149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0467 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0467  methyltransferase type 11  100 
 
 		 309 aa  630  1e-179  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.167206  unclonable  0.0000104282 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0468  methyltransferase type 11  32.23 
 
 		 271 aa  122  6e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0745455  unclonable  0.0000106435 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3845  glycosyl transferase, group 1  30.42 
 
 		 802 aa  80.9  0.00000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.880485  normal  0.505849 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3114  Methyltransferase type 11  36.23 
 
 		 262 aa  77.8  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000861338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4283  methyltransferase type 11  27.22 
 
 		 257 aa  68.9  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.706274  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0490  Methyltransferase type 11  34.31 
 
 		 222 aa  59.7  0.00000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1345  hypothetical protein  38.24 
 
 		 231 aa  58.2  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3993  hypothetical protein  32.79 
 
 		 292 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.165995 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4270  methyltransferase type 11  33.64 
 
 		 279 aa  57.8  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1652  Methyltransferase type 11  29.44 
 
 		 279 aa  56.6  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1837  methyltransferase type 12  28.49 
 
 		 302 aa  55.8  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.322151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2132  methyltransferase type 11  42.39 
 
 		 274 aa  55.8  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2417  hypothetical protein  27.96 
 
 		 260 aa  54.3  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.320398  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2366  type 11 methyltransferase  31.17 
 
 		 233 aa  54.3  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0147512 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0849  methyltransferase type 11  43.55 
 
 		 283 aa  53.9  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.712211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2507  methyltransferase type 12  30.95 
 
 		 272 aa  53.5  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1616  hypothetical protein  36.14 
 
 		 238 aa  52.8  0.000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  34.65 
 
 		 244 aa  52.8  0.000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1888  hypothetical protein  26.02 
 
 		 346 aa  52.8  0.000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0956  methyltransferase type 11  42.62 
 
 		 262 aa  52.8  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1722  hypothetical protein  50 
 
 		 350 aa  52  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2593  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 238 aa  52.4  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0630  hypothetical protein  50 
 
 		 240 aa  51.2  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  30.86 
 
 		 1106 aa  51.6  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28280  methyltransferase family protein  33.33 
 
 		 258 aa  51.2  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.639383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1103  methyltransferase type 11  47.06 
 
 		 237 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292057  hitchhiker  0.000229506 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4005  hypothetical protein  32.38 
 
 		 250 aa  51.2  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.151604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  29.09 
 
 		 275 aa  50.8  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1428  Methyltransferase type 11  32.26 
 
 		 233 aa  50.8  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2874  type 11 methyltransferase  37.76 
 
 		 237 aa  50.1  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5441  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  41.07 
 
 		 248 aa  50.1  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0577674  normal  0.255989 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2234  Methyltransferase type 11  35.2 
 
 		 255 aa  50.1  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.227715  hitchhiker  0.000669188 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6056  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 248 aa  49.7  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0844  UbiE/COQ5 methyltransferase  26.24 
 
 		 269 aa  49.3  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0352  Methyltransferase type 11  28.46 
 
 		 249 aa  49.7  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0632  glycosyl transferase family protein  31.31 
 
 		 1312 aa  49.3  0.00009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.900451 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_51145  predicted protein  30.95 
 
 		 363 aa  49.3  0.00009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4002  methyltransferase type 11  30.71 
 
 		 276 aa  49.3  0.00009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2633  hypothetical protein  31.13 
 
 		 244 aa  48.5  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4238  Methyltransferase type 11  26.21 
 
 		 237 aa  48.5  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0484  putative methyltransferase  31.82 
 
 		 240 aa  48.5  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0463  methyltransferase type 11  47.27 
 
 		 197 aa  48.5  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.115014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6865  Methyltransferase type 11  30.23 
 
 		 282 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3059  methyltransferase type 11  34.92 
 
 		 238 aa  48.9  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0780  glycosyl transferase, group 1  27.87 
 
 		 711 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3889  methyltransferase type 11  43.64 
 
 		 281 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.972662 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1430  Methyltransferase type 11  34.83 
 
 		 205 aa  48.5  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.406205  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2918  Methyltransferase type 11  34.38 
 
 		 248 aa  48.1  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0444641  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0572  hypothetical protein  31.25 
 
 		 243 aa  47.8  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.519811  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1561  Methyltransferase type 11  25.17 
 
 		 283 aa  47.8  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.160915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5464  Methyltransferase type 11  53.49 
 
 		 212 aa  47.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.873364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1285  hypothetical protein  34.86 
 
 		 249 aa  47.8  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5101  methyltransferase type 11  44.9 
 
 		 243 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5189  methyltransferase type 11  44.9 
 
 		 243 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167139  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0390  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 239 aa  48.1  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.614689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5480  methyltransferase type 11  44.9 
 
 		 243 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.690261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2493  methyltransferase type 11  46.94 
 
 		 238 aa  47.8  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0424755  normal  0.184077 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3646  glycosyl transferase family protein  31.73 
 
 		 507 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027326 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4274  methyltransferase type 11  40.98 
 
 		 222 aa  47.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.254306  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3452  methyltransferase type 11  26.96 
 
 		 231 aa  47.8  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03273  PKS-like enzyme, putative (JCVI)  32.14 
 
 		 1730 aa  47.4  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.102445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0011  methyltransferase type 11  35.23 
 
 		 243 aa  47.4  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2098  methyltransferase type 11  30.3 
 
 		 263 aa  47.8  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0192  glycosyl transferase family protein  30.53 
 
 		 996 aa  47.8  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1318  glycosyl transferase family protein  25.43 
 
 		 1314 aa  47.8  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.581884  normal  0.368047 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4175  methyltransferase type 11  36.36 
 
 		 279 aa  47.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2358  Methyltransferase type 11  43.14 
 
 		 634 aa  47.4  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.295252  hitchhiker  0.00225016 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2110  methyltransferase type 11  30.97 
 
 		 266 aa  47.8  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.594236 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72030  hypothetical protein  41.18 
 
 		 287 aa  47  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0028  glycosyl transferase group 1  41.27 
 
 		 710 aa  47  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  31.58 
 
 		 240 aa  47  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2539  Methyltransferase type 11  41.38 
 
 		 237 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.459192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1529  ArsR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 337 aa  46.6  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3275  Methyltransferase type 11  34.34 
 
 		 511 aa  46.6  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4260  methyltransferase type 11  29.29 
 
 		 261 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3261  Methyltransferase type 11  35.96 
 
 		 264 aa  46.6  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0732  methyltransferase type 11  31.52 
 
 		 237 aa  46.2  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.358682 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4655  Methyltransferase type 11  29.69 
 
 		 310 aa  46.2  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0904903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3941  methyltransferase type 11  46.81 
 
 		 237 aa  45.8  0.0009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0747  hypothetical protein  33.87 
 
 		 230 aa  45.4  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.034536  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1320  Methyltransferase type 11  48.94 
 
 		 315 aa  45.4  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.065684 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4266  methyltransferase type 11  28.95 
 
 		 256 aa  45.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.985163  normal  0.26538 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4088  glycosyl transferase family protein  46.81 
 
 		 1032 aa  45.8  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.127971 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5881  methyltransferase type 11  40 
 
 		 237 aa  45.8  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2138  Methyltransferase type 11  47.06 
 
 		 237 aa  45.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5499  Methyltransferase type 11  28.97 
 
 		 196 aa  44.3  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2520  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  30.56 
 
 		 233 aa  45.1  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.783143  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2131  hypothetical protein  24.32 
 
 		 220 aa  44.7  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.967434  normal  0.0119772 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4082  Methyltransferase type 11  33.71 
 
 		 235 aa  44.3  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3236  methyltransferase type 11  47.73 
 
 		 239 aa  45.1  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5717  methyltransferase type 11  42.86 
 
 		 241 aa  44.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.753035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0883  Methyltransferase type 11  44.44 
 
 		 282 aa  44.7  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.049134 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4464  Methyltransferase type 12  22.81 
 
 		 543 aa  44.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6874  Methyltransferase type 11  48.94 
 
 		 260 aa  45.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.413969  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3876  Methyltransferase type 11  45.83 
 
 		 241 aa  44.7  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2597  methyltransferase type 11  27.73 
 
 		 236 aa  44.7  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.254327  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2736  Methyltransferase type 11  30.46 
 
 		 225 aa  45.1  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_14191  predicted protein  31.11 
 
 		 225 aa  44.7  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8231  methyltransferase type 11  49.02 
 
 		 237 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1977  hypothetical protein  32.47 
 
 		 217 aa  44.3  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.183577  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>