More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2147 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_2147  methyltransferase type 11  100 
 
 
213 aa  432  1e-120  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0390  Methyltransferase type 11  39.58 
 
 
194 aa  70.5  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2905  Methyltransferase type 11  38.18 
 
 
234 aa  65.9  0.0000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3983  methyltransferase type 11  36.67 
 
 
293 aa  62.4  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.307607  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3206  Methyltransferase type 11  35.85 
 
 
234 aa  62  0.000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.457665  normal  0.153588 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2330  hypothetical protein  27.46 
 
 
249 aa  61.2  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.291215  normal  0.0289436 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5779  Methyltransferase type 11  37.78 
 
 
270 aa  59.3  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0218  methyltransferase type 11  40.45 
 
 
252 aa  58.5  0.00000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.679298  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0228  methyltransferase type 11  40.45 
 
 
252 aa  58.5  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.237973  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5715  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.97 
 
 
269 aa  57.8  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.991449  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0208  methyltransferase type 11  39.33 
 
 
252 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0972  Methyltransferase type 11  39.56 
 
 
269 aa  57.4  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.191025  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2831  Methyltransferase type 11  31.82 
 
 
235 aa  57.4  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1305  Methyltransferase type 11  31.82 
 
 
235 aa  56.6  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0617  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  35.11 
 
 
232 aa  56.2  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.48837 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11556  methyltransferase  39 
 
 
347 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2539  Methyltransferase type 11  34.04 
 
 
237 aa  56.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.459192  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3263  methyltransferase type 11  33.68 
 
 
229 aa  55.5  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0490  Methyltransferase type 11  41.11 
 
 
222 aa  55.5  0.0000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0251  methyltransferase type 11  34 
 
 
165 aa  55.5  0.0000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.999818 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1737  Methyltransferase type 11  34.26 
 
 
283 aa  55.1  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0817864  normal  0.19788 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0176  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.22 
 
 
220 aa  55.1  0.0000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
255 aa  55.1  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2403  Methyltransferase type 11  39.22 
 
 
262 aa  54.3  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  32.22 
 
 
213 aa  54.7  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1237  hypothetical protein  38.46 
 
 
230 aa  54.3  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0626  methyltransferase type 11  38.46 
 
 
224 aa  54.7  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00710227 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  39.36 
 
 
265 aa  54.3  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4330  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.87 
 
 
236 aa  53.9  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.249898  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3831  biotin biosynthesis protein BioC  35.53 
 
 
294 aa  53.9  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3889  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
281 aa  53.5  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.972662 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  36.17 
 
 
274 aa  53.5  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0208  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.43 
 
 
250 aa  53.9  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0448386  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2712  putative phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  35.77 
 
 
226 aa  53.5  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.870029  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0686  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
201 aa  53.5  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.896648  normal  0.0113897 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6814  Methyltransferase type 11  29.5 
 
 
219 aa  53.5  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0807  Methyltransferase type 11  34.41 
 
 
200 aa  53.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0780  Methyltransferase type 11  34.41 
 
 
200 aa  53.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2252  methyltransferase type 11  32.22 
 
 
266 aa  53.1  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1056  methyltransferase type 11  32.32 
 
 
221 aa  53.1  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.270016  normal  0.802402 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2233  Methyltransferase type 11  30.07 
 
 
204 aa  53.1  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.569046  hitchhiker  0.00169364 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.56 
 
 
205 aa  52.8  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0930  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
203 aa  52.8  0.000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140476  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0721  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  34.09 
 
 
204 aa  52.4  0.000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.635481  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5332  Methyltransferase type 11  34.44 
 
 
199 aa  52.4  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2376  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  34.09 
 
 
204 aa  52.4  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.282292 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2367  Methyltransferase type 11  36.96 
 
 
270 aa  52.4  0.000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0637  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  40.58 
 
 
237 aa  52  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.133414 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2021  Methyltransferase type 11  29.52 
 
 
268 aa  52.4  0.000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10980  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  37.23 
 
 
296 aa  52  0.000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1204  generic methyl-transferase  32.98 
 
 
363 aa  52  0.000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6862  Methyltransferase type 11  31.62 
 
 
227 aa  51.6  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0174  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.82 
 
 
220 aa  51.6  0.000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14451  SAM-dependent methyltransferase  28.57 
 
 
223 aa  51.6  0.000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1472  Methyltransferase type 11  34.41 
 
 
242 aa  50.8  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3111  Methyltransferase type 11  30.36 
 
 
241 aa  51.2  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1028  Methyltransferase type 11  35.87 
 
 
273 aa  51.6  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0960  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 
224 aa  50.8  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1717  Methyltransferase type 11  26.9 
 
 
239 aa  51.2  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.457102  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2906  methyltransferase  27.97 
 
 
248 aa  50.8  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00515512  hitchhiker  0.000112395 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10857  hypothetical protein  39.13 
 
 
270 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.530808  hitchhiker  0.000000211273 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_4986  predicted protein  32 
 
 
239 aa  51.2  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.778509 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1092  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
224 aa  51.2  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0463  methyltransferase type 11  34.83 
 
 
197 aa  51.2  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.115014  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1844  Methyltransferase type 11  34.44 
 
 
225 aa  51.6  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00648646  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0579  methyltransferase type 11  32 
 
 
339 aa  51.2  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1777  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
191 aa  51.2  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0119  methyltransferase type 11  35.19 
 
 
184 aa  50.8  0.00001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00979583 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0905  Methyltransferase type 11  35.09 
 
 
216 aa  50.8  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.445237  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1306  Methyltransferase type 11  31.63 
 
 
223 aa  50.8  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3234  Methyltransferase type 11  32.79 
 
 
235 aa  50.8  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  33.66 
 
 
202 aa  50.8  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0696  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.98 
 
 
229 aa  50.8  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.488377 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3338  Methyltransferase type 11  32.58 
 
 
210 aa  50.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3419  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.51 
 
 
299 aa  50.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2052  Methyltransferase type 11  36.54 
 
 
216 aa  50.4  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.782296  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0926  biotin synthesis protein  32.89 
 
 
295 aa  50.4  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.676817  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3023  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
263 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.408274  normal  0.782878 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  29.81 
 
 
211 aa  50.8  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4381  methyltransferase type 11  28.91 
 
 
221 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1295  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.83 
 
 
238 aa  50.4  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2034  methyltransferase  27.83 
 
 
202 aa  50.4  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00341547  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1121  methyltransferase type 11  29.21 
 
 
293 aa  50.1  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.536452  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0026  methyltransferase type 11  35.64 
 
 
262 aa  50.1  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2422  hypothetical protein  36.54 
 
 
194 aa  50.1  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0759  methyltransferase, putative  36.54 
 
 
216 aa  50.1  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1490  Methyltransferase type 11  29.67 
 
 
288 aa  50.8  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000818174 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4235  methyltransferase type 11  30.59 
 
 
244 aa  49.7  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0933321 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4425  methyltransferase type 11  31.31 
 
 
262 aa  49.7  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.102836  normal  0.287125 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1638  Methyltransferase type 11  37.76 
 
 
269 aa  50.1  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.357155  normal  0.179609 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.5 
 
 
259 aa  50.1  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0529  Methyltransferase type 11  34.07 
 
 
268 aa  49.7  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.636084 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2185  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.96 
 
 
238 aa  50.1  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.120523  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0217  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.55 
 
 
255 aa  50.1  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0805678  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1198  Methyltransferase type 11  33.64 
 
 
272 aa  50.1  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4690  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  35.71 
 
 
206 aa  49.7  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.179715 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16301  methyltransferase  32.26 
 
 
357 aa  49.7  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.346442 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5589  Methyltransferase type 11  35.11 
 
 
275 aa  49.3  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2987  Methyltransferase type 11  34.69 
 
 
290 aa  49.3  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4002  methyltransferase type 11  32.64 
 
 
276 aa  49.3  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268063  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>