More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_3286 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_3286  Methyltransferase type 11  100 
 
 
272 aa  555  1e-157  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2880  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  61.62 
 
 
273 aa  340  1e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1848  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  50.18 
 
 
282 aa  258  5.0000000000000005e-68  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.329247 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1815  methyltransferase type 11  45.79 
 
 
275 aa  203  2e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0297  UbiE/COQ5 family methyltransferase  42.2 
 
 
256 aa  70.5  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378405  normal  0.771638 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0284  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  43.12 
 
 
256 aa  69.3  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0289  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  42.2 
 
 
256 aa  68.9  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.911114 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0303  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  42.2 
 
 
256 aa  68.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0282  UbiE/COQ5 family methyltransferase  42.2 
 
 
256 aa  68.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.986318 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  32.79 
 
 
236 aa  67.4  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3676  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.11 
 
 
230 aa  66.6  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0791082 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  32.81 
 
 
252 aa  64.3  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0721  hypothetical protein  31.61 
 
 
225 aa  64.7  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.856031 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3425  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  38 
 
 
258 aa  63.9  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000129288 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5754  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.93 
 
 
250 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0222  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  37.62 
 
 
256 aa  62.4  0.000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.188409  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  35.82 
 
 
225 aa  62.4  0.000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4275  Methyltransferase type 11  35.14 
 
 
203 aa  61.6  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.18004 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2336  methyltransferase type 11  31.9 
 
 
250 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.223131 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1690  Methyltransferase type 11  36.77 
 
 
285 aa  60.8  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0193071 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0529  methyltransferase type 11  37.74 
 
 
256 aa  61.2  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.544475  hitchhiker  0.0000501952 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2470  methyltransferase type 11  31.9 
 
 
250 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.28485  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1067  Methyltransferase type 11  34.87 
 
 
250 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1001  methyltransferase type 11  34.29 
 
 
282 aa  60.8  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0215  UbiE/COQ5 family methlytransferase  36.67 
 
 
256 aa  60.1  0.00000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.383656  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0744  methyltransferase type 11  37.86 
 
 
256 aa  60.1  0.00000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0214  UbiE/COQ5 family methlytransferase  36.63 
 
 
256 aa  60.1  0.00000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00594444  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0798  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.68 
 
 
259 aa  60.1  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.350389 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5021  Methyltransferase type 11  35.24 
 
 
214 aa  59.3  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0224  UbiE/COQ5 family methlytransferase  37.5 
 
 
256 aa  59.3  0.00000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.234424  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0867  methyltransferase type 11  30.86 
 
 
250 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.873465  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1111  Methyltransferase type 12  36.84 
 
 
310 aa  58.9  0.00000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.100428  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2384  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  36.36 
 
 
258 aa  58.5  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.528666  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2014  hypothetical protein  37.76 
 
 
253 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00388646  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6865  Methyltransferase type 11  32.14 
 
 
282 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0774  Methyltransferase type 11  30.25 
 
 
254 aa  57.4  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  39.39 
 
 
259 aa  57.8  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  32.06 
 
 
263 aa  57.4  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3293  Methyltransferase type 11  31.21 
 
 
257 aa  57.8  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0623  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  30.25 
 
 
254 aa  57.4  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10980  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  39 
 
 
296 aa  57  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4655  Methyltransferase type 11  35.24 
 
 
310 aa  57  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0904903  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2088  methyltransferase type 11  29.26 
 
 
258 aa  57  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2798  methyltransferase type 11  37.14 
 
 
249 aa  57.4  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.4443  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  38.38 
 
 
265 aa  56.6  0.0000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2431  methyltransferase type 11  30 
 
 
250 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.508094 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0310  Methyltransferase type 11  29.7 
 
 
259 aa  56.2  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0163347  normal  0.712325 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2330  hypothetical protein  29.77 
 
 
249 aa  56.2  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.291215  normal  0.0289436 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3824  Methyltransferase type 11  35.88 
 
 
328 aa  56.6  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1891  UbiE/COQ5 methyltransferase  36.73 
 
 
255 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249773  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27050  glycine/sarcosine N-methyltransferase  37.17 
 
 
559 aa  56.2  0.0000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.59391  normal  0.396997 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2561  Methyltransferase type 11  32.5 
 
 
261 aa  55.8  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.894983  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1575  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.17 
 
 
207 aa  55.5  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3400  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.26 
 
 
232 aa  55.5  0.0000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0474  UbiE/COQ5 methyltransferase  37.88 
 
 
265 aa  55.8  0.0000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.715311 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3413  putative methyltransferase  37.19 
 
 
250 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.673339  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3931  Methyltransferase type 11  38.14 
 
 
271 aa  55.5  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37046  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4470  Methyltransferase type 11  30.7 
 
 
252 aa  55.5  0.0000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.09133  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1987  UbiE/COQ5 family methlytransferase  40.4 
 
 
254 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.199411  hitchhiker  0.00854034 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4848  Methyltransferase type 11  29.83 
 
 
241 aa  55.1  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2634  methyltransferase type 11  25.97 
 
 
204 aa  55.1  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.162625  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0485  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.42 
 
 
249 aa  55.1  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.693247  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  33.12 
 
 
240 aa  55.5  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3130  Methyltransferase type 11  32 
 
 
261 aa  55.1  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.239042  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1891  Methyltransferase type 11  35.71 
 
 
255 aa  55.1  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.742505  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1815  methyltransferase type 11  30 
 
 
250 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3270  Methyltransferase type 11  32.61 
 
 
324 aa  55.1  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.455173  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2181  methyltransferase type 11  37.19 
 
 
250 aa  55.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0100856 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3455  methyltransferase type 11  27.38 
 
 
207 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.915003  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2427  methyltransferase type 11  30 
 
 
250 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.992518  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  32.32 
 
 
258 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0401  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 
257 aa  54.7  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2013  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.5 
 
 
241 aa  54.3  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0208  methyltransferase type 11  33.11 
 
 
252 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2327  methylase  31.54 
 
 
241 aa  54.3  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.102662  normal  0.330615 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1419  Methyltransferase type 11  35.71 
 
 
256 aa  54.3  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1751  Methyltransferase type 11  25.41 
 
 
204 aa  54.7  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.190561  hitchhiker  0.00369788 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5653  methyltransferase type 11  28.47 
 
 
220 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.154471  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0164  UbiE/COQ5 family methlytransferase  27.56 
 
 
207 aa  54.3  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2809  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  28.03 
 
 
235 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3259  methyltransferase type 11  37.7 
 
 
244 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6134  methyltransferase type 11  28.47 
 
 
220 aa  54.7  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.145601  normal  0.0218248 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6018  methyltransferase type 11  28.47 
 
 
220 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.153765  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_74165  predicted protein  37.25 
 
 
275 aa  53.9  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.426608 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6509  methyltransferase type 11  28.47 
 
 
220 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.434141  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2287  methyltransferase type 11  38.32 
 
 
282 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.108281  normal  0.170198 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2096  type 11 methyltransferase  32.76 
 
 
207 aa  54.3  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.423415  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3772  methyltransferase type 11  39.39 
 
 
254 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1550  methyltransferase type 11  39.39 
 
 
254 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.326399 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0124  demethylmenaquinone methyltransferase  37.5 
 
 
168 aa  53.9  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000412649  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  39.39 
 
 
215 aa  53.9  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5219  Methyltransferase type 11  34.75 
 
 
259 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0306756 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0994  methyltransferase type 11  29.45 
 
 
245 aa  53.9  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.295346  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0218  methyltransferase type 11  29.8 
 
 
252 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.679298  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0228  methyltransferase type 11  29.8 
 
 
252 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.237973  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3398  Methyltransferase type 11  27.1 
 
 
207 aa  53.1  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2709  methyltransferase type 11  25.41 
 
 
204 aa  53.1  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.690891  normal  0.954825 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2595  methyltransferase type 11  25.41 
 
 
204 aa  53.5  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.133869  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  36.79 
 
 
236 aa  53.1  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0617  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  33.05 
 
 
232 aa  53.5  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.48837 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>