75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1618 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1618  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 299 aa  623  1e-177  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1262  methyltransferase type 11  40.38 
 
 		 232 aa  108  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.978798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0509  methyltransferase type 11  39.74 
 
 		 232 aa  107  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.427696  normal  0.940294 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3712  Methyltransferase type 11  32.24 
 
 		 244 aa  90.9  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.435938  normal  0.0474323 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2036  Methyltransferase type 11  35.07 
 
 		 268 aa  64.7  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0026  methyltransferase type 11  32.84 
 
 		 262 aa  63.9  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2007  methyltransferase type 11  52.63 
 
 		 239 aa  52.4  0.000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4470  Methyltransferase type 11  30.25 
 
 		 252 aa  50.4  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.09133  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1474  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  33.05 
 
 		 255 aa  50.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.760771  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0636  Methyltransferase type 11  35.29 
 
 		 228 aa  49.7  0.00006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0381586  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0994  methyltransferase type 11  35.45 
 
 		 245 aa  48.5  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.295346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6253  methyltransferase domain-containing protein  29.27 
 
 		 276 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.812952  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0484  putative methyltransferase  47.17 
 
 		 240 aa  47  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3111  Methyltransferase type 11  42.37 
 
 		 241 aa  46.6  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12118  Glycosyltransferase  43.1 
 
 		 255 aa  46.2  0.0006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0860161  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3974  methyltransferase type 11  41.18 
 
 		 284 aa  46.2  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  46.67 
 
 		 255 aa  46.2  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2257  hypothetical protein  45.45 
 
 		 58 aa  45.8  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.523879  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5717  methyltransferase type 11  40.79 
 
 		 241 aa  45.8  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.753035  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3663  hypothetical protein  31.63 
 
 		 262 aa  45.1  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3743  methyltransferase type 11  36.04 
 
 		 331 aa  45.8  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1510  hypothetical protein  33.68 
 
 		 247 aa  45.8  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.702399  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2453  methyltransferase type 12  45.1 
 
 		 542 aa  45.8  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0498  methyltransferase type 11  28.41 
 
 		 235 aa  45.1  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3006  methyltransferase type 11  32.41 
 
 		 305 aa  45.4  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0634  hypothetical protein  35.37 
 
 		 227 aa  45.4  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00503727  hitchhiker  0.0000898788 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1633  Methyltransferase type 11  42.22 
 
 		 264 aa  44.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0213004 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6255  methyltransferase domain-containing protein  36.75 
 
 		 257 aa  44.3  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.88528  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3815  methyltransferase type 11  43.33 
 
 		 271 aa  44.7  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.577541  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0807  type 11 methyltransferase  32.14 
 
 		 245 aa  44.3  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.887141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0215  UbiE/COQ5 family methlytransferase  29.69 
 
 		 256 aa  45.1  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.383656  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0010  Methyltransferase type 11  36.67 
 
 		 248 aa  44.3  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_74165  predicted protein  39.13 
 
 		 275 aa  44.7  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.426608 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1981  Methyltransferase type 11  47.83 
 
 		 201 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.020374  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3983  methyltransferase type 11  37.89 
 
 		 293 aa  44.3  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.307607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4270  methyltransferase type 11  41.3 
 
 		 279 aa  43.9  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1898  methyltransferase type 11  47.83 
 
 		 201 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0160246  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0390  Methyltransferase type 11  52.63 
 
 		 194 aa  43.9  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3081  methyltransferase type 11  31.65 
 
 		 258 aa  43.9  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.609499  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2066  Methyltransferase type 11  47.83 
 
 		 201 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.240565  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  46.67 
 
 		 265 aa  43.5  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3630  Methyltransferase type 11  43.33 
 
 		 272 aa  43.9  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2138  Methyltransferase type 11  37.66 
 
 		 237 aa  43.5  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3357  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 211 aa  43.5  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2374  methyltransferase type 11  29.41 
 
 		 212 aa  43.5  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.404257 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0011  methyltransferase type 11  32.79 
 
 		 289 aa  43.5  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2358  Methyltransferase type 11  42.37 
 
 		 634 aa  43.5  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.295252  hitchhiker  0.00225016 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2999  methyltransferase type 11  32.29 
 
 		 246 aa  43.5  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0921858  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002771  SAM-dependent methyltransferase  33.33 
 
 		 248 aa  43.1  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.531144  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0224  UbiE/COQ5 family methlytransferase  29.69 
 
 		 256 aa  43.1  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.234424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4655  Methyltransferase type 11  30.15 
 
 		 310 aa  43.1  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0904903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1100  methyltransferase type 11  39.47 
 
 		 241 aa  43.5  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.613335  normal  0.68068 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0214  UbiE/COQ5 family methlytransferase  28.91 
 
 		 256 aa  43.1  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00594444  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2874  type 11 methyltransferase  41.18 
 
 		 237 aa  43.1  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2883  methyltransferase type 11  34.41 
 
 		 221 aa  43.1  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0898399  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3143  hypothetical protein  27.78 
 
 		 216 aa  43.1  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0708214  normal  0.0392147 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0740  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.33 
 
 		 253 aa  43.1  0.006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1141  methyltransferase type 11  25.69 
 
 		 236 aa  43.1  0.006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8231  methyltransferase type 11  42.65 
 
 		 237 aa  42.7  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  26.35 
 
 		 258 aa  42.7  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0860  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  26.83 
 
 		 243 aa  42.7  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0650412 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0756  methyltransferase type 11  30.4 
 
 		 234 aa  42.7  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.055358 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2367  Methyltransferase type 11  51.35 
 
 		 270 aa  42.7  0.007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2465  hypothetical protein  30 
 
 		 246 aa  42.7  0.008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.16743  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0046  methyltransferase type 11  26.23 
 
 		 236 aa  42.7  0.008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.260962  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1761  methyltransferase type 11  42.86 
 
 		 257 aa  42.7  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2132  methyltransferase type 11  48.94 
 
 		 274 aa  42.4  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1345  transcriptional regulator, ArsR family  46.51 
 
 		 305 aa  42.4  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.773476  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30580  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  41.82 
 
 		 272 aa  42.4  0.009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2939  transcriptional regulator, ArsR family  46.51 
 
 		 307 aa  42.4  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3093  hypothetical protein  41.3 
 
 		 70 aa  42.4  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2320  Methyltransferase type 11  42.86 
 
 		 239 aa  42.4  0.01  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.46525  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0718  protein of unknown function DUF343  47.62 
 
 		 67 aa  42.4  0.01  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.021704  normal  0.638292 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0222  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  29.31 
 
 		 256 aa  42.4  0.01  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.188409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0228  Methyltransferase type 11  46.67 
 
 		 243 aa  42.4  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000960813  normal  0.184474 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>