93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1562 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_1562  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 243 aa  500  1e-140  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.940117 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1867  hypothetical protein  54.72 
 
 		 213 aa  242  5e-63  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0010  Methyltransferase type 11  34.33 
 
 		 248 aa  62.4  0.000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4425  methyltransferase type 11  32.73 
 
 		 262 aa  58.2  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.102836  normal  0.287125 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0026  methyltransferase type 11  29.69 
 
 		 262 aa  55.5  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2036  Methyltransferase type 11  31.78 
 
 		 268 aa  54.3  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2167  methyltransferase type 11  30.53 
 
 		 394 aa  53.9  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0756  methyltransferase type 11  34.51 
 
 		 234 aa  52.4  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.055358 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  30.08 
 
 		 345 aa  52.4  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2461  Methyltransferase type 11  36.94 
 
 		 265 aa  52.4  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00379  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.53 
 
 		 239 aa  52  0.000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.296609  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3615  methyltransferase type 11  30.81 
 
 		 266 aa  51.6  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.134512 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2403  Methyltransferase type 11  29.46 
 
 		 262 aa  51.6  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4152  Methyltransferase type 11  33.58 
 
 		 239 aa  51.2  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.101054 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0930  Methyltransferase type 11  33.6 
 
 		 203 aa  50.8  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140476  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4381  methyltransferase type 11  35.34 
 
 		 221 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4779  Methyltransferase type 11  34.29 
 
 		 264 aa  50.1  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766265 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0355  methyltransferase type 11  35.45 
 
 		 299 aa  49.7  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.970356 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3152  methyltransferase type 11  27.51 
 
 		 254 aa  48.5  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.23938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3425  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  27.14 
 
 		 258 aa  47.8  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000129288 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0956  methyltransferase type 11  32.35 
 
 		 487 aa  47.8  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2296  Methyltransferase type 11  29.07 
 
 		 209 aa  47.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000023308  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0720  methyltransferase type 11  36.13 
 
 		 225 aa  47.4  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3941  methyltransferase type 11  31.53 
 
 		 237 aa  47.4  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4394  Methyltransferase type 11  31.08 
 
 		 192 aa  47  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2893  methyltransferase type 11  35.87 
 
 		 317 aa  47  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3111  Methyltransferase type 11  26.55 
 
 		 241 aa  46.6  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2729  Methyltransferase type 11  34.17 
 
 		 317 aa  46.6  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1103  methyltransferase type 11  30.63 
 
 		 237 aa  46.2  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292057  hitchhiker  0.000229506 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3989  Methyltransferase type 11  35.24 
 
 		 249 aa  46.2  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.169635  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2147  methyltransferase type 11  47.83 
 
 		 213 aa  45.8  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0183  methyltransferase type 11  28.21 
 
 		 223 aa  45.4  0.0008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0293588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1677  hypothetical protein  34.45 
 
 		 225 aa  45.4  0.0008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00018407 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1092  methyltransferase type 11  31.25 
 
 		 224 aa  45.4  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1227  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.79 
 
 		 232 aa  45.4  0.0008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000143556  normal  0.238391 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2367  Methyltransferase type 11  33.98 
 
 		 270 aa  45.1  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4848  Methyltransferase type 11  30.89 
 
 		 241 aa  45.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0222  Methyltransferase type 11  36.04 
 
 		 266 aa  44.7  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100135  normal  0.562756 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0420  Methyltransferase type 11  26.28 
 
 		 335 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.849842 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0373  Methyltransferase type 11  31.36 
 
 		 222 aa  45.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1198  Methyltransferase type 11  35.51 
 
 		 272 aa  44.7  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0212  hypothetical protein  25.19 
 
 		 231 aa  45.1  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1056  methyltransferase type 11  28.33 
 
 		 221 aa  44.7  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.270016  normal  0.802402 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0686  methyltransferase type 11  25.32 
 
 		 201 aa  45.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.896648  normal  0.0113897 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2318  methyltransferase type 11  32.74 
 
 		 187 aa  45.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0735638 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3266  hypothetical protein  29.7 
 
 		 400 aa  44.3  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0626  methyltransferase type 11  33.6 
 
 		 224 aa  44.3  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00710227 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1168  Methyltransferase type 11  32.85 
 
 		 267 aa  43.9  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0492  phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  32.33 
 
 		 232 aa  43.9  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578084 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  25.21 
 
 		 263 aa  44.3  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10980  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  34.95 
 
 		 296 aa  44.3  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2320  methyltransferase type 11  32.73 
 
 		 205 aa  43.9  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.107701  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1480  hypothetical protein  31.11 
 
 		 239 aa  43.9  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.596221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1631  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.52 
 
 		 246 aa  44.3  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0264  Methyltransferase type 11  31.13 
 
 		 252 aa  44.3  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.767056 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1574  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.52 
 
 		 246 aa  43.9  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14381  hypothetical protein  28.43 
 
 		 239 aa  43.5  0.003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2786  Methyltransferase type 11  33.65 
 
 		 188 aa  43.9  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0321323 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4233  Methyltransferase type 11  34.82 
 
 		 274 aa  43.5  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  29.77 
 
 		 225 aa  43.5  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0994  methyltransferase type 11  30.09 
 
 		 245 aa  43.5  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.295346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2740  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.53 
 
 		 238 aa  43.1  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1474  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  32.74 
 
 		 255 aa  43.1  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.760771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4283  methyltransferase type 11  30.1 
 
 		 257 aa  43.1  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.706274  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0742  Methyltransferase type 12  31.13 
 
 		 275 aa  43.1  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0572  hypothetical protein  32.14 
 
 		 243 aa  43.1  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.519811  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0011  methyltransferase type 11  33.98 
 
 		 289 aa  42.7  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11432  methyltransferase  34 
 
 		 274 aa  42.7  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000106328  normal  0.345839 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0208  methyltransferase type 11  30.7 
 
 		 252 aa  42.7  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3889  methyltransferase type 11  28.46 
 
 		 281 aa  42.4  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.972662 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1437  methyltransferase type 11  31.3 
 
 		 210 aa  42.4  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00131296  decreased coverage  0.0000500722 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0807  type 11 methyltransferase  30.97 
 
 		 245 aa  42.4  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.887141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0849  methyltransferase type 11  26.72 
 
 		 283 aa  42.4  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.712211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5243  hypothetical protein  29.69 
 
 		 231 aa  42.4  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.204365  normal  0.202223 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4655  Methyltransferase type 11  28.22 
 
 		 310 aa  42.4  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0904903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4110  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 302 aa  42.4  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.55861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2661  hypothetical protein  44.44 
 
 		 261 aa  42  0.008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.588792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0228  methyltransferase type 11  30.7 
 
 		 252 aa  42  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.237973  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3234  Methyltransferase type 11  41.67 
 
 		 235 aa  42  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0405  methionine biosynthesis MetW  29.3 
 
 		 193 aa  42  0.008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2987  Methyltransferase type 11  29.63 
 
 		 290 aa  42  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0939  Methyltransferase type 12  21.67 
 
 		 232 aa  42.4  0.008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0218  methyltransferase type 11  30.7 
 
 		 252 aa  42  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.679298  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3275  Methyltransferase type 11  26.92 
 
 		 511 aa  42  0.009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13054  hypothetical protein  34.23 
 
 		 327 aa  42  0.009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.100828 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1851  methyltransferase type 11  34.19 
 
 		 275 aa  41.6  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.249225 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0254  Methyltransferase type 11  35.29 
 
 		 273 aa  42  0.01  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1616  hypothetical protein  24.46 
 
 		 238 aa  41.6  0.01  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0972  Methyltransferase type 11  32.31 
 
 		 269 aa  42  0.01  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.191025  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3370  Methyltransferase type 11  30.47 
 
 		 253 aa  42  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627677  normal  0.442858 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  30.53 
 
 		 258 aa  42  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2022  hypothetical protein  32.65 
 
 		 261 aa  42  0.01  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.891913  normal  0.0390381 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1804  methyltransferase type 11  34.19 
 
 		 275 aa  41.6  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.204587  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>