212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3645 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3645  DNA repair protein RadC  100 
 
 		 198 aa  412  1e-114  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0488  methionine biosynthesis protein MetW  60.51 
 
 		 206 aa  256  1e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05070  putative methionine biosynthesis protein  60.51 
 
 		 206 aa  256  1e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5050  metW protein  61.22 
 
 		 206 aa  253  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0473  methionine biosynthesis MetW  60.71 
 
 		 206 aa  252  3e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0367  methionine biosynthesis protein MetW  60.2 
 
 		 206 aa  252  3e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.802939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5148  methionine biosynthesis protein MetW  60.2 
 
 		 206 aa  251  7e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.740945  normal  0.654734 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5098  methionine biosynthesis protein MetW  60.2 
 
 		 212 aa  250  8.000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.435221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4971  methionine biosynthesis protein MetW  60.2 
 
 		 206 aa  250  9.000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5324  methionine biosynthesis MetW  59.69 
 
 		 206 aa  249  2e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414864 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4156  methionine biosynthesis protein MetW  58.46 
 
 		 206 aa  249  2e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03030  methionine biosynthesis protein MetW  57.65 
 
 		 199 aa  247  8e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.767976  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0531  methionine biosynthesis protein MetW  55.56 
 
 		 200 aa  246  2e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2059  methionine biosynthesis protein MetW  56.1 
 
 		 206 aa  243  1.9999999999999999e-63  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00118741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0413  methionine biosynthesis MetW  54.95 
 
 		 205 aa  239  2e-62  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0374  hypothetical protein  54.19 
 
 		 205 aa  238  4e-62  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.826237 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4333  methionine biosynthesis protein MetW  54.08 
 
 		 196 aa  233  2.0000000000000002e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0337  methionine biosynthesis protein MetW  50.51 
 
 		 202 aa  226  2e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3058  methionine biosynthesis MetW  51.53 
 
 		 203 aa  221  4.9999999999999996e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.109944  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0950  methionine biosynthesis protein MetW  50.51 
 
 		 204 aa  220  9.999999999999999e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.341803  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0468  methionine biosynthesis protein MetW  51.3 
 
 		 201 aa  219  3e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.392633  hitchhiker  0.000505408 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0292  methionine biosynthesis protein MetW  51.3 
 
 		 201 aa  219  3e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0222  methionine biosynthesis MetW  46.43 
 
 		 206 aa  208  4e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2010  methionine biosynthesis protein MetW  49.74 
 
 		 197 aa  207  8e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1727  methionine biosynthesis protein MetW  48.72 
 
 		 197 aa  207  9e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.53712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2481  methionine biosynthesis MetW  48.21 
 
 		 209 aa  207  1e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3724  methionine biosynthesis protein MetW  51.3 
 
 		 211 aa  206  2e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0144  methionine biosynthesis MetW  51.03 
 
 		 203 aa  206  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.477783 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0187  methionine biosynthesis MetW  50 
 
 		 203 aa  204  6e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3401  methionine biosynthesis protein MetW  50.26 
 
 		 211 aa  203  2e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1840  methionine biosynthesis MetW  49.49 
 
 		 205 aa  201  5e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0560635  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0026  hypothetical protein  49.74 
 
 		 215 aa  200  9.999999999999999e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.366115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0129  methionine biosynthesis MetW  47.21 
 
 		 203 aa  194  5.000000000000001e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1836  methionine biosynthesis protein MetW  43.15 
 
 		 200 aa  194  7e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3155  methionine biosynthesis protein MetW  47.69 
 
 		 202 aa  191  5e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6451  methionine biosynthesis MetW  47.69 
 
 		 202 aa  191  7e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.685724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3116  methionine biosynthesis protein MetW  47.69 
 
 		 202 aa  191  7e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2486  methionine biosynthesis MetW  47.69 
 
 		 202 aa  191  7e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3100  methionine biosynthesis protein MetW  47.69 
 
 		 202 aa  191  7e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.698233  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3038  methionine biosynthesis protein MetW  47.69 
 
 		 202 aa  191  7e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0060  methionine biosynthesis protein MetW  48.72 
 
 		 202 aa  187  7e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.866888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0156  methionine biosynthesis protein MetW  48.98 
 
 		 204 aa  187  1e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4067  methionine biosynthesis protein MetW  47.96 
 
 		 196 aa  186  1e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.554344  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1580  methionine biosynthesis protein MetW  45.45 
 
 		 208 aa  186  1e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.216776 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3245  methionine biosynthesis protein MetW  48.98 
 
 		 204 aa  185  3e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1759  methionine biosynthesis protein MetW  42.56 
 
 		 229 aa  186  3e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.531023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0376  methionine biosynthesis protein MetW  48.98 
 
 		 204 aa  185  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1535  methionine biosynthesis protein MetW  42.56 
 
 		 229 aa  186  3e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0530604 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3191  methionine biosynthesis protein MetW  46.45 
 
 		 210 aa  185  3e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2095  methionine biosynthesis protein MetW  42.56 
 
 		 229 aa  186  3e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.273549  normal  0.170685 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2906  methionine biosynthesis protein MetW  48.98 
 
 		 204 aa  185  3e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3442  methionine biosynthesis protein MetW  48.98 
 
 		 204 aa  185  3e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2183  methionine biosynthesis protein MetW  48.98 
 
 		 204 aa  185  3e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.318546  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0181  methionine biosynthesis protein MetW  48.98 
 
 		 204 aa  186  3e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.47681  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0191  methionine biosynthesis protein MetW  48.98 
 
 		 204 aa  185  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0586  methionine biosynthesis MetW  44.72 
 
 		 229 aa  184  7e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3097  methionine biosynthesis protein MetW  48.21 
 
 		 202 aa  184  8e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.588077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3482  methionine biosynthesis protein MetW  46.39 
 
 		 194 aa  183  1.0000000000000001e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0726  methionine biosynthesis protein MetW  43.88 
 
 		 221 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.263476  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3267  methionine biosynthesis MetW  49.08 
 
 		 211 aa  183  1.0000000000000001e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0751  methionine biosynthesis protein MetW  38.89 
 
 		 211 aa  183  1.0000000000000001e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4777  methionine biosynthesis protein MetW  48.92 
 
 		 194 aa  183  1.0000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4124  methionine biosynthesis protein MetW  46.39 
 
 		 194 aa  183  1.0000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3583  hypothetical protein  44.62 
 
 		 194 aa  183  1.0000000000000001e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.134233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0334  methionine biosynthesis protein MetW  46.43 
 
 		 202 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4389  hypothetical protein  46.43 
 
 		 202 aa  182  3e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1109  methionine biosynthesis protein MetW  43.59 
 
 		 220 aa  182  3e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.331654  normal  0.297557 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6043  methionine biosynthesis protein MetW  46.52 
 
 		 194 aa  181  6e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0146  methionine biosynthesis protein MetW  45.99 
 
 		 194 aa  180  1e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.990375  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5287  methionine biosynthesis protein MetW  44.56 
 
 		 195 aa  179  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0677  methionine biosynthesis MetW  43.72 
 
 		 222 aa  179  2e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.772339  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1910  methionine biosynthesis protein MetW  44.22 
 
 		 217 aa  179  2.9999999999999997e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.166316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1880  methionine biosynthesis protein MetW  41.03 
 
 		 242 aa  178  4e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0239131 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1187  putative methionine biosynthesis protein (MetW)  43.22 
 
 		 220 aa  177  5.999999999999999e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0384  methionine biosynthesis protein MetW  41.71 
 
 		 222 aa  176  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0405  methionine biosynthesis MetW  44.5 
 
 		 193 aa  176  3e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1024  methionine biosynthesis protein MetW  42.64 
 
 		 214 aa  175  3e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0141813 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0574  methionine biosynthesis protein MetW  40.91 
 
 		 215 aa  172  1.9999999999999998e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4251  methionine biosynthesis MetW  41.21 
 
 		 231 aa  170  1e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4280  methionine biosynthesis MetW  41.21 
 
 		 222 aa  170  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.558319  normal  0.118746 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4098  methionine biosynthesis MetW  40.7 
 
 		 230 aa  169  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4101  methionine biosynthesis protein MetW  42.49 
 
 		 202 aa  166  2e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.415093 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1426  methionine biosynthesis protein MetW  40.82 
 
 		 229 aa  164  8e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0713  methionine biosynthesis protein MetW  42.49 
 
 		 197 aa  164  1.0000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.749349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4924  methionine biosynthesis protein MetW  40.2 
 
 		 231 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4888  methionine biosynthesis MetW  42.86 
 
 		 202 aa  160  9e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0436  methionine biosynthesis protein MetW  40.61 
 
 		 217 aa  159  2e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3135  methionine biosynthesis protein MetW  39.69 
 
 		 201 aa  157  9e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.105101  normal  0.147398 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3004  methionine biosynthesis protein MetW  40.62 
 
 		 195 aa  156  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2133  methionine biosynthesis protein MetW  36.73 
 
 		 210 aa  156  2e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0322  methionine biosynthesis protein MetW  44.62 
 
 		 194 aa  151  5.9999999999999996e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2885  methionine biosynthesis MetW  42.94 
 
 		 195 aa  148  4e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1469  methionine biosynthesis MetW protein  34.72 
 
 		 201 aa  123  2e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.393551  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3823  glycosyl transferase family 2  27.52 
 
 		 1523 aa  58.5  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.588357 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0299  methionine biosynthesis protein MetW  34.15 
 
 		 247 aa  57.4  0.0000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.974388  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0632  glycosyl transferase family protein  29.41 
 
 		 1312 aa  55.8  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.900451 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5502  Methyltransferase type 12  28.23 
 
 		 217 aa  55.1  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.222085  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0126  Methyltransferase type 12  34.26 
 
 		 415 aa  53.9  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0105171  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1352  hypothetical protein  31.63 
 
 		 206 aa  53.1  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4464  Methyltransferase type 12  24.79 
 
 		 543 aa  52.8  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>