More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0477 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_0477  Methyltransferase type 11  100 
 
 
235 aa  458  9.999999999999999e-129  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1705  Methyltransferase type 11  32.8 
 
 
219 aa  72.8  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2399  Methyltransferase type 11  38.17 
 
 
210 aa  72  0.000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.521103  normal  0.920683 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0499  Methyltransferase type 11  37.67 
 
 
264 aa  70.5  0.00000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000000709402  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1429  methyltransferase type 11  32.5 
 
 
262 aa  69.3  0.00000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3311  Methyltransferase type 11  33.57 
 
 
209 aa  68.2  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0266  methyltransferase type 11  36.97 
 
 
279 aa  67.8  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.608985  normal  0.806838 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2800  Methyltransferase type 11  37.14 
 
 
212 aa  66.6  0.0000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0282  UbiE/COQ5 family methyltransferase  32.14 
 
 
256 aa  65.9  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.986318 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0772  Methyltransferase type 11  30.46 
 
 
209 aa  65.5  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0297  UbiE/COQ5 family methyltransferase  37.14 
 
 
256 aa  65.9  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378405  normal  0.771638 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0164  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.33 
 
 
207 aa  65.5  0.0000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4620  methyltransferase type 11  27.09 
 
 
235 aa  65.9  0.0000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0418721  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2627  methyltransferase type 11  31.88 
 
 
286 aa  65.9  0.0000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.8455  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0855  Methyltransferase type 11  23.74 
 
 
240 aa  65.5  0.0000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1610  Methyltransferase type 11  33.56 
 
 
274 aa  65.1  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2470  Methyltransferase type 11  26.8 
 
 
254 aa  65.1  0.0000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.225805  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0284  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  37.5 
 
 
256 aa  65.1  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3543  transcriptional regulator, ArsR family  35.53 
 
 
335 aa  65.1  0.0000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304877 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2447  methyltransferase type 11  31.82 
 
 
284 aa  64.7  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.204404  normal  0.251404 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3415  Methyltransferase type 12  28.33 
 
 
257 aa  64.7  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.428011  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  41.82 
 
 
274 aa  64.7  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3981  methyltransferase type 12  28.42 
 
 
235 aa  65.1  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.457714  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2776  Methyltransferase type 11  26.67 
 
 
254 aa  65.1  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.516724  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0259  Radical SAM domain protein  37.9 
 
 
1005 aa  63.5  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.285156  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4035  ArsR family transcriptional regulator  30.98 
 
 
312 aa  63.5  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.140406 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0744  methyltransferase type 11  35.45 
 
 
256 aa  64.3  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0757  Methyltransferase type 11  33.56 
 
 
209 aa  64.3  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000851252  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0085  Methyltransferase type 11  30.99 
 
 
236 aa  63.9  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1633  methyltransferase type 11  40.34 
 
 
409 aa  63.9  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0334927  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2431  methyltransferase type 11  32.31 
 
 
250 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.508094 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3422  arsenite S-adenosylmethyltransferase  34.96 
 
 
271 aa  63.2  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.352558  normal  0.929536 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0214  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.33 
 
 
256 aa  63.2  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00594444  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4080  arsenite S-adenosylmethyltransferase  34.96 
 
 
283 aa  62.8  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.214239  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00700  conserved hypothetical protein  33.91 
 
 
239 aa  63.2  0.000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0303  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  36.19 
 
 
256 aa  63.2  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4629  Methyltransferase type 11  30.85 
 
 
270 aa  63.2  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0251  arsenite S-adenosylmethyltransferase  36.13 
 
 
272 aa  62.8  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0215  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.33 
 
 
256 aa  62.8  0.000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.383656  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2089  putative methyltransferase  42.65 
 
 
1014 aa  62.8  0.000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0627261  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2791  arsenite S-adenosylmethyltransferase  32.9 
 
 
266 aa  62.4  0.000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1815  methyltransferase type 11  32.49 
 
 
250 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2427  methyltransferase type 11  32.49 
 
 
250 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.992518  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0224  UbiE/COQ5 family methlytransferase  34.26 
 
 
256 aa  62  0.000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.234424  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0168  UbiE/COQ5 family methlytransferase  32.43 
 
 
207 aa  62  0.000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0222  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  33.33 
 
 
256 aa  62  0.000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.188409  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0289  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  36.19 
 
 
256 aa  61.6  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.911114 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6084  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  33.62 
 
 
229 aa  61.6  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5754  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.69 
 
 
250 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3852  UbiE/COQ5 family methlytransferase  32.77 
 
 
212 aa  61.2  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1238  methyltransferase type 11  26 
 
 
219 aa  61.2  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3468  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  30.89 
 
 
420 aa  60.8  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2444  methyltransferase type 11  34.75 
 
 
280 aa  60.5  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2412  Methyltransferase type 11  29.79 
 
 
240 aa  60.5  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.125357  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1968  arsenite S-adenosylmethyltransferase  34.15 
 
 
276 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.429307  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4556  methyltransferase type 11  40.91 
 
 
253 aa  60.8  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.197949 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2312  methyltransferase type 11  36.07 
 
 
276 aa  60.5  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2336  methyltransferase type 11  29.95 
 
 
250 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.223131 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1987  UbiE/COQ5 family methlytransferase  37.5 
 
 
254 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.199411  hitchhiker  0.00854034 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1714  arsenite S-adenosylmethyltransferase  34.45 
 
 
248 aa  59.7  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.019439  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0995  methyltransferase type 11  37.19 
 
 
210 aa  59.7  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.304036  normal  0.338682 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0867  methyltransferase type 11  31.58 
 
 
250 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.873465  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1548  methyltransferase type 11  36.15 
 
 
225 aa  60.1  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3293  Methyltransferase type 11  31.13 
 
 
257 aa  59.7  0.00000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0938  Methyltransferase type 11  32.24 
 
 
218 aa  59.7  0.00000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.171636 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1449  methyltransferase, putative  26.67 
 
 
201 aa  59.7  0.00000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2470  methyltransferase type 11  29.95 
 
 
250 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.28485  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2522  Methyltransferase type 11  31.79 
 
 
280 aa  59.7  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0795071  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04625  arsenic methyltransferase Cyt19, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G15020)  32.5 
 
 
282 aa  59.3  0.00000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3772  methyltransferase type 11  37.5 
 
 
254 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0194  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.35 
 
 
253 aa  59.3  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.920302  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0759  Methyltransferase type 11  32.77 
 
 
267 aa  59.3  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333457  normal  0.305002 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1344  Methyltransferase type 11  26.35 
 
 
218 aa  58.9  0.00000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1074  UbiE/COQ5 family methlytransferase  39.09 
 
 
251 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1227  UbiE/COQ5 family methlytransferase  39.09 
 
 
251 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.177857  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0961  Methyltransferase type 11  30.68 
 
 
217 aa  58.9  0.00000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0435483  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4690  methyltransferase type 11  33.59 
 
 
280 aa  58.9  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0204  Methyltransferase type 12  22.78 
 
 
203 aa  58.9  0.00000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2814  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.17 
 
 
209 aa  58.9  0.00000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.206405 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2404  Methyltransferase type 11  30.14 
 
 
226 aa  58.9  0.00000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.04 
 
 
215 aa  58.5  0.00000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1550  methyltransferase type 11  36.54 
 
 
254 aa  58.5  0.00000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.326399 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0327  putative methyltransferase  26.18 
 
 
253 aa  58.5  0.00000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.554638  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1518  methyltransferase type 11  36.54 
 
 
254 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.349113  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3023  Methyltransferase type 11  34.88 
 
 
263 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.408274  normal  0.782878 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3999  Methyltransferase type 11  30.94 
 
 
274 aa  57.8  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2387  Methyltransferase type 11  27.1 
 
 
253 aa  58.2  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2577  Methyltransferase type 11  37.38 
 
 
237 aa  57.8  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.602615  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2014  hypothetical protein  34.58 
 
 
253 aa  57  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00388646  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3130  Methyltransferase type 11  36.36 
 
 
261 aa  57.8  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.239042  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  35.78 
 
 
265 aa  57.8  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5219  Methyltransferase type 11  35.19 
 
 
259 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0306756 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0208  UbiE/COQ5 methyltransferase  26.42 
 
 
250 aa  57.8  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0448386  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2477  Methyltransferase type 11  29.03 
 
 
213 aa  57.4  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2537  methyltransferase type 11  37.5 
 
 
281 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04350  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  43.12 
 
 
155 aa  57  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4343  Methyltransferase type 11  30.23 
 
 
415 aa  57  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414925  normal  0.473204 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03350  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  32.18 
 
 
305 aa  57.8  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0228  Methyltransferase type 11  36.76 
 
 
1002 aa  57  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1201  arsenite S-adenosylmethyltransferase  32.73 
 
 
270 aa  57  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>