75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0753 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_0753  hypothetical protein  100 
 
 		 294 aa  580  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.445777  normal  0.242223 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0830  hypothetical protein  92.12 
 
 		 294 aa  537  9.999999999999999e-153  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.398779 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0790  hypothetical protein  92.47 
 
 		 294 aa  536  1e-151  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.047306 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1212  hypothetical protein  39.36 
 
 		 305 aa  203  3e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.760628 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0906  glycosyl transferase family 2  43.92 
 
 		 1152 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0933  glycosyl transferase family 2  42.57 
 
 		 1152 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1253  glycosyl transferase family 2  45.83 
 
 		 1067 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1250  hypothetical protein  42.75 
 
 		 849 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1576  glycosyl transferase family 2  38.69 
 
 		 746 aa  97.8  2e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3634  glycosyl transferase group 1  47.29 
 
 		 1044 aa  96.7  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.578618  normal  0.0749406 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1690  beta strand repeat-containing protein  43.66 
 
 		 1632 aa  90.1  4e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.638042 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2009  autotransporter-associated beta strand repeat protein  42.96 
 
 		 1806 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.979207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4336  Lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  43.24 
 
 		 1366 aa  85.9  8e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.350964  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2372  5'-Nucleotidase domain protein  43.64 
 
 		 2796 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.308667 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3986  glycosyl transferase group 1  35.36 
 
 		 535 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.530691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6327  glycosyl transferase family 2  34.72 
 
 		 872 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0108  Animal heme peroxidase  41.96 
 
 		 2342 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2502  Hemolysin-type calcium-binding region  40.98 
 
 		 361 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.263018  normal  0.592505 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4829  Animal heme peroxidase  41.96 
 
 		 2342 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6712  glycosyl transferase group 1  44.86 
 
 		 665 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2570  hemolysin-type calcium-binding region  41.74 
 
 		 361 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.804479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3229  lipolytic enzyme, G-D-S-L  37.01 
 
 		 418 aa  79  0.00000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0911391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2793  Hemolysin-type calcium-binding region  40.87 
 
 		 361 aa  79  0.00000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0234899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3988  hypothetical protein  40.56 
 
 		 521 aa  77  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.28439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2715  glycosyl transferase family 2  40.18 
 
 		 756 aa  76.6  0.0000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1525  glycosyl transferase family 2  35.54 
 
 		 857 aa  75.5  0.0000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3992  glycosyl transferase family 2  31.3 
 
 		 1317 aa  73.2  0.000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.33593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5645  hypothetical protein  51.28 
 
 		 227 aa  73.2  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0214795  normal  0.245514 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6737  hypothetical protein  55.56 
 
 		 115 aa  73.2  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4307  Glycosyltransferase-like protein  42.5 
 
 		 597 aa  72.8  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0615  glycosyl transferase, group 1  40.54 
 
 		 1247 aa  72.4  0.000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  unclonable  0.00376413  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1218  hypothetical protein  32.91 
 
 		 518 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3964  glycosyl transferase group 1  28.86 
 
 		 1264 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2010  hypothetical protein  40.35 
 
 		 678 aa  71.2  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6498  hypothetical protein  53.97 
 
 		 120 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0526987  hitchhiker  0.0078002 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2175  glycosyl transferase family 2  46.84 
 
 		 995 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2494  glycosyl transferase family 2  45.57 
 
 		 1059 aa  70.1  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2218  glycosyl transferase family protein  45.57 
 
 		 1035 aa  70.1  0.00000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.966726 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0516  hypothetical protein  45.21 
 
 		 592 aa  68.9  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3845  hypothetical protein  44.83 
 
 		 355 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.960919  normal  0.369617 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3694  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  31.85 
 
 		 916 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3017  hypothetical protein  44.09 
 
 		 322 aa  63.2  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.044342  normal  0.23339 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0633  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  40 
 
 		 1161 aa  62  0.00000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0724  glycosyl transferase family protein  56.25 
 
 		 680 aa  62  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.647901  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3984  hypothetical protein  47.22 
 
 		 644 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5035  hypothetical protein  41.77 
 
 		 137 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.117326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0558  hypothetical protein  27.85 
 
 		 1880 aa  58.5  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6257  glycosyl transferase family protein  27.38 
 
 		 987 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0286803  normal  0.0257469 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6296  glycosyl transferase family 2  41.33 
 
 		 814 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0007  glycosyl transferase, group 1  37.93 
 
 		 1236 aa  58.2  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2479  glycosyl transferase family protein  31.25 
 
 		 882 aa  57.4  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.524105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0050  hemolysin-type calcium-binding region  35.48 
 
 		 2296 aa  57  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.133604 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4522  hypothetical protein  41.77 
 
 		 137 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.583974 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2036  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  38.67 
 
 		 1162 aa  55.1  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4982  hypothetical protein  41.77 
 
 		 137 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.633346  normal  0.27527 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0774  glycosyl transferase family 2  52.73 
 
 		 1476 aa  54.3  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4882  hypothetical protein  33.72 
 
 		 235 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1576  glycosyl transferase family protein  28.08 
 
 		 1313 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.897283 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4000  hypothetical protein  48.28 
 
 		 399 aa  53.1  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.24228 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4001  glycosyl transferase family protein  40.3 
 
 		 1301 aa  53.1  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.248579 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0037  hemolysin-type calcium-binding region  35.56 
 
 		 830 aa  52.4  0.000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.475959  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3866  glycosyl transferase group 1  42.25 
 
 		 1302 aa  52  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.806044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0030  hemolysin-type calcium-binding region  32.8 
 
 		 462 aa  51.2  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.328921  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2007  hypothetical protein  36.11 
 
 		 513 aa  51.2  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.836412  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1204  glycosyl transferase family protein  37.8 
 
 		 1322 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.221379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2183  glycosyl transferase family protein  37.14 
 
 		 995 aa  50.1  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.610183  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2610  hypothetical protein  32.09 
 
 		 1313 aa  49.3  0.00007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5072  hypothetical protein  32.28 
 
 		 223 aa  49.3  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.133636  normal  0.18429 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3709  hypothetical protein  48.15 
 
 		 255 aa  49.3  0.00008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3918  hypothetical protein  37.66 
 
 		 751 aa  48.5  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4087  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  37.66 
 
 		 751 aa  48.5  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.885758  normal  0.378221 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4197  glycosyl transferase, group 1  35.21 
 
 		 846 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0529  hypothetical protein  26.62 
 
 		 4697 aa  44.3  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1874  cell surface protein  31.9 
 
 		 603 aa  43.5  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.665345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2750  hypothetical protein  39.47 
 
 		 736 aa  42.7  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>