More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_02290 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_02290  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  100 
 
 
209 aa  416  9.999999999999999e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.457573  normal  0.610905 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4481  methyltransferase type 11  42.65 
 
 
213 aa  150  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.980043  normal  0.396448 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1015  Methyltransferase type 11  38.24 
 
 
213 aa  131  6e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.371605  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1981  Methyltransferase type 11  47.2 
 
 
201 aa  130  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.020374  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2066  Methyltransferase type 11  47.77 
 
 
201 aa  130  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.240565  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1565  Methyltransferase type 11  42.25 
 
 
209 aa  130  1.0000000000000001e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0848447  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1898  methyltransferase type 11  45.96 
 
 
201 aa  128  7.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0160246  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2807  Methyltransferase type 11  37.75 
 
 
228 aa  128  7.000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1591  Methyltransferase type 11  45.4 
 
 
229 aa  127  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5114  Methyltransferase type 11  40 
 
 
221 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.947305 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2368  Methyltransferase type 11  41.32 
 
 
239 aa  124  9e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000109502  hitchhiker  0.000328016 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2971  Methyltransferase type 11  40.7 
 
 
221 aa  124  1e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3076  Methyltransferase type 11  43.79 
 
 
221 aa  123  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.851189  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2883  methyltransferase type 11  39.71 
 
 
221 aa  122  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0898399  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2063  Methyltransferase type 11  46.67 
 
 
188 aa  120  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.571363 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1797  Methyltransferase type 11  44.94 
 
 
211 aa  119  3e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.424011  hitchhiker  0.000214438 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1962  methyltransferase type 11  47.77 
 
 
209 aa  116  3e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.113355  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1079  methyltransferase type 11  42.53 
 
 
193 aa  113  2.0000000000000002e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.233586  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3927  methyltransferase type 11  38.38 
 
 
228 aa  111  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.852956  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0933  methyltransferase type 11  40.96 
 
 
223 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0841609  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2621  Methyltransferase type 11  38.89 
 
 
219 aa  109  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2526  methyltransferase type 11  34.95 
 
 
205 aa  109  3e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0981998 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0196  methyltransferase type 11  45.83 
 
 
213 aa  108  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2552  methyltransferase type 11  43.7 
 
 
206 aa  108  6e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0008  phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  37.29 
 
 
199 aa  108  7.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.257422  normal  0.214675 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1427  Methyltransferase type 11  42.29 
 
 
220 aa  108  8.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00176149  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0442  hypothetical protein  40.99 
 
 
219 aa  104  8e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6211  methyltransferase type 11  43.48 
 
 
202 aa  104  8e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.304536 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0932  putative methyltransferase  40.56 
 
 
217 aa  104  9e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6235  methyltransferase type 11  45.39 
 
 
204 aa  104  9e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2605  UbiE/COQ5 methyltransferase  37.67 
 
 
206 aa  103  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0775549  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0559  methyltransferase type 11  36.22 
 
 
216 aa  103  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.492379 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2692  methyltransferase type 11  43.12 
 
 
206 aa  103  3e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.253841 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3814  methyltransferase type 11  42.86 
 
 
203 aa  101  8e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2948  methyltransferase type 11  37.5 
 
 
212 aa  101  9e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160502  normal  0.130465 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5725  Methyltransferase type 11  38.32 
 
 
204 aa  100  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5685  Methyltransferase type 11  38.32 
 
 
204 aa  100  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11171  hypothetical protein  36.79 
 
 
216 aa  99.8  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4063  methyltransferase type 12  37.89 
 
 
210 aa  99  4e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4138  methyltransferase type 12  37.89 
 
 
210 aa  99  4e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.950968 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2133  methyltransferase type 12  38.12 
 
 
210 aa  99  5e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.153525  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2834  Methyltransferase type 11  31.33 
 
 
203 aa  98.6  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0713675 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1441  UbiE/COQ5 family methlytransferase  39.79 
 
 
208 aa  97.1  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.000764793  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4292  methyltransferase type 12  37.37 
 
 
210 aa  96.7  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.401228  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53910  phospholipid methyltransferase  33.98 
 
 
216 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.260165  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1462  methyltransferase type 11  33.14 
 
 
209 aa  94  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.508707  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4571  methyltransferase type 12  36.65 
 
 
209 aa  94  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.156047 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1091  Methyltransferase type 11  34.81 
 
 
206 aa  93.6  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.192231  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43931  predicted protein  36 
 
 
279 aa  94  2e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.030953  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4720  phospholipid methyltransferase  35.58 
 
 
203 aa  92  5e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.665331  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0018  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  41.73 
 
 
204 aa  91.3  9e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000241496  hitchhiker  0.00000138707 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2642  methyltransferase type 11  40.13 
 
 
208 aa  91.3  9e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.670707  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1709  Methyltransferase type 11  37.63 
 
 
206 aa  89.4  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.775489  normal  0.171516 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1381  Methyltransferase type 11  40.8 
 
 
225 aa  89.7  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.231177  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2195  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  33.71 
 
 
213 aa  87.4  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1708  methyltransferase type 11  28.48 
 
 
187 aa  86.7  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0694395  normal  0.27386 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1854  methyltransferase type 11  32.31 
 
 
207 aa  84  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.823258 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0146  methyltransferase type 11  36.84 
 
 
208 aa  83.2  0.000000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.844636  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43205  predicted protein  34.91 
 
 
181 aa  81.6  0.000000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000000000040449  normal  0.10617 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2319  generic methyltransferase  34.16 
 
 
210 aa  80.9  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.897419  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1826  Methyltransferase type 11  37.22 
 
 
201 aa  80.9  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00341289  normal  0.127097 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2160  methyltransferase type 11  38.07 
 
 
236 aa  79  0.00000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.264842  normal  0.115714 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3689  Methyltransferase type 11  37.32 
 
 
195 aa  77.4  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.342023 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3328  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  34.15 
 
 
210 aa  77  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31180  predicted protein  43.64 
 
 
133 aa  76.3  0.0000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0286845  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0735  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  43.09 
 
 
212 aa  75.9  0.0000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.837751  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3086  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  31.93 
 
 
213 aa  74.7  0.0000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0122  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  43.79 
 
 
223 aa  74.7  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.418924  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2723  Methyltransferase type 11  35.29 
 
 
200 aa  73.6  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0914  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  29.74 
 
 
255 aa  73.2  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0604  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.33 
 
 
212 aa  72.4  0.000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.977459  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2102  Methyltransferase type 11  43.24 
 
 
157 aa  71.2  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000102773  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4748  hypothetical protein  32.56 
 
 
273 aa  69.3  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000104492 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5517  methyltransferase type 11  50 
 
 
228 aa  69.3  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.550452  normal  0.719059 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2712  putative phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  35.77 
 
 
226 aa  68.9  0.00000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.870029  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0509  methyltransferase type 11  29.53 
 
 
210 aa  68.9  0.00000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1280  Methyltransferase type 11  30.22 
 
 
204 aa  68.6  0.00000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1848  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  37.58 
 
 
282 aa  68.6  0.00000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.329247 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4140  putative methyltransferase  38.31 
 
 
255 aa  68.6  0.00000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4690  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  32.05 
 
 
206 aa  68.6  0.00000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.179715 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2810  phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  40.95 
 
 
205 aa  68.2  0.00000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0758  Methyltransferase type 11  45 
 
 
189 aa  68.2  0.00000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00287175  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2422  Methyltransferase type 11  41.75 
 
 
232 aa  67.8  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3485  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  33.33 
 
 
197 aa  67.4  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.171708 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0321  Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  35.21 
 
 
245 aa  68.2  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.943946  normal  0.235665 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0696  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  37.39 
 
 
212 aa  67  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3142  Methyltransferase type 11  38.54 
 
 
248 aa  67  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0826  methyltransferase type 11  38.71 
 
 
224 aa  67  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.457177  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0492  phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  32.92 
 
 
232 aa  66.2  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.578084 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31900  predicted protein  29.38 
 
 
298 aa  66.2  0.0000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.041967  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6211  phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  38.28 
 
 
225 aa  65.5  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1882  phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  37.74 
 
 
211 aa  65.5  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0843  Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  32.53 
 
 
217 aa  65.1  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3259  methyltransferase type 11  43.43 
 
 
244 aa  65.1  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1371  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  45.22 
 
 
279 aa  65.1  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0345  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  37.74 
 
 
228 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.935966  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0964  Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  31.71 
 
 
217 aa  64.3  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.417338  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0463  methyltransferase type 11  39.52 
 
 
197 aa  64.7  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.115014  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0166  DNA topoisomerase VI subunit A-like protein  34.48 
 
 
257 aa  64.7  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2682  Methyltransferase type 11  38.96 
 
 
262 aa  63.5  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0179968  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>