70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1341 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1341  hypothetical protein  100 
 
 
238 aa  483  1e-135  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18721  hypothetical protein  62.34 
 
 
239 aa  296  3e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.377095 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3234  Methyltransferase type 11  33.18 
 
 
235 aa  105  7e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1026  Methyltransferase type 11  37.2 
 
 
235 aa  100  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2534  3-demethylubiquinone-9 3-O-methyltransferase  27.69 
 
 
241 aa  97.1  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.115173 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2036  Methyltransferase type 12  27.63 
 
 
231 aa  93.2  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.916897  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10913  hypothetical protein  24.27 
 
 
236 aa  92.4  6e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.127289  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1513  hypothetical protein  30.74 
 
 
221 aa  87.8  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.296421  normal  0.422698 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2728  SAM-dependent methyltransferase  24.89 
 
 
252 aa  86.7  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3807  methyltransferase type 12  22.27 
 
 
237 aa  84.7  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3795  SAM-dependent methyltransferase  25.11 
 
 
230 aa  82.4  0.000000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.200041 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0254  methyltransferase type 11  25.83 
 
 
230 aa  80.9  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.753586 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1686  SAM-dependent methyltransferase  23.21 
 
 
263 aa  79.3  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0634865 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0419  hypothetical protein  25.85 
 
 
230 aa  79  0.00000000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.271566 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5034  Methyltransferase type 12  24.78 
 
 
237 aa  78.6  0.00000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.244151 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3186  Methyltransferase type 12  23.61 
 
 
245 aa  74.7  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.458893  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1187  methyltransferase type 12  28.89 
 
 
236 aa  71.2  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.683233 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04540  hypothetical protein  27.69 
 
 
237 aa  70.5  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2808  hypothetical protein  32.72 
 
 
248 aa  68.9  0.00000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0677099  normal  0.911187 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18910  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1, 4-benzoquinol methylase  29.81 
 
 
268 aa  63.5  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.07476  normal  0.315555 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1982  Methyltransferase type 12  30.77 
 
 
311 aa  63.5  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0266324  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4711  methyltransferase type 12  26.32 
 
 
217 aa  62.4  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2197  hypothetical protein  30.1 
 
 
243 aa  62.4  0.000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.123697  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0502  Methyltransferase type 12  24.57 
 
 
299 aa  60.5  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.510695 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1938  hypothetical protein  28.5 
 
 
232 aa  60.5  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000329837 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0772  Methyltransferase type 12  25.44 
 
 
310 aa  59.3  0.00000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1092  methyltransferase type 11  26.24 
 
 
224 aa  58.2  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2113  Methyltransferase type 12  24.39 
 
 
240 aa  57.4  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.294106  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0252  hypothetical protein  23.45 
 
 
301 aa  48.5  0.00008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0946  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.14 
 
 
232 aa  48.5  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1006  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  26.71 
 
 
222 aa  47.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.788103  normal  0.633954 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_342  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase, methyltransferase type 12  31.03 
 
 
255 aa  46.2  0.0005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0343727  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0834  Methyltransferase type 12  39.51 
 
 
205 aa  45.4  0.0008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2906  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.84 
 
 
247 aa  44.7  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2605  hypothetical protein  32.18 
 
 
265 aa  45.1  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00379  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.13 
 
 
239 aa  45.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.296609  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0947  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.93 
 
 
252 aa  44.7  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1842  methyltransferase type 11  30.53 
 
 
244 aa  44.3  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1719  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.69 
 
 
234 aa  43.9  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.815395  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0399  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase UbiE, putative  31.03 
 
 
255 aa  44.3  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1317  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  24.54 
 
 
229 aa  43.5  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124117  hitchhiker  3.42912e-24 
 
 
-
 
NC_002978  WD0350  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  22.41 
 
 
391 aa  43.5  0.003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.19303  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1899  Methyltransferase type 11  34.91 
 
 
266 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0163347  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6864  Methyltransferase type 11  22.68 
 
 
307 aa  43.5  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5021  Methyltransferase type 11  27.87 
 
 
214 aa  43.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0966  transcriptional regulator, XRE family  27.27 
 
 
277 aa  43.1  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0443  methyltransferase type 12  32.26 
 
 
208 aa  43.1  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0289  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  26.53 
 
 
222 aa  43.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.705778  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0998  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase UbiE  39.62 
 
 
230 aa  43.1  0.004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1238  methyltransferase type 11  25.41 
 
 
219 aa  43.1  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1932  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  26.53 
 
 
222 aa  43.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2732  hypothetical protein  31.03 
 
 
265 aa  42.7  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0806  modification methylase, HemK family  37.5 
 
 
282 aa  42.7  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.405188  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4194  methyltransferase type 12  31.31 
 
 
211 aa  42.7  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1553  methyltransferase type 11  31.25 
 
 
210 aa  42.7  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.920902  normal  0.450079 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1607  methyltransferase type 11  31.25 
 
 
210 aa  42.7  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.722742  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2740  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.98 
 
 
238 aa  42.4  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0378  methyltransferase type 11  29.89 
 
 
255 aa  42.4  0.006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00156653  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0491  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  25.77 
 
 
229 aa  42.4  0.006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000372241  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1583  methyltransferase type 11  31.25 
 
 
197 aa  42.4  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.634707  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2336  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  37.18 
 
 
276 aa  42  0.008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30108  methyltransferase  25.42 
 
 
293 aa  42  0.008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.101863  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2607  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.09 
 
 
240 aa  42  0.009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02117  hypothetical protein  26.09 
 
 
240 aa  42  0.009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02158  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.09 
 
 
240 aa  42  0.009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1419  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.09 
 
 
240 aa  42  0.009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000287901 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2383  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.09 
 
 
240 aa  42  0.009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.679426  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2527  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.09 
 
 
240 aa  41.6  0.01  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3366  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.09 
 
 
240 aa  41.6  0.01  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.923438  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1427  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  26.09 
 
 
240 aa  41.6  0.01  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000505917  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>