157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3105 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_3105  methyltransferase type 12  100 
 
 		 391 aa  818    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1321  methyltransferase type 12  53.18 
 
 		 396 aa  427  1e-118  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1320  methyltransferase type 12  36.2 
 
 		 401 aa  266  5.999999999999999e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3104  methyltransferase type 12  36.46 
 
 		 396 aa  236  6e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3053  methyltransferase type 12  29.09 
 
 		 332 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0126  Methyltransferase type 12  23.68 
 
 		 415 aa  70.1  0.00000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0105171  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4588  Methyltransferase type 12  23.41 
 
 		 457 aa  64.7  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.28526  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1631  Methyltransferase type 12  27.17 
 
 		 318 aa  64.3  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2391  methyltransferase type 12  21.85 
 
 		 406 aa  64.7  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.044338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1556  Methyltransferase type 12  27.72 
 
 		 318 aa  64.3  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3006  methyltransferase type 12  24.85 
 
 		 681 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.633739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3959  C-methyltransferase  25 
 
 		 414 aa  61.6  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00636655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0420  Methyltransferase type 11  23.95 
 
 		 335 aa  61.2  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.849842 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3318  methyltransferase type 12  21.58 
 
 		 383 aa  60.1  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.434757 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2166  Methyltransferase type 12  21.14 
 
 		 397 aa  60.1  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3088  C-methyltransferase  21.26 
 
 		 406 aa  60.1  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3351  methyltransferase type 11  28.5 
 
 		 324 aa  59.3  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1135  putative NDP-hexose methyltransferase protein  24.3 
 
 		 407 aa  57.8  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0382  Methyltransferase type 11  22.92 
 
 		 298 aa  57.4  0.0000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2164  methyltransferase type 11  27.97 
 
 		 346 aa  57.8  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6557  methyltransferase type 12  24.27 
 
 		 425 aa  57.4  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  25 
 
 		 1340 aa  57.4  0.0000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0296  Methyltransferase type 12  26.71 
 
 		 326 aa  56.6  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14431  hypothetical protein  26.49 
 
 		 341 aa  56.2  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.131958  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4412  methyltransferase type 11  25 
 
 		 303 aa  56.2  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.033739  normal  0.97195 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2627  methyltransferase type 11  25.91 
 
 		 306 aa  55.8  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4598  Methyltransferase type 12  22.03 
 
 		 281 aa  55.1  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0453  hypothetical protein  23.93 
 
 		 305 aa  53.9  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0752  methyltransferase type 11  25.17 
 
 		 214 aa  53.9  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1345  hypothetical protein  29.41 
 
 		 231 aa  53.9  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1487  hypothetical protein  29.29 
 
 		 300 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.767872 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0934  methyltransferase type 12  24.57 
 
 		 228 aa  53.5  0.000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3910  hypothetical protein  22.26 
 
 		 305 aa  53.1  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.230808  normal  0.860748 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1217  Methyltransferase type 12  21.83 
 
 		 607 aa  53.1  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.861271  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3022  hypothetical protein  25.16 
 
 		 1124 aa  52.4  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0296  Methyltransferase type 12  26.25 
 
 		 326 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0995  methyltransferase, putative  28.49 
 
 		 291 aa  52.8  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2592  methyltransferase type 11  28.85 
 
 		 219 aa  52.8  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2814  glycosyl transferase family protein  24.53 
 
 		 457 aa  52.8  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1058  methyltransferase, putative  27.91 
 
 		 291 aa  52  0.00002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1566  putative sugar nucleotide processing enzyme  26.05 
 
 		 414 aa  51.6  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.445342 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0617  Methyltransferase type 12  23.47 
 
 		 310 aa  51.6  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0164647 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0814  methyltransferase, putative  27.91 
 
 		 291 aa  51.6  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.638021  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0163  putative methyltransferase  21.72 
 
 		 401 aa  52  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0150  putative methyltransferase  21.72 
 
 		 401 aa  51.6  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0742  Methyltransferase type 12  26.17 
 
 		 275 aa  51.2  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2510  hypothetical protein  26.95 
 
 		 308 aa  50.8  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1285  hypothetical protein  26.11 
 
 		 249 aa  50.8  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02860  hypothetical protein  25.9 
 
 		 215 aa  50.8  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.584838  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0566  methyltransferase, putative  26.23 
 
 		 291 aa  50.4  0.00005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1554  hypothetical protein  25.41 
 
 		 447 aa  50.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1578  hypothetical protein  25.41 
 
 		 447 aa  50.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.365139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2886  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  26.64 
 
 		 277 aa  50.1  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00412088 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1264  hypothetical protein  24.36 
 
 		 229 aa  50.1  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1794  methyltransferase type 12  26.95 
 
 		 336 aa  50.1  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1119  methyltransferase type 12  23.68 
 
 		 229 aa  50.1  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.582685  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0171  hypothetical protein  29.65 
 
 		 235 aa  50.1  0.00007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3380  Methyltransferase type 12  27.23 
 
 		 391 aa  49.7  0.00009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1565  methyltransferase type 12  29.93 
 
 		 396 aa  49.3  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.663655  normal  0.440278 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  24.84 
 
 		 1162 aa  49.3  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3347  methyltransferase  23.96 
 
 		 390 aa  48.9  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0988027  normal  0.589908 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4274  methyltransferase type 11  26.29 
 
 		 222 aa  48.9  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.254306  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3949  methyltransferase type 11  23.53 
 
 		 513 aa  49.3  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1471  Methyltransferase type 11  20.75 
 
 		 333 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.133968 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1332  hypothetical protein  22.08 
 
 		 229 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.999761  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1303  conserved hypothetical protein, methyltransferase type 12 domain  25.33 
 
 		 300 aa  48.9  0.0002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.193595  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1490  hypothetical protein  25.83 
 
 		 302 aa  48.5  0.0002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1106  O-antigen biosynthesis protein; glycosyltransferase; methyltransferase  22.73 
 
 		 229 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 348 aa  48.5  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0892  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1, 4-benzoquinol methylase  22.15 
 
 		 214 aa  48.1  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3474  Methyltransferase type 12  25 
 
 		 371 aa  48.9  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.253351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1370  hypothetical protein  22.08 
 
 		 229 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1348  methyltransferase type 11  25.24 
 
 		 286 aa  48.5  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.71095  hitchhiker  0.00964289 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3662  Methyltransferase type 12  22.18 
 
 		 391 aa  48.5  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.563292 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1749  Methyltransferase type 11  20.75 
 
 		 323 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.16946 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1471  methyltransferase type 11  20.75 
 
 		 323 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0736602 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4739  Methyltransferase type 12  22.18 
 
 		 391 aa  48.5  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.751981  normal  0.502527 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3232  hypothetical protein  28.45 
 
 		 323 aa  48.1  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.470904  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1306  hypothetical protein  30.41 
 
 		 297 aa  48.1  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.782095 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4083  Trans-aconitate 2-methyltransferase  23.36 
 
 		 257 aa  48.1  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.30188 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6563  C-methyltransferase  21.77 
 
 		 396 aa  48.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1132  hypothetical protein  22.08 
 
 		 229 aa  47.4  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1225  hypothetical protein  22.08 
 
 		 229 aa  47.4  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6261  Methyltransferase type 12  26.97 
 
 		 298 aa  47.8  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1293  hypothetical protein  22.08 
 
 		 229 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00493379 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4077  hypothetical protein  22.73 
 
 		 229 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1806  methyltransferase type 11  24.4 
 
 		 310 aa  47.8  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4987  C-methyltransferase  20.72 
 
 		 431 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1112  O-antigen biosynthesis protein; glycosyltransferase; methyltransferase  22.08 
 
 		 229 aa  47.4  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3711  Methyltransferase type 11  35.19 
 
 		 208 aa  47  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.157205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2011  hypothetical protein  21.21 
 
 		 199 aa  47  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.714234 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72030  hypothetical protein  25.91 
 
 		 287 aa  47  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  26.22 
 
 		 1177 aa  47  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1799  methyltransferase domain-containing protein  24.51 
 
 		 378 aa  47  0.0006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.2313  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4225  C-methyltransferase  25 
 
 		 407 aa  46.6  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.791496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  26.22 
 
 		 1177 aa  47  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3855  Methyltransferase type 12  26.29 
 
 		 249 aa  46.6  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.841093  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3318  hypothetical protein  25.17 
 
 		 243 aa  46.6  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1314  hypothetical protein  26.62 
 
 		 298 aa  46.6  0.0008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3735  Methyltransferase type 12  25.47 
 
 		 334 aa  46.6  0.0009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>