More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2999 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2999  methyltransferase type 11  100 
 
 		 246 aa  491  9.999999999999999e-139  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0921858  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1474  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  57.72 
 
 		 255 aa  278  7e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.760771  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0807  type 11 methyltransferase  55.69 
 
 		 245 aa  276  3e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.887141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4470  Methyltransferase type 11  59.75 
 
 		 252 aa  268  5e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.09133  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3989  Methyltransferase type 11  56.07 
 
 		 249 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.169635  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0994  methyltransferase type 11  54.81 
 
 		 245 aa  259  2e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.295346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3743  methyltransferase type 11  54.17 
 
 		 331 aa  258  9e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0264  Methyltransferase type 11  55.06 
 
 		 252 aa  256  3e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.767056 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2465  hypothetical protein  55.87 
 
 		 246 aa  255  4e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.16743  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0241  methyltransferase type 11  56.38 
 
 		 255 aa  247  1e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.114576 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0427  methyltransferase type 11  53.09 
 
 		 255 aa  239  4e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0100064  normal  0.299487 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10226  methyltransferase  53.31 
 
 		 254 aa  237  2e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0401  Methyltransferase type 11  53.14 
 
 		 257 aa  235  5.0000000000000005e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0218  methyltransferase type 11  52.85 
 
 		 252 aa  234  9e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.679298  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0228  methyltransferase type 11  52.85 
 
 		 252 aa  234  9e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.237973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0208  methyltransferase type 11  52.44 
 
 		 252 aa  233  3e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1168  Methyltransferase type 11  43 
 
 		 267 aa  64.7  0.000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0742  type 11 methyltransferase  36.23 
 
 		 266 aa  63.2  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.166057 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1313  biotin biosynthesis protein BioC  37.6 
 
 		 255 aa  62  0.000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.110955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1371  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  32.68 
 
 		 279 aa  61.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0235  Methyltransferase type 11  41.41 
 
 		 242 aa  58.9  0.00000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2374  methyltransferase type 11  30.23 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.404257 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0666  hypothetical protein  33.33 
 
 		 233 aa  58.9  0.00000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.207992  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2842  biotin biosynthesis protein BioC  36.52 
 
 		 267 aa  58.5  0.00000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0498  methyltransferase type 11  26.21 
 
 		 235 aa  58.2  0.0000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0011  methyltransferase type 11  37.74 
 
 		 243 aa  57.8  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30580  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  35.2 
 
 		 272 aa  58.2  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3502  methyltransferase type 11  30.92 
 
 		 225 aa  58.2  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0622401 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1427  biotin synthesis protein BioC  35.85 
 
 		 267 aa  57.8  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1815  methyltransferase type 11  38.6 
 
 		 275 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2929  biotin biosynthesis protein BioC  35.85 
 
 		 267 aa  57.8  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3876  Methyltransferase type 11  34.48 
 
 		 241 aa  56.2  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2880  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  31.76 
 
 		 273 aa  56.2  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8231  methyltransferase type 11  32.58 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2874  type 11 methyltransferase  31.82 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  36.28 
 
 		 255 aa  55.8  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1690  Methyltransferase type 11  36.67 
 
 		 285 aa  55.5  0.0000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0193071 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0636  Methyltransferase type 11  29.52 
 
 		 228 aa  55.5  0.0000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0381586  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0572  hypothetical protein  31.9 
 
 		 243 aa  54.7  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.519811  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5589  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 275 aa  55.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2798  methyltransferase type 11  33.63 
 
 		 249 aa  54.7  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.4443  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0658  Methyltransferase type 11  35.2 
 
 		 233 aa  55.1  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.382141  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0617  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  34.71 
 
 		 232 aa  54.7  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.48837 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2537  biotin biosynthesis protein BioC  36.03 
 
 		 260 aa  54.3  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000300876  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6253  methyltransferase domain-containing protein  26.87 
 
 		 276 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.812952  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2252  methyltransferase type 11  32.06 
 
 		 266 aa  53.9  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1663  methyltransferase type 11  35.05 
 
 		 243 aa  54.3  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.639645  normal  0.0934074 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2139  Methyltransferase type 11  26.09 
 
 		 240 aa  54.3  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0101077 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0630  hypothetical protein  31.9 
 
 		 240 aa  53.1  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5499  Methyltransferase type 11  35.45 
 
 		 196 aa  53.1  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1510  hypothetical protein  35.09 
 
 		 247 aa  53.1  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.702399  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1844  methyltransferase type 11  36.56 
 
 		 415 aa  53.1  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4779  Methyltransferase type 11  35.59 
 
 		 264 aa  53.1  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766265 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3143  hypothetical protein  27.21 
 
 		 216 aa  52.8  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0708214  normal  0.0392147 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1127  Methyltransferase type 11  33.87 
 
 		 246 aa  52.8  0.000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1121  methyltransferase type 11  33.64 
 
 		 293 aa  52.4  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.536452  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0254  Methyltransferase type 11  37.72 
 
 		 273 aa  52.8  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2593  methyltransferase type 11  34.86 
 
 		 238 aa  52.4  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1507  biotin biosynthesis protein BioC  34.92 
 
 		 253 aa  52.8  0.000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000063017  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3815  methyltransferase type 11  28.26 
 
 		 271 aa  52.4  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.577541  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0390  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 239 aa  52.4  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.614689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5480  methyltransferase type 11  31.3 
 
 		 243 aa  52.4  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.690261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5101  methyltransferase type 11  31.3 
 
 		 243 aa  52.4  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0011  methyltransferase type 11  34.86 
 
 		 289 aa  52.4  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5189  methyltransferase type 11  31.3 
 
 		 243 aa  52.4  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0109  methyltransferase type 11  38.54 
 
 		 236 aa  52.4  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1198  Methyltransferase type 11  34.96 
 
 		 272 aa  52  0.000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2962  biotin biosynthesis protein BioC  38.98 
 
 		 253 aa  52  0.000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0381627  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5717  methyltransferase type 11  33.91 
 
 		 241 aa  52.4  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.753035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0972  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.54 
 
 		 233 aa  52  0.000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1103  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 237 aa  52  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292057  hitchhiker  0.000229506 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3286  Methyltransferase type 11  34 
 
 		 272 aa  51.6  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0391  biotin biosynthesis protein BioC  35.34 
 
 		 276 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1100  methyltransferase type 11  33.04 
 
 		 241 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.613335  normal  0.68068 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0756  methyltransferase type 11  32.65 
 
 		 234 aa  51.2  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.055358 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1128  biotin synthesis protein BioC  35.24 
 
 		 275 aa  50.4  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4082  Methyltransferase type 11  35.29 
 
 		 235 aa  50.8  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4283  methyltransferase type 11  34 
 
 		 257 aa  50.8  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.706274  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3941  methyltransferase type 11  31.3 
 
 		 237 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  39.42 
 
 		 265 aa  51.2  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2384  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  28.68 
 
 		 258 aa  50.4  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.528666  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2517  biotin biosynthesis protein BioC  36.36 
 
 		 275 aa  50.8  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000257486 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  37.23 
 
 		 225 aa  50.8  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10980  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  35.71 
 
 		 296 aa  51.2  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4086  methyltransferase type 11  26.89 
 
 		 249 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.315577  normal  0.173874 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  29.47 
 
 		 345 aa  50.1  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3824  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 328 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2357  biotin biosynthesis protein BioC  34.34 
 
 		 275 aa  50.4  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000020473 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2429  biotin biosynthesis protein BioC  35 
 
 		 275 aa  50.4  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0131748 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3630  Methyltransferase type 11  30.89 
 
 		 272 aa  50.4  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2692  Methyltransferase type 11  27.61 
 
 		 190 aa  49.7  0.00004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0603  putative biotin synthesis protein BioC  31.79 
 
 		 274 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3059  methyltransferase type 11  32.63 
 
 		 238 aa  50.1  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4209  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  41 
 
 		 248 aa  49.7  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0490  Methyltransferase type 11  38.18 
 
 		 222 aa  49.7  0.00004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3127  methyltransferase type 11  24.52 
 
 		 261 aa  49.7  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.484844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0780  glycosyl transferase, group 1  33.64 
 
 		 711 aa  49.7  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1006  Methyltransferase type 11  27.69 
 
 		 242 aa  49.7  0.00004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00471985  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3974  methyltransferase type 11  51.06 
 
 		 284 aa  49.7  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20390  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1, 4-benzoquinol methylase  31.18 
 
 		 245 aa  49.7  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0797828  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>