More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4555 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4555  phosphoglycolate phosphatase  100 
 
 		 461 aa  937    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.82365  normal  0.133597 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1371  phosphoglycolate phosphatase  53.88 
 
 		 222 aa  213  7.999999999999999e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.203788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1198  phosphoglycolate phosphatase  49.77 
 
 		 223 aa  204  2e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.042458  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1089  phosphoglycolate phosphatase  51.14 
 
 		 227 aa  202  1.9999999999999998e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.396739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3482  phosphoglycolate phosphatase  50.69 
 
 		 228 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.875502  normal  0.981101 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1574  phosphoglycolate phosphatase  46.95 
 
 		 227 aa  186  6e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0357575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2091  phosphoglycolate phosphatase  42.68 
 
 		 233 aa  183  7e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0118  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  47.47 
 
 		 232 aa  182  8.000000000000001e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3547  phosphoglycolate phosphatase  50.23 
 
 		 238 aa  182  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0954  phosphoglycolate phosphatase  47.69 
 
 		 233 aa  177  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2080  phosphoglycolate phosphatase  46.48 
 
 		 237 aa  177  2e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.307061  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1296  phosphoglycolate phosphatase  47.69 
 
 		 233 aa  177  4e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0205291  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2054  phosphoglycolate phosphatase  46.51 
 
 		 225 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.203866 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2193  phosphoglycolate phosphatase  46.76 
 
 		 225 aa  173  5e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.83571  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2014  phosphoglycolate phosphatase  44.8 
 
 		 236 aa  173  6.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0877  phosphoglycolate phosphatase  44.98 
 
 		 227 aa  172  9e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.336164  normal  0.0645651 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3387  phosphoglycolate phosphatase  47.12 
 
 		 225 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0781845 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2233  phosphoglycolate phosphatase  43.78 
 
 		 238 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.25252  normal  0.513173 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1458  phosphoglycolate phosphatase  43.58 
 
 		 231 aa  171  2e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.677189  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1008  phosphoglycolate phosphatase  42.4 
 
 		 234 aa  170  4e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0975  phosphoglycolate phosphatase  42.4 
 
 		 234 aa  170  4e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.190554  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2252  phosphoglycolate phosphatase  46.89 
 
 		 233 aa  170  6e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.191906  normal  0.672709 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1479  phosphoglycolate phosphatase  46.23 
 
 		 231 aa  167  4e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.781791  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2701  phosphoglycolate phosphatase  45.71 
 
 		 230 aa  167  5e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364651  normal  0.0856305 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2075  phosphoglycolate phosphatase  46.19 
 
 		 228 aa  163  7e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.299627  normal  0.323596 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1220  phosphoglycolate phosphatase  48.33 
 
 		 225 aa  162  1e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2296  phosphoglycolate phosphatase  44.5 
 
 		 233 aa  161  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.75758  normal  0.0287022 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2571  phosphoglycolate phosphatase  44.5 
 
 		 233 aa  162  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0542226 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3219  phosphoglycolate phosphatase  53.59 
 
 		 232 aa  160  5e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1295  HAD-superfamily hydrolase  46.54 
 
 		 224 aa  159  7e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.647127  normal  0.296731 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0729  HAD family hydrolase  44.29 
 
 		 225 aa  158  2e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2290  HAD family hydrolase  40.85 
 
 		 223 aa  154  4e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.783453  normal  0.134252 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2015  HAD family hydrolase  43.58 
 
 		 237 aa  150  7e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.260233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2124  phosphoglycolate phosphatase  34.96 
 
 		 230 aa  147  4.0000000000000006e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.305125  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2192  phosphoglycolate phosphatase  39.81 
 
 		 217 aa  146  8.000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1166  HAD family hydrolase  42.2 
 
 		 229 aa  144  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.779812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3122  HAD family hydrolase  39.82 
 
 		 214 aa  143  7e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3193  phosphoglycolate phosphatase  40.4 
 
 		 250 aa  142  9.999999999999999e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3998  phosphoglycolate phosphatase  40.28 
 
 		 226 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal  0.543367 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2504  phosphoglycolate phosphatase  41.74 
 
 		 229 aa  141  3e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.900598  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0752  phosphoglycolate phosphatase  38.53 
 
 		 272 aa  139  7e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3516  phosphoglycolate phosphatase  38.43 
 
 		 229 aa  138  2e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4610  phosphoglycolate phosphatase  37.85 
 
 		 272 aa  138  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07930  phosphoglycolate phosphatase  37.1 
 
 		 272 aa  138  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282972 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0567  phosphoglycolate phosphatase  37.38 
 
 		 266 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3184  phosphoglycolate phosphatase  45.97 
 
 		 221 aa  137  3.0000000000000003e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.903227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2446  phosphoglycolate phosphatase  34.55 
 
 		 225 aa  137  4e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0450  phosphoglycolate phosphatase  36.04 
 
 		 272 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0416  phosphoglycolate phosphatase  36.45 
 
 		 272 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0057  phosphoglycolate phosphatase  33.33 
 
 		 232 aa  135  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.049028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4786  phosphoglycolate phosphatase  37.39 
 
 		 272 aa  134  3e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.602175 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1410  phosphoglycolate phosphatase  33.33 
 
 		 225 aa  134  3.9999999999999996e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0619  hypothetical protein  36.74 
 
 		 242 aa  133  6e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.759256 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1187  phosphoglycolate phosphatase  37.84 
 
 		 218 aa  133  6e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00990405  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2274  phosphoglycolate phosphatase  41.4 
 
 		 216 aa  133  6.999999999999999e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0447  phosphoglycolate phosphatase  36.92 
 
 		 272 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558752 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2760  putative phosphoglycolate phosphatase  42.05 
 
 		 221 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0219607 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0710  phosphoglycolate phosphatase  40.19 
 
 		 218 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1278  phosphoglycolate phosphatase  38.25 
 
 		 218 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1973  phosphoglycolate phosphatase  39.5 
 
 		 213 aa  130  4.0000000000000003e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.662433 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00378  phosphoglycolate phosphatase  41.75 
 
 		 250 aa  130  5.0000000000000004e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.590108  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2937  phosphoglycolate phosphatase  38.25 
 
 		 218 aa  130  6e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0617  HAD family hydrolase  42.73 
 
 		 224 aa  129  9.000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.422175  normal  0.344237 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3246  phosphoglycolate phosphatase  34.68 
 
 		 227 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.181824  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2847  phosphoglycolate phosphatase  34.68 
 
 		 227 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.212796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2251  phosphoglycolate phosphatase  37 
 
 		 229 aa  129  1.0000000000000001e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  38.66 
 
 		 222 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5119  phosphoglycolate phosphatase  35.87 
 
 		 272 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0925  phosphoglycolate phosphatase  38.03 
 
 		 224 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  37.38 
 
 		 226 aa  128  2.0000000000000002e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2878  phosphoglycolate phosphatase  35.65 
 
 		 226 aa  127  3e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1508  phosphoglycolate phosphatase  41.58 
 
 		 228 aa  127  6e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.313556  normal  0.0200123 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2581  phosphoglycolate phosphatase  40 
 
 		 221 aa  126  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2493  phosphoglycolate phosphatase  34.9 
 
 		 225 aa  125  1e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3031  2-phosphoglycolate phosphatase  40.09 
 
 		 256 aa  126  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0460  phosphoglycolate phosphatase  38.97 
 
 		 229 aa  125  1e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0934432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2370  phosphoglycolate phosphatase  36.36 
 
 		 227 aa  124  4e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46650  phosphoglycolate phosphatase  39.62 
 
 		 233 aa  124  5e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0766  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  36.79 
 
 		 222 aa  123  6e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1985  phosphoglycolate phosphatase  35 
 
 		 223 aa  123  7e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.554471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4023  phosphoglycolate phosphatase  39.44 
 
 		 227 aa  123  7e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6944  phosphoglycolate phosphatase  42.92 
 
 		 257 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0969  phosphoglycolate phosphatase  40.1 
 
 		 229 aa  122  9.999999999999999e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.829291 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2229  phosphoglycolate phosphatase  36.49 
 
 		 227 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.40738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1529  putative 2-phosphoglycolate phosphatase  37.37 
 
 		 234 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4445  phosphoglycolate phosphatase  41.7 
 
 		 234 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0670358  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0897  hydrolase protein  38.71 
 
 		 229 aa  121  3e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00554563  normal  0.72661 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  34.6 
 
 		 227 aa  121  3e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2583  phosphoglycolate phosphatase  35.56 
 
 		 227 aa  120  7e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0261  phosphoglycolate phosphatase  31.36 
 
 		 226 aa  120  7e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0343  phosphoglycolate phosphatase  34.6 
 
 		 233 aa  120  7e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0971  2-phosphoglycolate phosphatase  38.71 
 
 		 237 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.080581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2496  phosphoglycolate phosphatase  35.78 
 
 		 221 aa  118  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1189  HAD family hydrolase  36.9 
 
 		 219 aa  117  3e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2708  phosphoglycolate phosphatase  38.25 
 
 		 218 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.900688 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03140  phosphoglycolate phosphatase  35.81 
 
 		 216 aa  117  3.9999999999999997e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0265  phosphoglycolate phosphatase  34.76 
 
 		 232 aa  117  5e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.210779  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3012  phosphoglycolate phosphatase  38.71 
 
 		 237 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0258131  normal  0.0275568 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1058  phosphoglycolate phosphatase  32.7 
 
 		 227 aa  115  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.234796  normal  0.363243 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1156  phosphoglycolate phosphatase  45.1 
 
 		 209 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.53294 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>