153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3809 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_3809  methyltransferase type 11  100 
 
 
354 aa  739    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0742  Methyltransferase type 12  24.9 
 
 
275 aa  73.6  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1298  Methyltransferase type 11  31.18 
 
 
210 aa  73.6  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.356445  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2627  methyltransferase type 11  28.57 
 
 
306 aa  67.8  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1348  methyltransferase type 11  27.78 
 
 
286 aa  66.6  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.71095  hitchhiker  0.00964289 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3910  hypothetical protein  31.34 
 
 
305 aa  66.2  0.0000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.230808  normal  0.860748 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1325  methyltransferase type 12  29.83 
 
 
240 aa  65.9  0.0000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000858625 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3735  Methyltransferase type 12  27.8 
 
 
334 aa  65.9  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  27.93 
 
 
345 aa  65.1  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0456  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  23.25 
 
 
672 aa  64.3  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0233  Methyltransferase type 12  25.97 
 
 
305 aa  63.9  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4598  Methyltransferase type 12  29.23 
 
 
281 aa  63.5  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  24.86 
 
 
1340 aa  63.2  0.000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0252  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  31.45 
 
 
273 aa  63.2  0.000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.859955  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3949  methyltransferase type 11  24.9 
 
 
513 aa  63.2  0.000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1794  methyltransferase type 12  28.57 
 
 
336 aa  62.8  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1324  methyltransferase type 11  27.07 
 
 
248 aa  62.8  0.000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.386033  hitchhiker  0.000000000822833 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2154  methyltransferase type 11  24.35 
 
 
291 aa  62.4  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0390  Methyltransferase type 11  20.94 
 
 
267 aa  60.8  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0835  Methyltransferase type 12  28.88 
 
 
273 aa  60.5  0.00000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1277  Methyltransferase type 11  24.33 
 
 
572 aa  58.9  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0192  glycosyl transferase family protein  26.7 
 
 
996 aa  58.9  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2304  Methyltransferase type 11  25 
 
 
317 aa  58.5  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000442527  normal  0.300878 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1209  Methyltransferase type 11  29.8 
 
 
210 aa  57.4  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4412  methyltransferase type 11  24.26 
 
 
303 aa  57.4  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.033739  normal  0.97195 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3053  methyltransferase type 12  26.25 
 
 
332 aa  55.8  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2963  methyltransferase type 12  28 
 
 
303 aa  55.1  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2880  Methyltransferase type 11  28.19 
 
 
383 aa  54.7  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.252544  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  26.67 
 
 
244 aa  54.7  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2164  methyltransferase type 11  23.67 
 
 
346 aa  54.3  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4464  Methyltransferase type 12  24.14 
 
 
543 aa  54.3  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1264  hypothetical protein  32.99 
 
 
229 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2366  type 11 methyltransferase  28.7 
 
 
233 aa  54.3  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0147512 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3209  Methyltransferase type 11  31.82 
 
 
230 aa  53.1  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1106  O-antigen biosynthesis protein; glycosyltransferase; methyltransferase  33.67 
 
 
229 aa  53.1  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4077  hypothetical protein  31.96 
 
 
229 aa  53.1  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0382  Methyltransferase type 11  21.56 
 
 
298 aa  53.1  0.000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1700  methyltransferase type 12  27.38 
 
 
274 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1349  methyltransferase type 11  30 
 
 
581 aa  52.8  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00108025  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0971  methyltransferase type 11  28.77 
 
 
330 aa  52.4  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0849  methyltransferase type 11  28.57 
 
 
283 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.712211  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4080  methyltransferase type 12  24.06 
 
 
274 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1806  methyltransferase type 11  25.85 
 
 
310 aa  51.6  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2814  glycosyl transferase family protein  37 
 
 
457 aa  51.6  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0838  Methyltransferase type 12  30.47 
 
 
316 aa  51.6  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.202995  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3058  methyltransferase type 12  26.9 
 
 
318 aa  50.8  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4283  methyltransferase type 11  32.5 
 
 
257 aa  51.2  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.706274  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4934  Methyltransferase type 11  25.95 
 
 
332 aa  50.4  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.310878 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1119  methyltransferase type 12  31.63 
 
 
229 aa  50.4  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.582685  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1078  SAM-dependent methyltransferase  28.37 
 
 
201 aa  50.4  0.00005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.215412  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4654  Methyltransferase type 11  26.8 
 
 
257 aa  50.1  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.302301  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2682  Methyltransferase type 12  24.16 
 
 
358 aa  50.4  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.454648  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0077  hypothetical protein  23.04 
 
 
353 aa  50.1  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2138  Methyltransferase type 11  26.32 
 
 
237 aa  50.1  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3889  methyltransferase type 11  26.5 
 
 
281 aa  50.1  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.972662 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0080  Methyltransferase type 11  23.04 
 
 
353 aa  50.1  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1370  hypothetical protein  31.63 
 
 
229 aa  49.7  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2592  methyltransferase type 11  31.68 
 
 
219 aa  50.1  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14431  hypothetical protein  25.59 
 
 
341 aa  49.7  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.131958  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2170  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  26.45 
 
 
303 aa  49.3  0.00009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0560601  hitchhiker  0.0000129076 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1332  hypothetical protein  30.61 
 
 
229 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.999761  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3425  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  22.17 
 
 
258 aa  48.9  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000129288 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1306  hypothetical protein  23.4 
 
 
297 aa  49.3  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.782095 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1358  methyltransferase type 11  26.57 
 
 
271 aa  48.9  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0934  methyltransferase type 12  23.45 
 
 
228 aa  48.9  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3491  methyltransferase type 11  25.49 
 
 
364 aa  48.9  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4270  methyltransferase type 11  25.89 
 
 
279 aa  49.3  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3267  hypothetical protein  26.67 
 
 
303 aa  48.5  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2200  hypothetical protein  27.18 
 
 
236 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.029444  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0752  methyltransferase type 11  27.52 
 
 
214 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1775  methyltransferase type 12  23.89 
 
 
298 aa  48.1  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3006  methyltransferase type 12  28.21 
 
 
681 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.633739  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2510  hypothetical protein  23.37 
 
 
308 aa  47.8  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0617  Methyltransferase type 12  25 
 
 
310 aa  48.1  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0164647 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1937  methyltransferase  27.18 
 
 
236 aa  47.8  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1423  methyltransferase type 11  30.91 
 
 
279 aa  47.8  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2186  hypothetical protein  27.18 
 
 
199 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.286296  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1345  hypothetical protein  28.1 
 
 
231 aa  47.4  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2081  Methyltransferase type 12  26.9 
 
 
242 aa  47  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000517184  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0370  methyltransferase type 12  25.97 
 
 
382 aa  47  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1749  Methyltransferase type 11  23.15 
 
 
323 aa  46.6  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.16946 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1471  methyltransferase type 11  23.15 
 
 
323 aa  46.6  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0736602 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3198  methyltransferase  26.21 
 
 
226 aa  46.6  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1544  Methyltransferase type 11  25.35 
 
 
200 aa  46.6  0.0007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.580406  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0957  methyltransferase type 11  28.43 
 
 
290 aa  46.6  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1613  Methyltransferase type 12  27.95 
 
 
311 aa  46.6  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.959863  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2740  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.27 
 
 
238 aa  46.6  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1112  O-antigen biosynthesis protein; glycosyltransferase; methyltransferase  29.59 
 
 
229 aa  46.2  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1132  hypothetical protein  29.59 
 
 
229 aa  46.2  0.0009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1225  hypothetical protein  29.59 
 
 
229 aa  46.2  0.0009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1293  hypothetical protein  29.59 
 
 
229 aa  46.2  0.0009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00493379 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2116  methyltransferase  26.21 
 
 
226 aa  46.2  0.0009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1913  methyltransferase  26.21 
 
 
236 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1554  hypothetical protein  29.03 
 
 
447 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5676  hypothetical protein  22.33 
 
 
272 aa  45.8  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.636295  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1578  hypothetical protein  29.03 
 
 
447 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.365139  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2140  hypothetical protein  26.21 
 
 
236 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1471  Methyltransferase type 11  22.69 
 
 
333 aa  46.2  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.133968 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1111  Methyltransferase type 12  23.64 
 
 
310 aa  45.8  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.100428  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0420  Methyltransferase type 11  22.92 
 
 
335 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.849842 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>