80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3615 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3615  methyltransferase type 11  100 
 
 
266 aa  561  1.0000000000000001e-159  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.134512 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3152  methyltransferase type 11  32.89 
 
 
254 aa  125  1e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.23938  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0235  Methyltransferase type 11  31.93 
 
 
242 aa  59.7  0.00000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0390  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
194 aa  55.8  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0636  Methyltransferase type 11  36.67 
 
 
228 aa  52.4  0.000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0381586  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4270  methyltransferase type 11  28.14 
 
 
279 aa  52.4  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1562  Methyltransferase type 11  30.81 
 
 
243 aa  51.6  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.940117 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2494  hypothetical protein  32.99 
 
 
194 aa  52  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00130351  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6043  methionine biosynthesis protein MetW  35.71 
 
 
194 aa  49.7  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0490  Methyltransferase type 11  30.87 
 
 
222 aa  49.3  0.00006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2059  methionine biosynthesis protein MetW  35.42 
 
 
206 aa  48.9  0.00009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00118741  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0429  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  38.83 
 
 
764 aa  48.9  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5098  methionine biosynthesis protein MetW  35.42 
 
 
212 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.435221  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4971  methionine biosynthesis protein MetW  35.42 
 
 
206 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4333  methionine biosynthesis protein MetW  25.3 
 
 
196 aa  48.5  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  34.86 
 
 
240 aa  48.5  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5148  methionine biosynthesis protein MetW  35.42 
 
 
206 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.740945  normal  0.654734 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0626  methyltransferase type 11  33.64 
 
 
224 aa  48.1  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00710227 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0374  hypothetical protein  35.42 
 
 
205 aa  47.8  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.826237 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0010  Methyltransferase type 11  44 
 
 
248 aa  47.4  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3059  methyltransferase type 11  36.9 
 
 
238 aa  48.1  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4470  Methyltransferase type 11  29.79 
 
 
252 aa  47.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.09133  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0028  glycosyl transferase group 1  35 
 
 
710 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4777  methionine biosynthesis protein MetW  36.73 
 
 
194 aa  47.4  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0956  methyltransferase type 11  34.41 
 
 
487 aa  47.4  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0129  methionine biosynthesis MetW  35.42 
 
 
203 aa  47.4  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2987  Methyltransferase type 11  32.67 
 
 
290 aa  47.4  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0355  methyltransferase type 11  25.81 
 
 
299 aa  47  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.970356 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3583  hypothetical protein  36.73 
 
 
194 aa  47  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.134233  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0413  methionine biosynthesis MetW  35.42 
 
 
205 aa  47.4  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0367  methionine biosynthesis protein MetW  35.42 
 
 
206 aa  47  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.802939  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0445  Methyltransferase type 11  34.69 
 
 
399 aa  46.6  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.832039  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1255  Methyltransferase type 11  41.51 
 
 
154 aa  46.6  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1722  hypothetical protein  32.74 
 
 
350 aa  46.6  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3275  Methyltransferase type 11  39.02 
 
 
511 aa  46.6  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0146  methionine biosynthesis protein MetW  46 
 
 
194 aa  46.6  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.990375  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3143  hypothetical protein  35.59 
 
 
216 aa  47  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0708214  normal  0.0392147 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2546  hypothetical protein  28.81 
 
 
280 aa  46.6  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.346853  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1867  hypothetical protein  33.33 
 
 
213 aa  46.2  0.0005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5499  Methyltransferase type 11  29.45 
 
 
196 aa  46.6  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456016  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0780  glycosyl transferase, group 1  35.64 
 
 
711 aa  46.2  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3712  Methyltransferase type 11  41.82 
 
 
244 aa  46.2  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.435938  normal  0.0474323 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0994  methyltransferase type 11  32.38 
 
 
245 aa  45.8  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.295346  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2175  Methyltransferase type 11  43.1 
 
 
221 aa  45.4  0.0008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.300294  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3357  Methyltransferase type 11  27.74 
 
 
211 aa  45.8  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1454  methyltransferase type 11  37.38 
 
 
197 aa  45.4  0.0009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.398758  normal  0.372191 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5324  methionine biosynthesis MetW  33.61 
 
 
206 aa  45.4  0.0009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.414864 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05070  putative methionine biosynthesis protein  34.34 
 
 
206 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3482  methionine biosynthesis protein MetW  42 
 
 
194 aa  45.1  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0405  methionine biosynthesis MetW  31.4 
 
 
193 aa  45.4  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0488  methionine biosynthesis protein MetW  34.34 
 
 
206 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0312  hypothetical protein  31.78 
 
 
216 aa  45.1  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.121352 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4124  methionine biosynthesis protein MetW  42 
 
 
194 aa  45.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3989  Methyltransferase type 11  34.62 
 
 
249 aa  45.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.169635  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0473  methionine biosynthesis MetW  32.79 
 
 
206 aa  44.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5050  metW protein  32.79 
 
 
206 aa  44.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3134  Methyltransferase type 11  24.66 
 
 
254 aa  44.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.578288  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5678  hypothetical protein  40 
 
 
294 aa  44.3  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.622302  normal  0.945039 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5287  methionine biosynthesis protein MetW  33.33 
 
 
195 aa  44.3  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0337  methionine biosynthesis protein MetW  30.21 
 
 
202 aa  44.3  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4156  methionine biosynthesis protein MetW  36.36 
 
 
206 aa  44.3  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4381  methyltransferase type 11  29.17 
 
 
221 aa  44.3  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0292  methionine biosynthesis protein MetW  31.31 
 
 
201 aa  43.9  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0468  methionine biosynthesis protein MetW  31.31 
 
 
201 aa  43.9  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.392633  hitchhiker  0.000505408 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0972  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 
269 aa  43.9  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.191025  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0228  Methyltransferase type 11  43.75 
 
 
243 aa  43.5  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000960813  normal  0.184474 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3645  DNA repair protein RadC  33.04 
 
 
198 aa  43.1  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4888  methionine biosynthesis MetW  30.21 
 
 
202 aa  43.1  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3743  methyltransferase type 11  31.73 
 
 
331 aa  43.1  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0630  hypothetical protein  35.11 
 
 
240 aa  43.1  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0854  methyltransferase type 11  34.18 
 
 
266 aa  43.1  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.860107  normal  0.0122771 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4283  methyltransferase type 11  45.28 
 
 
257 aa  43.1  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.706274  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1121  methyltransferase type 11  32.89 
 
 
293 aa  42.7  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.536452  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2374  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
212 aa  42.7  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.404257 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  32.69 
 
 
225 aa  42.7  0.007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1540  methyltransferase type 11  30.61 
 
 
402 aa  42.4  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000274527  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0322  methionine biosynthesis protein MetW  36.11 
 
 
194 aa  42.4  0.008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03030  methionine biosynthesis protein MetW  30.33 
 
 
199 aa  42.4  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.767976  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0320  methyltransferase type 11  29.17 
 
 
1082 aa  42  0.01  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0427  methyltransferase type 11  27.78 
 
 
255 aa  42  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0100064  normal  0.299487 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>