51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1995 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_1995  hypothetical protein  100 
 
 
371 aa  750    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.153544  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0927  hypothetical protein  43.67 
 
 
351 aa  313  1.9999999999999998e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3833  hypothetical protein  43.12 
 
 
364 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2746  hypothetical protein  41.91 
 
 
359 aa  298  1e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0371  hypothetical protein  40.69 
 
 
345 aa  256  5e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0768  hypothetical protein  38.01 
 
 
346 aa  240  2e-62  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000331369  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0514  hypothetical protein  38.98 
 
 
351 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.241085  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1931  hypothetical protein  39.44 
 
 
354 aa  229  8e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.349657  normal  0.547729 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0034  hypothetical protein  44.3 
 
 
327 aa  190  2.9999999999999997e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.749355 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0332  membrane protein  44.44 
 
 
422 aa  184  3e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.797962  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2875  hypothetical protein  40.67 
 
 
435 aa  167  2e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.140163  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0822  membrane protein  41.89 
 
 
310 aa  160  3e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000142099  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1901  hypothetical protein  38.83 
 
 
435 aa  149  5e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0082  hypothetical protein  32.86 
 
 
295 aa  142  9.999999999999999e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.590083  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2962  hypothetical protein  40.61 
 
 
326 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0055172  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06446  hypothetical protein  36.47 
 
 
959 aa  89.4  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6773  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  35.4 
 
 
1925 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395302  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06448  hemolysin A  36.54 
 
 
1112 aa  74.3  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1648  hemolysin-type calcium binding protein  33.52 
 
 
940 aa  71.2  0.00000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1592  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  34.09 
 
 
1789 aa  69.7  0.00000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2550  putative outer membrane adhesin like protein  33.33 
 
 
3598 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0997  hypothetical protein  38.1 
 
 
582 aa  68.9  0.0000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  33.33 
 
 
4687 aa  68.2  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1194  type I secretion target GGXGXDXXX repeat-containing protein  36.7 
 
 
928 aa  67.8  0.0000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0594  type I secretion target GGXGXDXXX repeat-containing protein  35.78 
 
 
466 aa  66.2  0.0000000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.353541  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1000  Hemolysin-type calcium-binding region  34.62 
 
 
844 aa  66.2  0.0000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.862975  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  36.54 
 
 
4798 aa  65.9  0.000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1754  large exoprotein involved in heme utilization or adhesion  31.14 
 
 
1809 aa  66.2  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0481615 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1250  hypothetical protein  33.65 
 
 
541 aa  65.9  0.000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1438  type I secretion target GGXGXDXXX repeat-containing protein  37.74 
 
 
677 aa  65.5  0.000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.191778  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1199  hemolysin-type calcium binding protein  36.79 
 
 
532 aa  65.5  0.000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.506347  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  35.19 
 
 
1499 aa  64.7  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1191  ApxIVA Var3  33.91 
 
 
428 aa  64.3  0.000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.171556  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2204  peptidase M23  31.29 
 
 
999 aa  64.3  0.000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0597  ApxIVA Var3  33.33 
 
 
548 aa  63.5  0.000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4716  hypothetical protein  37.76 
 
 
337 aa  63.2  0.000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.147365 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2298  hemolysin-type calcium binding protein  33.94 
 
 
1480 aa  63.2  0.000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.880239  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0994  hypothetical protein  34.29 
 
 
585 aa  61.6  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0991  hypothetical protein  35.58 
 
 
679 aa  62  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1186  type I secretion target GGXGXDXXX repeat-containing protein  31.07 
 
 
618 aa  60.8  0.00000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1433  hypothetical protein  37.08 
 
 
320 aa  59.7  0.00000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0949231  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1572  bacteriocin  37.5 
 
 
435 aa  57  0.0000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.301349  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1963  hypothetical protein  33.63 
 
 
1306 aa  56.6  0.0000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0327  hemolysin-type calcium binding protein  30.17 
 
 
1814 aa  56.6  0.0000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0391395  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1512  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  30.34 
 
 
2107 aa  53.5  0.000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.821841  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0104  putative hemolysin-type calcium-binding protein  32.08 
 
 
960 aa  53.9  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0299  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  30.97 
 
 
1607 aa  51.6  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1018  hypothetical protein  29.91 
 
 
2767 aa  47.4  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.556407 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4924  serine protease  26.67 
 
 
1805 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  24.54 
 
 
3209 aa  45.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4242  hemolysin-type calcium-binding protein  30.36 
 
 
1544 aa  43.5  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>