299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3351 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_3351  methyltransferase type 11  100 
 
 
324 aa  667    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0296  Methyltransferase type 12  25.24 
 
 
326 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1321  methyltransferase type 12  31.94 
 
 
396 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3053  methyltransferase type 12  31.51 
 
 
332 aa  66.6  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0971  methyltransferase type 11  28.45 
 
 
330 aa  66.6  0.0000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1306  hypothetical protein  24.32 
 
 
297 aa  65.1  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.782095 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4464  Methyltransferase type 12  29.1 
 
 
543 aa  64.7  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0296  Methyltransferase type 12  25.24 
 
 
326 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0080  Methyltransferase type 11  28.27 
 
 
353 aa  64.3  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1806  methyltransferase type 11  24.81 
 
 
310 aa  64.3  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0077  hypothetical protein  28.27 
 
 
353 aa  64.3  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1556  Methyltransferase type 12  28.19 
 
 
318 aa  63.5  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0106  methyltransferase type 12  26.28 
 
 
306 aa  62.4  0.00000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000284903 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3232  hypothetical protein  30.6 
 
 
323 aa  62  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.470904  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4274  methyltransferase type 11  33.1 
 
 
222 aa  61.6  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.254306  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2682  Methyltransferase type 12  27.59 
 
 
358 aa  60.8  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.454648  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1631  Methyltransferase type 12  29.52 
 
 
318 aa  60.8  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0453  hypothetical protein  25.21 
 
 
305 aa  59.3  0.00000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3105  methyltransferase type 12  28.5 
 
 
391 aa  59.3  0.00000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2391  methyltransferase type 12  25.87 
 
 
406 aa  58.5  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.044338  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3357  Methyltransferase type 11  29.79 
 
 
211 aa  58.9  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3022  hypothetical protein  32.43 
 
 
1124 aa  58.5  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3267  hypothetical protein  24.4 
 
 
303 aa  58.9  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0752  methyltransferase type 11  32.61 
 
 
214 aa  58.9  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6253  methyltransferase domain-containing protein  25.26 
 
 
276 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.812952  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1775  methyltransferase type 12  32.39 
 
 
298 aa  58.2  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1402  Methyltransferase type 11  25.78 
 
 
394 aa  58.5  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1487  hypothetical protein  28.57 
 
 
300 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.767872 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3058  methyltransferase type 12  26.48 
 
 
318 aa  57.4  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0490  Methyltransferase type 11  30.71 
 
 
222 aa  57  0.0000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0981  hypothetical protein  25.1 
 
 
275 aa  57  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00335023  hitchhiker  0.000157942 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1320  methyltransferase type 12  27.27 
 
 
401 aa  56.6  0.0000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1749  Methyltransferase type 11  26.61 
 
 
323 aa  56.2  0.0000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.16946 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1471  methyltransferase type 11  26.61 
 
 
323 aa  56.2  0.0000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0736602 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14091  hypothetical protein  21.01 
 
 
310 aa  56.2  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0863653  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0194  hypothetical protein  24.68 
 
 
304 aa  55.8  0.0000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0463  methyltransferase type 11  36.89 
 
 
197 aa  55.8  0.0000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.115014  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02860  hypothetical protein  27.52 
 
 
215 aa  55.1  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.584838  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2874  type 11 methyltransferase  27.95 
 
 
237 aa  55.5  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3264  hypothetical protein  25.59 
 
 
395 aa  55.1  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1471  Methyltransferase type 11  26.15 
 
 
333 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.133968 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0126  Methyltransferase type 12  23.32 
 
 
415 aa  55.1  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0105171  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8231  methyltransferase type 11  28.03 
 
 
237 aa  54.3  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2963  methyltransferase type 12  23.26 
 
 
303 aa  53.9  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0420  Methyltransferase type 11  29.29 
 
 
335 aa  53.9  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.849842 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0382  Methyltransferase type 11  32.99 
 
 
298 aa  53.5  0.000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2164  methyltransferase type 11  25.49 
 
 
346 aa  53.5  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4412  methyltransferase type 11  25.57 
 
 
303 aa  53.1  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.033739  normal  0.97195 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2768  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.65 
 
 
247 aa  53.1  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16685  predicted protein  27.78 
 
 
218 aa  53.1  0.000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.313345  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  28.47 
 
 
345 aa  52.8  0.000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0617  Methyltransferase type 12  23.15 
 
 
310 aa  52.8  0.000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0164647 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3803  Methyltransferase type 12  26.17 
 
 
300 aa  52.8  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157905  normal  0.599602 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0237  Methyltransferase type 11  24.43 
 
 
248 aa  52.8  0.000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5520  Methyltransferase type 12  22.18 
 
 
306 aa  52.4  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.281271 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2170  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  28.22 
 
 
303 aa  52  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0560601  hitchhiker  0.0000129076 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  27.85 
 
 
255 aa  52  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1794  methyltransferase type 12  28.83 
 
 
336 aa  52.4  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2007  methyltransferase type 11  28.66 
 
 
239 aa  52.4  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3360  methyltransferase type 11  31.25 
 
 
239 aa  52  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00148937  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2732  hypothetical protein  27.27 
 
 
236 aa  51.2  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000422466  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3104  methyltransferase type 12  24.22 
 
 
396 aa  51.6  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6087  Methyltransferase type 12  23.89 
 
 
263 aa  51.2  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3781  methyltransferase type 11  29.69 
 
 
194 aa  51.6  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0370  methyltransferase type 12  27.72 
 
 
382 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1006  Methyltransferase type 11  24.83 
 
 
242 aa  50.8  0.00003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00471985  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21420  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase /demethylmenaquinone methyltransferase  29.36 
 
 
233 aa  50.8  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0478514  hitchhiker  0.0000156795 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2918  Methyltransferase type 11  26.62 
 
 
248 aa  51.2  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0444641  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1175  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.67 
 
 
247 aa  50.8  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.125464  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0390  Methyltransferase type 11  25 
 
 
239 aa  50.8  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.614689  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1007  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  34.65 
 
 
249 aa  50.8  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2837  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.67 
 
 
247 aa  50.8  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3910  hypothetical protein  29.86 
 
 
305 aa  50.8  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.230808  normal  0.860748 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  28.48 
 
 
225 aa  50.4  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12801  hypothetical protein  24.11 
 
 
275 aa  50.1  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.838428  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3889  methyltransferase type 11  34.95 
 
 
281 aa  50.1  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.972662 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5793  Methyltransferase type 11  25 
 
 
219 aa  50.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3823  glycosyl transferase family 2  30.14 
 
 
1523 aa  50.1  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.588357 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13046  hypothetical protein  24.88 
 
 
274 aa  49.7  0.00006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0765338  hitchhiker  0.00655804 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0390  Methyltransferase type 11  25.87 
 
 
267 aa  49.7  0.00007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2510  hypothetical protein  29.37 
 
 
308 aa  49.7  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0189  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  25.76 
 
 
275 aa  49.7  0.00007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2906  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.62 
 
 
247 aa  49.7  0.00007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0329  methyltransferase type 11  27.62 
 
 
212 aa  49.3  0.00009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3088  C-methyltransferase  34.62 
 
 
406 aa  49.3  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3550  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.67 
 
 
248 aa  48.5  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2840  Methyltransferase type 11  29.87 
 
 
235 aa  48.9  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.998638  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2589  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.3 
 
 
262 aa  48.9  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.672659 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  23.94 
 
 
244 aa  48.5  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0876  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.08 
 
 
245 aa  48.5  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000138589  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1111  Methyltransferase type 12  26.91 
 
 
310 aa  47.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.100428  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02731  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.41 
 
 
235 aa  47.8  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1285  hypothetical protein  30.82 
 
 
249 aa  47.8  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1121  methyltransferase type 11  27.87 
 
 
293 aa  48.5  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.536452  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0847  Methyltransferase type 11  36.49 
 
 
272 aa  48.1  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.988937  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2798  methyltransferase type 11  25.32 
 
 
249 aa  48.1  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.4443  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2627  methyltransferase type 11  23.7 
 
 
306 aa  48.1  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3059  methyltransferase type 11  32.95 
 
 
238 aa  48.1  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2138  Methyltransferase type 11  30.17 
 
 
237 aa  48.5  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4502  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.51 
 
 
244 aa  47.4  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.166087 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>