54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0571 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0571  hypothetical protein  100 
 
 		 2682 aa  5135    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0886  hypothetical protein  36.86 
 
 		 2113 aa  741    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  37.5 
 
 		 4687 aa  103  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1018  hypothetical protein  37.5 
 
 		 2767 aa  103  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.556407 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0885  hypothetical protein  38.38 
 
 		 788 aa  100  6e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.854858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1648  hemolysin-type calcium binding protein  40.96 
 
 		 940 aa  92.8  8e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1592  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  40.96 
 
 		 1789 aa  92.8  9e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06446  hypothetical protein  31.25 
 
 		 959 aa  89.7  8e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  39.05 
 
 		 4798 aa  88.2  0.000000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1250  hypothetical protein  39.29 
 
 		 541 aa  87.4  0.000000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1000  Hemolysin-type calcium-binding region  39.05 
 
 		 844 aa  87.4  0.000000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.862975  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4242  hemolysin-type calcium-binding protein  30.2 
 
 		 1544 aa  87.8  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0991  hypothetical protein  38.46 
 
 		 679 aa  85.1  0.00000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1512  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  37.93 
 
 		 2107 aa  80.9  0.0000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.821841  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0327  hemolysin-type calcium binding protein  37.93 
 
 		 1814 aa  80.9  0.0000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0391395  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6773  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  37.95 
 
 		 1925 aa  79  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3027  hypothetical protein  44.44 
 
 		 1278 aa  75.9  0.000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0994  hypothetical protein  39.26 
 
 		 585 aa  75.9  0.00000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1754  large exoprotein involved in heme utilization or adhesion  35.06 
 
 		 1809 aa  72  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0481615 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  38.46 
 
 		 2775 aa  70.5  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2550  putative outer membrane adhesin like protein  32.57 
 
 		 3598 aa  69.7  0.0000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0997  hypothetical protein  37.78 
 
 		 582 aa  68.9  0.000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0804  hemolysin-type calcium-binding region  37.18 
 
 		 2885 aa  67.4  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6493  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  39 
 
 		 1102 aa  67  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3695  proprotein convertase P  31.03 
 
 		 2911 aa  66.6  0.000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.523637 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0299  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  36.84 
 
 		 1607 aa  66.2  0.000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  35.8 
 
 		 1499 aa  65.5  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  35.9 
 
 		 2667 aa  65.1  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2962  hypothetical protein  29.17 
 
 		 326 aa  64.7  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0055172  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  35.9 
 
 		 1236 aa  64.3  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  30.06 
 
 		 3209 aa  63.9  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06448  hemolysin A  34.81 
 
 		 1112 aa  63.9  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6671  hypothetical protein  29.82 
 
 		 755 aa  62.8  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.538949  normal  0.529559 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2298  hemolysin-type calcium binding protein  34.59 
 
 		 1480 aa  62  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.880239  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1963  hypothetical protein  31.79 
 
 		 1306 aa  60.5  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2204  peptidase M23  34.59 
 
 		 999 aa  60.5  0.0000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1186  type I secretion target GGXGXDXXX repeat-containing protein  31.64 
 
 		 618 aa  58.5  0.000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4716  hypothetical protein  35.64 
 
 		 337 aa  58.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.147365 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  37.97 
 
 		 980 aa  56.6  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5716  CHRD domain containing protein  39.24 
 
 		 460 aa  55.1  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8151  CHRD domain containing protein  39.24 
 
 		 460 aa  54.7  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.159577  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0281  protein of unknown function DUF839  36.71 
 
 		 686 aa  53.9  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0484  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  36.71 
 
 		 2668 aa  52.8  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7343  Hemolysin-type calcium-binding region  39.24 
 
 		 615 aa  52.4  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4802  glycoside hydrolase family protein  33.75 
 
 		 907 aa  52.8  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.609138 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7966  Hemolysin-type calcium-binding region  36.71 
 
 		 341 aa  51.2  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1569  Hemolysin-type calcium-binding region  36.71 
 
 		 341 aa  51.6  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.722713  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.56 
 
 		 1795 aa  50.4  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  30.37 
 
 		 2105 aa  50.8  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7154  hypothetical protein  28.81 
 
 		 2039 aa  48.5  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6816  Hemolysin-type calcium-binding region  35.44 
 
 		 526 aa  48.5  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3385  hypothetical protein  36.59 
 
 		 1792 aa  47.8  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.477011 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4609  Hemolysin-type calcium-binding region  37.18 
 
 		 480 aa  47.8  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1025  hypothetical protein  31.79 
 
 		 197 aa  46.2  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.579242  hitchhiker  0.0008545 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>