  1e-70  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1438  type I secretion target GGXGXDXXX repeat-containing protein  43.98 
 
 
677 aa  223  4.9999999999999996e-57  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.191778  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1201  type I secretion target GGXGXDXXX repeat-containing protein  34.42 
 
 
377 aa  151  3e-35  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.12617  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1433  hypothetical protein  65.42 
 
 
320 aa  135  1.9999999999999998e-30  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0949231  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1648  hemolysin-type calcium binding protein  44.7 
 
 
940 aa  107  4e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1592  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  43.94 
 
 
1789 aa  107  8e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1000  Hemolysin-type calcium-binding region  29.34 
 
 
844 aa  105  2e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.862975  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0327  hemolysin-type calcium binding protein  44.19 
 
 
1814 aa  103  5e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0391395  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1512  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  44.44 
 
 
2107 aa  102  2e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.821841  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0997  hypothetical protein  46.27 
 
 
582 aa  100  7e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1250  hypothetical protein  43.08 
 
 
541 aa  99  2e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  42.86 
 
 
4798 aa  97.4  5e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2550  putative outer membrane adhesin like protein  39.85 
 
 
3598 aa  97.1  8e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6773  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  45.67 
 
 
1925 aa  96.3  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395302  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06448  hemolysin A  38.35 
 
 
1112 aa  95.1  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06446  hypothetical protein  40.15 
 
 
959 aa  94.7  4e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  42.22 
 
 
1499 aa  94.4  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2298  hemolysin-type calcium binding protein  41.04 
 
 
1480 aa  94  6e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.880239  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  40.31 
 
 
4687 aa  94  7e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2204  peptidase M23  40.3 
 
 
999 aa  92.8  2e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0994  hypothetical protein  42.11 
 
 
585 aa  92.4  2e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0991  hypothetical protein  41.35 
 
 
679 aa  92  2e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0299  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  44.76 
 
 
1607 aa  89.7  1e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2962  hypothetical protein  37.39 
 
 
326 aa  87  8e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0055172  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1963  hypothetical protein  39.44 
 
 
1306 aa  84  0.000000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1754  large exoprotein involved in heme utilization or adhesion  35.16 
 
 
1809 aa  83.6  0.000000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0481615 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0589  peptidase M10A and M12B, matrixin and adamalysin  53.49 
 
 
288 aa  79  0.0000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.340966  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0104  putative hemolysin-type calcium-binding protein  36.72 
 
 
960 aa  77.4  0.0000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4716  hypothetical protein  36.3 
 
 
337 aa  75.1  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.147365 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1572  bacteriocin  44.94 
 
 
435 aa  71.2  0.00000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.301349  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0050  hemolysin-type calcium-binding region  36.43 
 
 
2296 aa  70.5  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.133604 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4924  serine protease  33.59 
 
 
1805 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1931  hypothetical protein  26.95 
 
 
354 aa  67  0.0000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.349657  normal  0.547729 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0591  hypothetical protein  53.23 
 
 
93 aa  66.2  0.000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.813935  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0885  hypothetical protein  32.03 
 
 
788 aa  65.9  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.854858  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0588  hypothetical protein  53.23 
 
 
93 aa  66.2  0.000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.26826  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0822  membrane protein  33.07 
 
 
310 aa  65.1  0.000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000142099  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3833  hypothetical protein  35.16 
 
 
364 aa  64.7  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0371  hypothetical protein  37.39 
 
 
345 aa  64.3  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4242  hemolysin-type calcium-binding protein  34.52 
 
 
1544 aa  63.9  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1995  hypothetical protein  32.14 
 
 
371 aa  63.9  0.000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.153544  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0768  hypothetical protein  36.11 
 
 
346 aa  62.8  0.00000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000331369  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1018  hypothetical protein  31.75 
 
 
2767 aa  63.5  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.556407 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0514  hypothetical protein  34.21 
 
 
351 aa  62.4  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.241085  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0332  membrane protein  36.36 
 
 
422 aa  61.6  0.00000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.797962  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0927  hypothetical protein  30.23 
 
 
351 aa  62  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0034  hypothetical protein  33.05 
 
 
327 aa  60.8  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.749355 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2746  hypothetical protein  31.48 
 
 
359 aa  60.5  0.00000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  39.81 
 
 
3209 aa  58.5  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0082  hypothetical protein  35.19 
 
 
295 aa  55.8  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.590083  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0586  hypothetical protein  33.85 
 
 
225 aa  54.3  0.000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1901  hypothetical protein  27.54 
 
 
435 aa  52.4  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03672  putative hemolysin-type calcium-binding protein  46.97 
 
 
589 aa  52  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0340906 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2201  hypothetical protein  43.08 
 
 
265 aa  50.4  0.00008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.139825  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0168  surface adhesion protein, putative  35.97 
 
 
8682 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.810778 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0188  hypothetical protein  35.97 
 
 
9030 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0220008 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0186  hypothetical protein  37.76 
 
 
6753 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.306412 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2875  hypothetical protein  28.7 
 
 
435 aa  47.8  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.140163  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5060  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  36.59 
 
 
5962 aa  46.2  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.943676 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0133  von Willebrand factor, type A  64.52 
 
 
5218 aa  45.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.809343 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  51.85 
 
 
1883 aa  45.1  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3709  hemolysin-type calcium-binding region  64.71 
 
 
2704 aa  44.7  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.406778 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3808  outer membrane adhesin like proteiin  33.08 
 
 
2524 aa  44.7  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000355585 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0798  hypothetical protein  52.83 
 
 
1538 aa  43.5  0.009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0055  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  48.44 
 
 
3314 aa  43.5  0.009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>