More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6509 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008062  Bcen_5653  methyltransferase type 11  100 
 
 
220 aa  437  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.154471  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6018  methyltransferase type 11  100 
 
 
220 aa  437  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.153765  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6509  methyltransferase type 11  100 
 
 
220 aa  437  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.434141  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7427  UbiE/COQ5 methyltransferase  97.73 
 
 
220 aa  425  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0427142  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6134  methyltransferase type 11  95.91 
 
 
220 aa  420  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.145601  normal  0.0218248 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0703  ubiE/COQ5 methyltransferase family protein  75.12 
 
 
221 aa  332  2e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161122  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2892  UbiE/COQ5 family methlytransferase  74.65 
 
 
221 aa  331  6e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3154  hypothetical protein  74.65 
 
 
221 aa  331  6e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0124  UbiE/COQ5 family methlytransferase  74.65 
 
 
221 aa  331  6e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.528868  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1464  UbiE/COQ5 family methlytransferase  74.65 
 
 
221 aa  331  6e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0537  UbiE/COQ5 family methlytransferase  74.65 
 
 
221 aa  330  8e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.406886  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0519  UbiE/COQ5 family methlytransferase  74.19 
 
 
221 aa  329  3e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.421388  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6701  UbiE/COQ5 methyltransferase  38.03 
 
 
223 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1985  methyltransferase type 11  31.21 
 
 
261 aa  71.6  0.000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0895  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.17 
 
 
220 aa  70.9  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00195725 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1840  methyltransferase type 11  34.72 
 
 
328 aa  69.7  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1859  methyltransferase type 11  34.72 
 
 
328 aa  69.7  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.48002  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1906  methyltransferase type 11  34.72 
 
 
328 aa  69.7  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3270  Methyltransferase type 11  34.51 
 
 
324 aa  68.2  0.00000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.455173  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2090  methyltransferase type 11  34.03 
 
 
341 aa  68.6  0.00000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0253  MarR family transcriptional regulator  31.72 
 
 
411 aa  67.4  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0159637  normal  0.716874 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13054  hypothetical protein  34.25 
 
 
327 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.100828 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3263  methyltransferase type 11  32.56 
 
 
229 aa  67.8  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0039  ArsR family transcriptional regulator  36.11 
 
 
309 aa  67  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4269  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
332 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.589079  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1345  transcriptional regulator, ArsR family  31.17 
 
 
305 aa  65.9  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.773476  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2939  transcriptional regulator, ArsR family  32.88 
 
 
307 aa  64.7  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2577  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
237 aa  64.3  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.602615  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0252  hypothetical protein  37.21 
 
 
253 aa  63.5  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0258  hypothetical protein  37.21 
 
 
253 aa  63.5  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.3 
 
 
201 aa  63.5  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1808  Methyltransferase type 11  25.79 
 
 
286 aa  63.2  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3006  methyltransferase type 11  32.53 
 
 
305 aa  63.2  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0165  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.26 
 
 
283 aa  63.2  0.000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.119395  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7094  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38 
 
 
244 aa  62.8  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000000661752  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2400  methyltransferase type 11  34.94 
 
 
330 aa  62.8  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00744372 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6455  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.13 
 
 
244 aa  62.8  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4023  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.69 
 
 
240 aa  62.4  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.712508 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1926  Methyltransferase type 11  30.49 
 
 
281 aa  62.4  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1030  Methyltransferase type 11  36.88 
 
 
216 aa  62.4  0.000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.740234 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4806  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  34.62 
 
 
280 aa  62.4  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3937  Methyltransferase type 11  29.34 
 
 
298 aa  62  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.472331  normal  0.52551 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1709  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
206 aa  62  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.775489  normal  0.171516 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  30.43 
 
 
238 aa  62  0.000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5778  Methyltransferase type 11  32.43 
 
 
276 aa  61.6  0.000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.537325  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6064  Methyltransferase type 11  33.91 
 
 
331 aa  62  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  29.59 
 
 
345 aa  61.6  0.000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2478  Methyltransferase type 11  34 
 
 
269 aa  61.2  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0335  Methyltransferase type 11  31.78 
 
 
283 aa  60.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0503  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.72 
 
 
242 aa  61.2  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0258  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30 
 
 
250 aa  60.5  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3960  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.67 
 
 
251 aa  60.8  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0746465 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  32.81 
 
 
282 aa  60.5  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3046  Methyltransferase type 11  31.79 
 
 
295 aa  60.5  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2016  Methyltransferase type 11  37.14 
 
 
276 aa  60.8  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6259  Methyltransferase type 11  33.85 
 
 
270 aa  60.5  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1280  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  38.14 
 
 
233 aa  60.5  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00372704  hitchhiker  0.0000170173 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4556  methyltransferase type 11  39.06 
 
 
253 aa  60.8  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.197949 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2367  Methyltransferase type 11  35.85 
 
 
270 aa  60.5  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2014  methyltransferase type 11  28.15 
 
 
236 aa  60.8  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.51029  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28450  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  34.65 
 
 
325 aa  60.8  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.355376  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0166  DNA topoisomerase VI subunit A-like protein  27.32 
 
 
257 aa  60.1  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1714  arsenite S-adenosylmethyltransferase  27.1 
 
 
248 aa  60.1  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.019439  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0157  putative methyltransferase  33.33 
 
 
229 aa  59.7  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2989  Methyltransferase type 11  23.6 
 
 
270 aa  59.7  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000120063  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1996  generic methyltransferase  32.71 
 
 
214 aa  59.7  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0798  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.77 
 
 
259 aa  59.7  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.350389 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0623  methyltransferase type 11  32.17 
 
 
278 aa  59.7  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0996998 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0759  Methyltransferase type 11  26.45 
 
 
267 aa  59.3  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333457  normal  0.305002 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0051  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.03 
 
 
237 aa  59.3  0.00000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.181609  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2948  methyltransferase type 11  30.17 
 
 
212 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160502  normal  0.130465 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2348  methyltransferase type 11  31.48 
 
 
307 aa  59.3  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0100199  normal  0.0140968 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0809  Methyltransferase type 11  35.92 
 
 
264 aa  59.3  0.00000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.266836  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2332  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.48 
 
 
245 aa  58.9  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1594  methyltransferase type 11  29.81 
 
 
218 aa  58.9  0.00000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0297  UbiE/COQ5 family methyltransferase  28.93 
 
 
256 aa  58.9  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378405  normal  0.771638 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0208  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.24 
 
 
250 aa  58.9  0.00000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0448386  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2016  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.03 
 
 
299 aa  58.9  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6112  arsenite S-adenosylmethyltransferase  30.17 
 
 
279 aa  58.9  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  31.13 
 
 
274 aa  58.5  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2345  methyltransferase type 11  35.87 
 
 
204 aa  58.5  0.00000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2101  ArsR family transcriptional regulator  32.43 
 
 
317 aa  58.5  0.00000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3367  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.95 
 
 
235 aa  58.5  0.00000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3007  methyltransferase type 11  37.72 
 
 
429 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5332  Methyltransferase type 11  31.25 
 
 
199 aa  58.2  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2463  methyltransferase type 11  35.87 
 
 
204 aa  58.2  0.00000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.899692  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  35.35 
 
 
275 aa  58.2  0.00000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2552  Methyltransferase type 11  27.5 
 
 
263 aa  57.8  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.318811 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0160  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.33 
 
 
293 aa  57.8  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  26.75 
 
 
213 aa  57.8  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2635  Methyltransferase type 11  38.2 
 
 
199 aa  57.8  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  37.14 
 
 
236 aa  58.2  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0328  Methyltransferase type 11  30.84 
 
 
283 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2022  hypothetical protein  33.01 
 
 
261 aa  57.8  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.891913  normal  0.0390381 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  32.77 
 
 
284 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3067  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.11 
 
 
239 aa  57.8  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000221573  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4655  Methyltransferase type 11  28.99 
 
 
310 aa  57.8  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0904903  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1988  methyltransferase  33.7 
 
 
204 aa  57  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27 
 
 
250 aa  57  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2267  Methyltransferase type 11  29.57 
 
 
208 aa  57  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>