56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2962 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2962  hypothetical protein  100 
 
 		 326 aa  647    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0055172  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0514  hypothetical protein  37.86 
 
 		 351 aa  122  9.999999999999999e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.241085  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0927  hypothetical protein  34.03 
 
 		 351 aa  117  3e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1648  hemolysin-type calcium binding protein  39.49 
 
 		 940 aa  114  3e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1592  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  38.83 
 
 		 1789 aa  113  4.0000000000000004e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1995  hypothetical protein  40.61 
 
 		 371 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.153544  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06446  hypothetical protein  37.35 
 
 		 959 aa  107  4e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0768  hypothetical protein  32.52 
 
 		 346 aa  106  6e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000331369  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0332  membrane protein  45.67 
 
 		 422 aa  103  3e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.797962  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1931  hypothetical protein  42.34 
 
 		 354 aa  100  4e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.349657  normal  0.547729 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3833  hypothetical protein  40.62 
 
 		 364 aa  100  5e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06448  hemolysin A  42.47 
 
 		 1112 aa  100  5e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0327  hemolysin-type calcium binding protein  38.46 
 
 		 1814 aa  99.8  6e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0391395  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2875  hypothetical protein  37.34 
 
 		 435 aa  98.6  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.140163  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1512  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  38.46 
 
 		 2107 aa  98.6  1e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.821841  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0822  membrane protein  34.08 
 
 		 310 aa  98.2  2e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000142099  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1186  type I secretion target GGXGXDXXX repeat-containing protein  34.09 
 
 		 618 aa  95.9  7e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  39.16 
 
 		 1499 aa  94.7  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1191  ApxIVA Var3  33.33 
 
 		 428 aa  94  4e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.171556  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0371  hypothetical protein  37.24 
 
 		 345 aa  91.7  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1194  type I secretion target GGXGXDXXX repeat-containing protein  38.05 
 
 		 928 aa  90.5  4e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1438  type I secretion target GGXGXDXXX repeat-containing protein  38.39 
 
 		 677 aa  89  1e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.191778  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1901  hypothetical protein  39.57 
 
 		 435 aa  87.8  2e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2204  peptidase M23  41.03 
 
 		 999 aa  87.4  3e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2746  hypothetical protein  31.91 
 
 		 359 aa  87.4  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2298  hemolysin-type calcium binding protein  44.14 
 
 		 1480 aa  87.4  3e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.880239  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1754  large exoprotein involved in heme utilization or adhesion  36.53 
 
 		 1809 aa  86.7  5e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0481615 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0597  ApxIVA Var3  37.61 
 
 		 548 aa  86.3  6e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2550  putative outer membrane adhesin like protein  38.37 
 
 		 3598 aa  86.7  6e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1250  hypothetical protein  32.97 
 
 		 541 aa  86.3  6e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1199  hemolysin-type calcium binding protein  37.5 
 
 		 532 aa  85.1  0.000000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.506347  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  31.66 
 
 		 4687 aa  84.7  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1433  hypothetical protein  40.19 
 
 		 320 aa  84.7  0.000000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0949231  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0594  type I secretion target GGXGXDXXX repeat-containing protein  36.28 
 
 		 466 aa  84.7  0.000000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.353541  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0299  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  35.5 
 
 		 1607 aa  83.2  0.000000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1000  Hemolysin-type calcium-binding region  34.59 
 
 		 844 aa  82.4  0.00000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.862975  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0991  hypothetical protein  34.32 
 
 		 679 aa  81.6  0.00000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0994  hypothetical protein  35.29 
 
 		 585 aa  78.6  0.0000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0034  hypothetical protein  31.75 
 
 		 327 aa  78.2  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.749355 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  32.34 
 
 		 4798 aa  77.4  0.0000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0997  hypothetical protein  34.78 
 
 		 582 aa  75.5  0.000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0082  hypothetical protein  31.84 
 
 		 295 aa  72  0.00000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.590083  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6773  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  31.85 
 
 		 1925 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1963  hypothetical protein  33.74 
 
 		 1306 aa  71.2  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4924  serine protease  34.03 
 
 		 1805 aa  69.3  0.00000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1572  bacteriocin  47.5 
 
 		 435 aa  68.2  0.0000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.301349  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0050  hemolysin-type calcium-binding region  31.25 
 
 		 2296 aa  66.2  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.133604 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0571  hypothetical protein  29.63 
 
 		 2682 aa  65.9  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0104  putative hemolysin-type calcium-binding protein  39.05 
 
 		 960 aa  63.5  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1018  hypothetical protein  31.9 
 
 		 2767 aa  63.2  0.000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.556407 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0886  hypothetical protein  31.87 
 
 		 2113 aa  58.5  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4716  hypothetical protein  34.29 
 
 		 337 aa  55.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.147365 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2201  hypothetical protein  47.22 
 
 		 265 aa  53.9  0.000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.139825  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3695  proprotein convertase P  27.78 
 
 		 2911 aa  49.7  0.00006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.523637 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0885  hypothetical protein  27.72 
 
 		 788 aa  47  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.854858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  28 
 
 		 3209 aa  45.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>