166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0419 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0419  hypothetical protein  100 
 
 		 230 aa  480  1e-135  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.271566 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0254  methyltransferase type 11  93.04 
 
 		 230 aa  444  1.0000000000000001e-124  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.753586 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10913  hypothetical protein  29.26 
 
 		 236 aa  106  3e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.127289  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3807  methyltransferase type 12  26.92 
 
 		 237 aa  98.2  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2036  Methyltransferase type 12  28.51 
 
 		 231 aa  97.1  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.916897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3795  SAM-dependent methyltransferase  30.25 
 
 		 230 aa  95.9  5e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.200041 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1686  SAM-dependent methyltransferase  29.35 
 
 		 263 aa  89.4  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0634865 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3234  Methyltransferase type 11  27.1 
 
 		 235 aa  88.6  7e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3186  Methyltransferase type 12  26.89 
 
 		 245 aa  88.2  9e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.458893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1026  Methyltransferase type 11  26.64 
 
 		 235 aa  87  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2728  SAM-dependent methyltransferase  26.29 
 
 		 252 aa  84.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5034  Methyltransferase type 12  26.67 
 
 		 237 aa  82.4  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.244151 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1341  hypothetical protein  25.85 
 
 		 238 aa  79  0.00000000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2534  3-demethylubiquinone-9 3-O-methyltransferase  25 
 
 		 241 aa  75.5  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.115173 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18721  hypothetical protein  23.89 
 
 		 239 aa  73.6  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.377095 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1187  methyltransferase type 12  25 
 
 		 236 aa  73.2  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.683233 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04540  hypothetical protein  27.37 
 
 		 237 aa  72  0.000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2113  Methyltransferase type 12  26.96 
 
 		 240 aa  72  0.000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.294106  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4711  methyltransferase type 12  25.75 
 
 		 217 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1513  hypothetical protein  22.61 
 
 		 221 aa  64.7  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.296421  normal  0.422698 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1938  hypothetical protein  24.27 
 
 		 232 aa  63.5  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000329837 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2197  hypothetical protein  28.07 
 
 		 243 aa  62  0.000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.123697  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1457  methyltransferase type 11  42.55 
 
 		 344 aa  61.6  0.00000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1092  methyltransferase type 11  25.41 
 
 		 224 aa  60.8  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_74165  predicted protein  31.78 
 
 		 275 aa  54.7  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.426608 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2552  Methyltransferase type 11  26.42 
 
 		 263 aa  53.5  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.318811 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3981  methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 235 aa  53.1  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.457714  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18910  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1, 4-benzoquinol methylase  22.07 
 
 		 268 aa  52.8  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.07476  normal  0.315555 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  26.36 
 
 		 213 aa  52.8  0.000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0367  Methyltransferase type 11  27.56 
 
 		 317 aa  52  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1218  Tn554 hypothetical protein  27.27 
 
 		 220 aa  50.8  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000635132  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1341  Tn554 hypothetical protein  27.27 
 
 		 220 aa  50.8  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.458469  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2512  hypothetical protein  27.27 
 
 		 220 aa  50.8  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.452599  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2319  hypothetical protein  35.9 
 
 		 356 aa  50.4  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43981  predicted protein  32.32 
 
 		 418 aa  50.8  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.321285  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1502  methyltransferase type 11  37.84 
 
 		 360 aa  50.4  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576413  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0038  methyltransferase type 12  27.27 
 
 		 220 aa  50.8  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1712  methyltransferase type 12  27.27 
 
 		 220 aa  50.8  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0038  methyltransferase type 12  27.27 
 
 		 220 aa  50.8  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1746  methyltransferase type 12  27.27 
 
 		 220 aa  50.8  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0212667  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4002  methyltransferase type 11  23.6 
 
 		 276 aa  50.8  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268063  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2462  hypothetical protein  34.62 
 
 		 356 aa  50.1  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6570  methyltransferase type 12  25.74 
 
 		 416 aa  50.1  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1683  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  33.68 
 
 		 205 aa  49.3  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  26.9 
 
 		 211 aa  49.3  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6814  Methyltransferase type 11  25.88 
 
 		 219 aa  49.3  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2577  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 227 aa  49.3  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2808  hypothetical protein  24.12 
 
 		 248 aa  48.9  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0677099  normal  0.911187 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6862  Methyltransferase type 11  29.21 
 
 		 227 aa  48.5  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0650  hypothetical protein  48.84 
 
 		 272 aa  48.1  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1199  methyltransferase type 11  48.84 
 
 		 286 aa  48.1  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17780  hypothetical protein  24.66 
 
 		 231 aa  48.1  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.656728  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4741  methyltransferase type 11  23.74 
 
 		 305 aa  47.8  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.168171 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1737  Methyltransferase type 11  24.59 
 
 		 283 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0817864  normal  0.19788 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0924  Methyltransferase type 11  27.73 
 
 		 247 aa  47.4  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3477  Methyltransferase type 11  28.72 
 
 		 187 aa  47.4  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.124831  normal  0.285215 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10980  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  26.09 
 
 		 296 aa  46.6  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.84 
 
 		 205 aa  46.6  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003041  hypothetical protein  25.16 
 
 		 210 aa  46.6  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5517  methyltransferase type 11  23.6 
 
 		 355 aa  46.6  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00770643  normal  0.912188 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4620  methyltransferase type 11  32.18 
 
 		 235 aa  46.6  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0418721  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1453  Methyltransferase type 11  41.51 
 
 		 366 aa  47  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000488747  normal  0.299769 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2327  Methyltransferase type 11  26.81 
 
 		 367 aa  47  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.28435 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.41 
 
 		 215 aa  46.2  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5589  Methyltransferase type 11  29.27 
 
 		 275 aa  46.2  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2367  Methyltransferase type 11  26.83 
 
 		 270 aa  46.2  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0899  methyltransferase  33.33 
 
 		 328 aa  46.2  0.0004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4232  methyltransferase type 11  26.8 
 
 		 234 aa  46.2  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0390  Methyltransferase type 11  27.38 
 
 		 194 aa  45.8  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2596  Methyltransferase type 11  25.53 
 
 		 311 aa  45.8  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  26.35 
 
 		 263 aa  45.4  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1116  putative methyltransferase  34.09 
 
 		 293 aa  45.8  0.0006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0960  Methyltransferase type 11  23.7 
 
 		 224 aa  45.4  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2494  hypothetical protein  36.05 
 
 		 194 aa  45.4  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00130351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0315  hypothetical protein  24.22 
 
 		 223 aa  45.4  0.0008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0477  Methyltransferase type 11  23.4 
 
 		 235 aa  45.4  0.0008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8173  Methyltransferase type 11  25.59 
 
 		 254 aa  45.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.781909  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1634  hypothetical protein  22.32 
 
 		 234 aa  45.1  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0705  Methyltransferase type 11  22.58 
 
 		 300 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.716094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0881  hypothetical protein  28.57 
 
 		 183 aa  44.7  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.421379  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1352  hypothetical protein  26.96 
 
 		 206 aa  44.7  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1085  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  36.96 
 
 		 299 aa  45.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00355762  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2147  methyltransferase type 11  29.06 
 
 		 213 aa  44.7  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1413  methyltransferase type 11  29.21 
 
 		 402 aa  45.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.195836  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4447  Methyltransferase type 11  24.32 
 
 		 219 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2448  modification methylase, HemK family  33.87 
 
 		 361 aa  44.7  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08531  conserved hypothetical protein  32.22 
 
 		 305 aa  43.5  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.345186 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0834  hypothetical protein  27.68 
 
 		 239 aa  44.3  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0696  UbiE/COQ5 methyltransferase  25.39 
 
 		 229 aa  43.9  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.488377 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0265  Methyltransferase type 11  29.07 
 
 		 257 aa  43.9  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.767056 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0252  hypothetical protein  19.74 
 
 		 301 aa  43.5  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2970  hypothetical protein  26.47 
 
 		 226 aa  44.3  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1645  Methyltransferase type 12  30.51 
 
 		 365 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2956  methyltransferase type 11  26.6 
 
 		 304 aa  43.9  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.626473  normal  0.0682436 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5517  methyltransferase type 11  22.4 
 
 		 228 aa  43.9  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.550452  normal  0.719059 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2836  methyltransferase type 11  34.85 
 
 		 362 aa  44.3  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.251768  normal  0.501241 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0744  methyltransferase type 11  28.43 
 
 		 256 aa  43.5  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0696  methyltransferase  25.45 
 
 		 217 aa  43.9  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  26.8 
 
 		 402 aa  43.9  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.280031  unclonable  0.0000000000741696 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0596  Methyltransferase type 12  28.57 
 
 		 357 aa  43.9  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.579149 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>