39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2750 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_2750  hypothetical protein  100 
 
 		 736 aa  1511    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3231  hypothetical protein  29.03 
 
 		 423 aa  98.6  4e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3694  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  28.44 
 
 		 916 aa  98.6  4e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0543  hypothetical protein  29.17 
 
 		 431 aa  85.5  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.155137  normal  0.517294 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4336  Lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  27.61 
 
 		 1366 aa  78.2  0.0000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.350964  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3349  glycosyl transferase, group 1  26.46 
 
 		 406 aa  72.4  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0542169  decreased coverage  0.00718656 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1250  hypothetical protein  27.05 
 
 		 849 aa  69.7  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0509  glycosyl transferase family 2  28.04 
 
 		 1075 aa  67.8  0.0000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.253023  normal  0.0268717 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2183  glycosyl transferase family protein  28.89 
 
 		 995 aa  67.8  0.0000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.610183  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4307  Glycosyltransferase-like protein  31.03 
 
 		 597 aa  64.3  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4829  Animal heme peroxidase  27.41 
 
 		 2342 aa  61.6  0.00000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0108  Animal heme peroxidase  27.9 
 
 		 2342 aa  61.2  0.00000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0422  glycosyl transferase family protein  26.55 
 
 		 1297 aa  60.5  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0050  hemolysin-type calcium-binding region  26.67 
 
 		 2296 aa  60.1  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.133604 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3988  hypothetical protein  27.06 
 
 		 521 aa  55.5  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.28439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2009  autotransporter-associated beta strand repeat protein  29.52 
 
 		 1806 aa  54.7  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.979207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2372  5'-Nucleotidase domain protein  28 
 
 		 2796 aa  54.7  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.308667 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1690  beta strand repeat-containing protein  29.52 
 
 		 1632 aa  53.5  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.638042 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1745  glycosyl transferase group 1  27.17 
 
 		 406 aa  53.9  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2744  hypothetical protein  58.14 
 
 		 133 aa  52.8  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3964  glycosyl transferase group 1  21.9 
 
 		 1264 aa  51.6  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3904  hypothetical protein  30.11 
 
 		 413 aa  50.8  0.00009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3634  glycosyl transferase group 1  26.58 
 
 		 1044 aa  50.8  0.00009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.578618  normal  0.0749406 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2268  glycosyl transferase family protein  25.11 
 
 		 1600 aa  50.8  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1576  glycosyl transferase family protein  27.66 
 
 		 1313 aa  49.7  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.897283 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1874  cell surface protein  38.33 
 
 		 603 aa  48.9  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.665345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6712  glycosyl transferase group 1  26.2 
 
 		 665 aa  48.1  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1253  glycosyl transferase family 2  25 
 
 		 1067 aa  47.8  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1525  glycosyl transferase family 2  23.5 
 
 		 857 aa  47  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0030  hemolysin-type calcium-binding region  41.82 
 
 		 462 aa  47  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.328921  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6257  glycosyl transferase family protein  28.93 
 
 		 987 aa  46.2  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0286803  normal  0.0257469 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2715  glycosyl transferase family 2  42.31 
 
 		 756 aa  45.4  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0516  hypothetical protein  31.82 
 
 		 592 aa  45.4  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1218  hypothetical protein  40 
 
 		 518 aa  45.4  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3684  glycosyl transferase group 1  29.76 
 
 		 1400 aa  45.1  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2036  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  21.71 
 
 		 1162 aa  45.4  0.004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0906  glycosyl transferase family 2  35.8 
 
 		 1152 aa  45.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4803  glycosyl transferase group 1  26.12 
 
 		 438 aa  45.1  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.70984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0933  glycosyl transferase family 2  35.8 
 
 		 1152 aa  45.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>