More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_4124 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_4124  methionine biosynthesis protein MetW  100 
 
 
194 aa  400  1e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3482  methionine biosynthesis protein MetW  100 
 
 
194 aa  400  1e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4777  methionine biosynthesis protein MetW  90.72 
 
 
194 aa  369  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0146  methionine biosynthesis protein MetW  88.54 
 
 
194 aa  362  2e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.990375  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5287  methionine biosynthesis protein MetW  84.02 
 
 
195 aa  346  1e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6043  methionine biosynthesis protein MetW  81.87 
 
 
194 aa  340  5e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0405  methionine biosynthesis MetW  77.6 
 
 
193 aa  311  2.9999999999999996e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4101  methionine biosynthesis protein MetW  78.38 
 
 
202 aa  309  2e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.415093 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4888  methionine biosynthesis MetW  79.14 
 
 
202 aa  309  2e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3583  hypothetical protein  71.35 
 
 
194 aa  289  2e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.134233  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0322  methionine biosynthesis protein MetW  70.31 
 
 
194 aa  259  2e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2010  methionine biosynthesis protein MetW  51.05 
 
 
197 aa  207  6e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0026  hypothetical protein  53.68 
 
 
215 aa  207  7e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.366115  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3116  methionine biosynthesis protein MetW  51.04 
 
 
202 aa  204  5e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3038  methionine biosynthesis protein MetW  51.04 
 
 
202 aa  204  5e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3401  methionine biosynthesis protein MetW  53.68 
 
 
211 aa  204  5e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6451  methionine biosynthesis MetW  51.04 
 
 
202 aa  204  5e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.685724  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2486  methionine biosynthesis MetW  51.04 
 
 
202 aa  204  5e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3100  methionine biosynthesis protein MetW  51.04 
 
 
202 aa  204  5e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.698233  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3724  methionine biosynthesis protein MetW  53.16 
 
 
211 aa  204  5e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3155  methionine biosynthesis protein MetW  51.04 
 
 
202 aa  204  8e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0187  methionine biosynthesis MetW  54.35 
 
 
203 aa  204  9e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1727  methionine biosynthesis protein MetW  50 
 
 
197 aa  203  1e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.53712  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0144  methionine biosynthesis MetW  53.8 
 
 
203 aa  202  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.477783 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0181  methionine biosynthesis protein MetW  53.12 
 
 
204 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.47681  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0156  methionine biosynthesis protein MetW  53.12 
 
 
204 aa  199  3e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3245  methionine biosynthesis protein MetW  53.12 
 
 
204 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2906  methionine biosynthesis protein MetW  53.12 
 
 
204 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0376  methionine biosynthesis protein MetW  53.12 
 
 
204 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0191  methionine biosynthesis protein MetW  53.12 
 
 
204 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3442  methionine biosynthesis protein MetW  53.12 
 
 
204 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2183  methionine biosynthesis protein MetW  53.12 
 
 
204 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.318546  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3097  methionine biosynthesis protein MetW  52.08 
 
 
202 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.588077  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0060  methionine biosynthesis protein MetW  52.6 
 
 
202 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.866888  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0222  methionine biosynthesis MetW  50 
 
 
206 aa  192  2e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0334  methionine biosynthesis protein MetW  54.3 
 
 
202 aa  192  3e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4389  hypothetical protein  54.3 
 
 
202 aa  191  5e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2481  methionine biosynthesis MetW  46.2 
 
 
209 aa  186  1e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3645  DNA repair protein RadC  46.39 
 
 
198 aa  183  1.0000000000000001e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0129  methionine biosynthesis MetW  47.21 
 
 
203 aa  172  1.9999999999999998e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2059  methionine biosynthesis protein MetW  41.94 
 
 
206 aa  171  6.999999999999999e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00118741  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0488  methionine biosynthesis protein MetW  43.98 
 
 
206 aa  167  6e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0413  methionine biosynthesis MetW  39.38 
 
 
205 aa  168  6e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05070  putative methionine biosynthesis protein  43.98 
 
 
206 aa  167  6e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0374  hypothetical protein  39.9 
 
 
205 aa  167  9e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.826237 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3058  methionine biosynthesis MetW  43.23 
 
 
203 aa  167  1e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.109944  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0531  methionine biosynthesis protein MetW  44.39 
 
 
200 aa  166  1e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0337  methionine biosynthesis protein MetW  42.78 
 
 
202 aa  164  8e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03030  methionine biosynthesis protein MetW  42.78 
 
 
199 aa  164  8e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.767976  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5098  methionine biosynthesis protein MetW  42.93 
 
 
212 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.435221  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4156  methionine biosynthesis protein MetW  44.04 
 
 
206 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5148  methionine biosynthesis protein MetW  42.93 
 
 
206 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.740945  normal  0.654734 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4333  methionine biosynthesis protein MetW  40.84 
 
 
196 aa  163  2.0000000000000002e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0367  methionine biosynthesis protein MetW  42.93 
 
 
206 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.802939  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4971  methionine biosynthesis protein MetW  42.93 
 
 
206 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0473  methionine biosynthesis MetW  41.88 
 
 
206 aa  161  6e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0468  methionine biosynthesis protein MetW  44.1 
 
 
201 aa  161  6e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.392633  hitchhiker  0.000505408 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0292  methionine biosynthesis protein MetW  44.1 
 
 
201 aa  161  6e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5050  metW protein  41.88 
 
 
206 aa  160  8.000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5324  methionine biosynthesis MetW  40.31 
 
 
206 aa  160  8.000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.414864 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0751  methionine biosynthesis protein MetW  39.38 
 
 
211 aa  156  2e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4067  methionine biosynthesis protein MetW  41.53 
 
 
196 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.554344  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3191  methionine biosynthesis protein MetW  44.97 
 
 
210 aa  149  2e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0713  methionine biosynthesis protein MetW  45.31 
 
 
197 aa  146  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.749349  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1580  methionine biosynthesis protein MetW  41.27 
 
 
208 aa  145  3e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.216776 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2095  methionine biosynthesis protein MetW  44.57 
 
 
229 aa  144  5e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.273549  normal  0.170685 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1535  methionine biosynthesis protein MetW  44.57 
 
 
229 aa  145  5e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0530604 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1759  methionine biosynthesis protein MetW  44.57 
 
 
229 aa  144  5e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.531023  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0950  methionine biosynthesis protein MetW  40 
 
 
204 aa  143  2e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.341803  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1840  methionine biosynthesis MetW  38.86 
 
 
205 aa  142  2e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0560635  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1024  methionine biosynthesis protein MetW  43.55 
 
 
214 aa  143  2e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0141813 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1880  methionine biosynthesis protein MetW  44.57 
 
 
242 aa  142  4e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0239131 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2133  methionine biosynthesis protein MetW  39.15 
 
 
210 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1426  methionine biosynthesis protein MetW  39.9 
 
 
229 aa  140  9.999999999999999e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0726  methionine biosynthesis protein MetW  44.77 
 
 
221 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.263476  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1836  methionine biosynthesis protein MetW  39.68 
 
 
200 aa  139  3e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1109  methionine biosynthesis protein MetW  42.19 
 
 
220 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.331654  normal  0.297557 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1910  methionine biosynthesis protein MetW  41.71 
 
 
217 aa  138  6e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.166316  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3267  methionine biosynthesis MetW  42.7 
 
 
211 aa  136  2e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0384  methionine biosynthesis protein MetW  45.51 
 
 
222 aa  135  3.0000000000000003e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0586  methionine biosynthesis MetW  39.49 
 
 
229 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0574  methionine biosynthesis protein MetW  40.43 
 
 
215 aa  130  2.0000000000000002e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0436  methionine biosynthesis protein MetW  40.23 
 
 
217 aa  128  4.0000000000000003e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3004  methionine biosynthesis protein MetW  42.86 
 
 
195 aa  128  6e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2885  methionine biosynthesis MetW  39.18 
 
 
195 aa  126  2.0000000000000002e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4280  methionine biosynthesis MetW  39.04 
 
 
222 aa  125  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.558319  normal  0.118746 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1187  putative methionine biosynthesis protein (MetW)  39.57 
 
 
220 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0677  methionine biosynthesis MetW  39.04 
 
 
222 aa  124  6e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.772339  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3135  methionine biosynthesis protein MetW  40.35 
 
 
201 aa  124  8.000000000000001e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.105101  normal  0.147398 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4098  methionine biosynthesis MetW  38.5 
 
 
230 aa  121  6e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4251  methionine biosynthesis MetW  38.5 
 
 
231 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4924  methionine biosynthesis protein MetW  37.97 
 
 
231 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1469  methionine biosynthesis MetW protein  30.11 
 
 
201 aa  84.3  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.393551  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0924  Methyltransferase type 11  34.43 
 
 
247 aa  67.8  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2132  methyltransferase type 11  34.25 
 
 
274 aa  62.8  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3823  glycosyl transferase family 2  30.97 
 
 
1523 aa  60.1  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.588357 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0632  glycosyl transferase family protein  33.05 
 
 
1312 aa  59.3  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.900451 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0696  methyltransferase  29.03 
 
 
217 aa  58.9  0.00000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  37.23 
 
 
345 aa  57.8  0.00000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4388  methyltransferase type 11  29.27 
 
 
267 aa  57.8  0.00000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0989044  normal  0.24508 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>