More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_1345 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_1345  hypothetical protein  100 
 
 		 231 aa  473  1e-132  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1285  hypothetical protein  36.45 
 
 		 249 aa  136  2e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2132  methyltransferase type 11  36.84 
 
 		 274 aa  129  6e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1349  methyltransferase type 11  33.13 
 
 		 581 aa  97.8  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00108025  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4142  glycosyl transferase family protein  39.1 
 
 		 1287 aa  97.1  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000068759 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0632  glycosyl transferase family protein  38.57 
 
 		 1312 aa  97.1  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.900451 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02860  hypothetical protein  34.15 
 
 		 215 aa  95.5  7e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.584838  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1695  methyltransferase type 11  34.5 
 
 		 211 aa  94.4  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0925048  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1318  glycosyl transferase family protein  38.46 
 
 		 1314 aa  93.2  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.581884  normal  0.368047 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1835  methyltransferase type 12  32.34 
 
 		 231 aa  92.4  5e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3823  glycosyl transferase family 2  31.58 
 
 		 1523 aa  90.1  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.588357 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  32.56 
 
 		 1162 aa  89.7  4e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1106  O-antigen biosynthesis protein; glycosyltransferase; methyltransferase  32.3 
 
 		 229 aa  89  5e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1370  hypothetical protein  32.3 
 
 		 229 aa  88.6  7e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1332  hypothetical protein  32.3 
 
 		 229 aa  88.6  8e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.999761  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1119  methyltransferase type 12  32.3 
 
 		 229 aa  88.2  9e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.582685  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1132  hypothetical protein  31.87 
 
 		 229 aa  87  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1112  O-antigen biosynthesis protein; glycosyltransferase; methyltransferase  31.87 
 
 		 229 aa  87  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0192  glycosyl transferase family protein  34.09 
 
 		 996 aa  87.4  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1225  hypothetical protein  31.87 
 
 		 229 aa  87  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1264  hypothetical protein  32.3 
 
 		 229 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1293  hypothetical protein  31.87 
 
 		 229 aa  87  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00493379 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4077  hypothetical protein  31.68 
 
 		 229 aa  86.7  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3006  methyltransferase type 12  30.43 
 
 		 681 aa  86.3  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.633739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2814  glycosyl transferase family protein  31.61 
 
 		 457 aa  85.9  5e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2592  methyltransferase type 11  32.05 
 
 		 219 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0934  methyltransferase type 12  30.49 
 
 		 228 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  31.51 
 
 		 1340 aa  80.9  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3740  glycosyl transferase family 2  31.03 
 
 		 1523 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1575  Methyltransferase type 12  34.04 
 
 		 746 aa  80.1  0.00000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4464  Methyltransferase type 12  30.08 
 
 		 543 aa  79.3  0.00000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2476  methyltransferase type 12  33.54 
 
 		 229 aa  79.3  0.00000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.131337  normal  0.48496 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0299  methionine biosynthesis protein MetW  24.88 
 
 		 247 aa  76.3  0.0000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.974388  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0312  hypothetical protein  29.45 
 
 		 216 aa  75.9  0.0000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.121352 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2011  hypothetical protein  34.07 
 
 		 199 aa  74.3  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.714234 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5502  Methyltransferase type 12  33.09 
 
 		 217 aa  73.9  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.222085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2178  glycosyl transferase family protein  28.66 
 
 		 1256 aa  72.4  0.000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1129  glycosyl transferase family 2  30.52 
 
 		 785 aa  67.4  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1126  Methyltransferase type 11  27.97 
 
 		 229 aa  65.1  0.0000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3087  hypothetical protein  28.03 
 
 		 353 aa  63.9  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.123974  normal  0.222732 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0661  Methyltransferase type 12  30.54 
 
 		 222 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.259712  normal  0.221967 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0639  Methyltransferase type 12  30.05 
 
 		 222 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4283  methyltransferase type 11  33.85 
 
 		 257 aa  59.3  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.706274  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0467  methyltransferase type 11  38.24 
 
 		 309 aa  58.2  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.167206  unclonable  0.0000104282 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1836  methionine biosynthesis protein MetW  29.6 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1306  hypothetical protein  29.76 
 
 		 297 aa  56.6  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.782095 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0586  methionine biosynthesis MetW  31.06 
 
 		 229 aa  56.6  0.0000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1535  methionine biosynthesis protein MetW  31.53 
 
 		 229 aa  55.8  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0530604 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1759  methionine biosynthesis protein MetW  31.53 
 
 		 229 aa  55.8  0.0000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.531023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2095  methionine biosynthesis protein MetW  31.53 
 
 		 229 aa  55.8  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.273549  normal  0.170685 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0726  methionine biosynthesis protein MetW  29.2 
 
 		 221 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.263476  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2481  methionine biosynthesis MetW  28.07 
 
 		 209 aa  54.7  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2682  Methyltransferase type 12  32.41 
 
 		 358 aa  54.7  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.454648  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1109  methionine biosynthesis protein MetW  28.7 
 
 		 220 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.331654  normal  0.297557 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1321  methyltransferase type 12  26.92 
 
 		 396 aa  54.7  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4971  methionine biosynthesis protein MetW  31.53 
 
 		 206 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5098  methionine biosynthesis protein MetW  31.53 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.435221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5148  methionine biosynthesis protein MetW  31.53 
 
 		 206 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.740945  normal  0.654734 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3053  methyltransferase type 12  30.91 
 
 		 332 aa  53.9  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1880  methionine biosynthesis protein MetW  31.53 
 
 		 242 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0239131 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14431  hypothetical protein  26.21 
 
 		 341 aa  53.9  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.131958  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3105  methyltransferase type 12  29.41 
 
 		 391 aa  53.9  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0677  methionine biosynthesis MetW  29.84 
 
 		 222 aa  53.9  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.772339  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1317  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  28.57 
 
 		 229 aa  53.9  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124117  hitchhiker  3.42912e-24 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1187  putative methionine biosynthesis protein (MetW)  26.95 
 
 		 220 aa  53.9  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3004  methionine biosynthesis protein MetW  27.19 
 
 		 195 aa  53.1  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1024  methionine biosynthesis protein MetW  28.07 
 
 		 214 aa  53.5  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0141813 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5272  trans-aconitate 2-methyltransferase  28 
 
 		 257 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167219  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3191  methionine biosynthesis protein MetW  27.46 
 
 		 210 aa  53.1  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2267  Methyltransferase type 11  29.2 
 
 		 208 aa  53.5  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4711  Methyltransferase type 11  30.91 
 
 		 176 aa  53.1  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0436  methionine biosynthesis protein MetW  28.7 
 
 		 217 aa  53.1  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4081  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.83 
 
 		 232 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.576596  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0453  hypothetical protein  30.29 
 
 		 305 aa  52.8  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0574  methionine biosynthesis protein MetW  28.32 
 
 		 215 aa  52.8  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5793  Methyltransferase type 11  24.44 
 
 		 219 aa  52.8  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0390  Methyltransferase type 11  31.37 
 
 		 194 aa  52.8  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1222  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  32.52 
 
 		 202 aa  52.8  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.556541  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0367  methionine biosynthesis protein MetW  30.63 
 
 		 206 aa  52  0.000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.802939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6087  Methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 263 aa  52  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2510  hypothetical protein  30.77 
 
 		 308 aa  52  0.000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3267  hypothetical protein  32.68 
 
 		 303 aa  52  0.000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5499  Methyltransferase type 11  25 
 
 		 196 aa  51.6  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2110  methyltransferase type 11  31.43 
 
 		 266 aa  51.2  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.594236 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2259  Generic methyltransferase  28.57 
 
 		 248 aa  51.2  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3118  methyltransferase type 12  28.78 
 
 		 246 aa  51.2  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.0061861  hitchhiker  0.0013011 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0752  methyltransferase type 11  25.87 
 
 		 214 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0237  Methyltransferase type 11  32.48 
 
 		 248 aa  51.2  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4333  methionine biosynthesis protein MetW  24.84 
 
 		 196 aa  51.2  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3074  hypothetical protein  28.57 
 
 		 248 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.404761  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1301  Generic methyltransferase  28.57 
 
 		 248 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1530  3-demethylubiquinone-9 3-O-methyltransferase  27.21 
 
 		 237 aa  50.4  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2948  hypothetical protein  28.57 
 
 		 248 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3033  methyltransferase type 11  28.24 
 
 		 504 aa  50.8  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0463  methyltransferase type 11  31.82 
 
 		 197 aa  50.8  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.115014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0950  methionine biosynthesis protein MetW  26.72 
 
 		 204 aa  50.8  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.341803  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  27.73 
 
 		 345 aa  50.1  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0064  hypothetical protein  29.13 
 
 		 268 aa  50.1  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0768546 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0420  Methyltransferase type 11  29.2 
 
 		 335 aa  50.1  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.849842 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3858  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  28.99 
 
 		 260 aa  50.1  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000301378 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>