More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_6253 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_6253  methyltransferase domain-containing protein  100 
 
 		 276 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.812952  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72050  hypothetical protein  53.45 
 
 		 278 aa  291  8e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.892313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5676  hypothetical protein  55.6 
 
 		 272 aa  290  2e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.636295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72030  hypothetical protein  49.64 
 
 		 287 aa  265  5e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6255  methyltransferase domain-containing protein  49 
 
 		 257 aa  263  2e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.88528  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5678  hypothetical protein  46.93 
 
 		 294 aa  249  5e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.622302  normal  0.945039 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  31.55 
 
 		 255 aa  102  9e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2874  type 11 methyltransferase  28.99 
 
 		 237 aa  95.1  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0572  hypothetical protein  26.89 
 
 		 243 aa  92  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.519811  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8231  methyltransferase type 11  28.51 
 
 		 237 aa  90.9  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0011  methyltransferase type 11  28.99 
 
 		 243 aa  89.7  4e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1100  methyltransferase type 11  28.76 
 
 		 241 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.613335  normal  0.68068 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5717  methyltransferase type 11  27.9 
 
 		 241 aa  87  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.753035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0011  methyltransferase type 11  29.13 
 
 		 289 aa  86.3  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0390  Methyltransferase type 11  27.04 
 
 		 239 aa  85.1  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.614689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5101  methyltransferase type 11  29.31 
 
 		 243 aa  82.8  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5189  methyltransferase type 11  29.31 
 
 		 243 aa  82.8  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5480  methyltransferase type 11  29.31 
 
 		 243 aa  82.8  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.690261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2138  Methyltransferase type 11  29.29 
 
 		 237 aa  80.9  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2798  methyltransferase type 11  25 
 
 		 249 aa  77  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.4443  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3876  Methyltransferase type 11  27.85 
 
 		 241 aa  73.2  0.000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3592  Methyltransferase type 11  30.09 
 
 		 251 aa  72  0.000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0490  Methyltransferase type 11  29.11 
 
 		 222 aa  70.9  0.00000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0780  glycosyl transferase, group 1  26.17 
 
 		 711 aa  69.7  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  29.25 
 
 		 240 aa  69.7  0.00000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2358  Methyltransferase type 11  35.14 
 
 		 634 aa  69.3  0.00000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.295252  hitchhiker  0.00225016 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0484  putative methyltransferase  24.69 
 
 		 240 aa  68.2  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2593  methyltransferase type 11  32.21 
 
 		 238 aa  67.8  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2918  Methyltransferase type 11  29.41 
 
 		 248 aa  67.8  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0444641  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0028  glycosyl transferase group 1  25.12 
 
 		 710 aa  65.9  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2007  methyltransferase type 11  26.97 
 
 		 239 aa  65.5  0.0000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0849  methyltransferase type 11  35.92 
 
 		 283 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.712211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2493  methyltransferase type 11  27.88 
 
 		 238 aa  64.7  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0424755  normal  0.184077 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3711  Methyltransferase type 11  29.71 
 
 		 208 aa  63.9  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.157205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0287  generic methyltransferase  24.88 
 
 		 292 aa  61.6  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.16206  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4065  methyltransferase type 11  27.83 
 
 		 295 aa  62  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.991618  normal  0.0815821 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2589  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.49 
 
 		 262 aa  61.2  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.672659 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1474  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  31.01 
 
 		 255 aa  60.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.760771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1121  methyltransferase type 11  25.98 
 
 		 293 aa  60.8  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.536452  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5502  Methyltransferase type 12  31.45 
 
 		 217 aa  60.5  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.222085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4274  methyltransferase type 11  27.46 
 
 		 222 aa  60.5  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.254306  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  26.88 
 
 		 244 aa  60.5  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2175  Methyltransferase type 11  27.01 
 
 		 221 aa  60.1  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.300294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3127  methyltransferase type 11  29.87 
 
 		 261 aa  59.7  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.484844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3889  methyltransferase type 11  33.98 
 
 		 281 aa  59.7  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.972662 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  31.62 
 
 		 225 aa  59.3  0.00000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01809  methyltransferase  29.45 
 
 		 268 aa  58.9  0.00000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2510  hypothetical protein  25.77 
 
 		 308 aa  58.9  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3989  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 249 aa  58.2  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.169635  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0603  methyltransferase type 11  26.44 
 
 		 288 aa  58.2  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000027512  unclonable  0.00000842033 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3351  methyltransferase type 11  25.26 
 
 		 324 aa  58.2  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3983  methyltransferase type 11  28.49 
 
 		 293 aa  58.5  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.307607  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  23.74 
 
 		 1162 aa  57.8  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3357  Methyltransferase type 11  22.75 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0189  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  30.89 
 
 		 275 aa  57.8  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0807  type 11 methyltransferase  26.92 
 
 		 245 aa  57.4  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.887141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0617  Methyltransferase type 12  29.8 
 
 		 310 aa  57.4  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0164647 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1324  methyltransferase type 11  24.87 
 
 		 248 aa  58.2  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.386033  hitchhiker  0.000000000822833 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2245  Methyltransferase type 11  29.41 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.810534 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13046  hypothetical protein  26.29 
 
 		 274 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0765338  hitchhiker  0.00655804 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0252  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  27.15 
 
 		 273 aa  57.4  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.859955  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 282 aa  57.4  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1601  Methyltransferase type 11  32.48 
 
 		 212 aa  57  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.624379  normal  0.990626 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2260  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36.44 
 
 		 254 aa  57  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0516247  normal  0.429891 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1305  Methyltransferase type 11  24.44 
 
 		 235 aa  57  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1849  methyltransferase type 11  31.29 
 
 		 259 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4260  methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 261 aa  57  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2010  methionine biosynthesis protein MetW  28.12 
 
 		 197 aa  57  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  24.35 
 
 		 213 aa  56.6  0.0000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3607  methyltransferase type 11  35.71 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2384  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  32.06 
 
 		 258 aa  56.6  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.528666  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1761  methyltransferase type 11  35.05 
 
 		 257 aa  56.6  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2736  Methyltransferase type 11  30.56 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  32.11 
 
 		 1106 aa  56.2  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1742  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  33.33 
 
 		 253 aa  56.2  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.581641 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  30.22 
 
 		 265 aa  55.8  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  32.26 
 
 		 257 aa  55.8  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2098  methyltransferase type 11  28.93 
 
 		 263 aa  55.8  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5589  Methyltransferase type 11  37.14 
 
 		 275 aa  55.5  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0910  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.57 
 
 		 247 aa  55.5  0.0000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0284  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  25.91 
 
 		 256 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0080  Methyltransferase type 11  27.71 
 
 		 353 aa  55.5  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2831  Methyltransferase type 11  27.83 
 
 		 235 aa  55.1  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2714  Methyltransferase type 11  23.81 
 
 		 274 aa  54.7  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1068  methyltransferase type 11  30.91 
 
 		 417 aa  55.1  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0077  hypothetical protein  27.71 
 
 		 353 aa  55.5  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0026  hypothetical protein  27.12 
 
 		 215 aa  54.3  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.366115  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0636  Methyltransferase type 11  31.78 
 
 		 228 aa  53.9  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0381586  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4848  Methyltransferase type 11  28.22 
 
 		 241 aa  54.3  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1880  Methyltransferase type 11  30.85 
 
 		 240 aa  54.7  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0957  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.88 
 
 		 235 aa  54.3  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0214  UbiE/COQ5 family methlytransferase  24.62 
 
 		 256 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00594444  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0282  UbiE/COQ5 family methyltransferase  25.39 
 
 		 256 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.986318 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0215  UbiE/COQ5 family methlytransferase  24.62 
 
 		 256 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.383656  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1576  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.59 
 
 		 229 aa  54.7  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0819441  unclonable  0.000000165496 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2143  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.89 
 
 		 272 aa  54.3  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.136766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4238  Methyltransferase type 11  30.51 
 
 		 237 aa  54.7  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  29.66 
 
 		 258 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6056  Methyltransferase type 11  27.98 
 
 		 248 aa  53.9  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0297  UbiE/COQ5 family methyltransferase  25.39 
 
 		 256 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378405  normal  0.771638 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>