More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4447 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4447  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 219 aa  456  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3809  SAM binding protein  93.15 
 
 		 219 aa  429  1e-119  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.914048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14451  SAM-dependent methyltransferase  40.28 
 
 		 223 aa  182  4.0000000000000006e-45  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5641  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  43.56 
 
 		 220 aa  174  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.772214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1056  methyltransferase type 11  41.59 
 
 		 221 aa  172  5e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.270016  normal  0.802402 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0696  methyltransferase  44.65 
 
 		 217 aa  169  4e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0801  putative methyltransferase  44.19 
 
 		 217 aa  167  1e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1590  methyltransferase  37.85 
 
 		 219 aa  152  2.9999999999999998e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6705  Methyltransferase type 11  32.43 
 
 		 810 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0390  Methyltransferase type 11  36.36 
 
 		 194 aa  65.1  0.0000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0607  methyltransferase type 11  33.1 
 
 		 285 aa  64.7  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.21069  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1781  methyltransferase type 11  33.1 
 
 		 285 aa  64.7  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.33334  hitchhiker  0.000337573 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2367  Methyltransferase type 11  33.09 
 
 		 270 aa  64.3  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1462  methyltransferase type 11  30.99 
 
 		 285 aa  62.4  0.000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.032097 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2838  Methyltransferase type 11  32.19 
 
 		 264 aa  61.6  0.000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000986934  normal  0.0303756 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01792  23S rRNA m1G745 methyltransferase  36 
 
 		 269 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000732176  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1810  23S rRNA methyltransferase A  36 
 
 		 269 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00511797  normal  0.361683 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2049  23S rRNA methyltransferase A  36.63 
 
 		 269 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000258454  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01780  hypothetical protein  36 
 
 		 269 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000118677  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1821  rRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase  36.63 
 
 		 269 aa  60.1  0.00000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000864083  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2552  23S rRNA methyltransferase A  36 
 
 		 269 aa  60.1  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000000580084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2087  23S rRNA methyltransferase A  36.63 
 
 		 269 aa  60.1  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000369097  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1912  23S rRNA methyltransferase A  36.63 
 
 		 269 aa  60.1  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118014  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0956  methyltransferase type 11  37.25 
 
 		 487 aa  59.3  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1367  23S rRNA methyltransferase A  35.64 
 
 		 269 aa  58.5  0.00000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00000667026  normal  0.0197956 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1114  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.77 
 
 		 223 aa  58.5  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000119347 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5589  Methyltransferase type 11  36.79 
 
 		 275 aa  57.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  31.82 
 
 		 213 aa  58.2  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1480  23S rRNA methyltransferase A  35.29 
 
 		 269 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.494279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2036  23S rRNA methyltransferase A  35.29 
 
 		 269 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.36695  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3477  Methyltransferase type 11  36.46 
 
 		 187 aa  57.4  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.124831  normal  0.285215 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1975  23S rRNA methyltransferase A  35.29 
 
 		 269 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.771839  normal  0.348646 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1296  23S rRNA methyltransferase A  35.29 
 
 		 269 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000629617  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4002  methyltransferase type 11  36.36 
 
 		 276 aa  57.4  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1197  methyltransferase type 12  27.27 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.500309 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1692  23S rRNA methyltransferase A  34.13 
 
 		 273 aa  56.6  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.653904  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2675  hypothetical protein  34.15 
 
 		 289 aa  55.8  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1951  methyltransferase type 11  29.57 
 
 		 226 aa  55.8  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.319095  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2754  biotin biosynthesis protein BioC  25.84 
 
 		 272 aa  55.8  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.32969  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1686  hypothetical protein  27.45 
 
 		 287 aa  55.8  0.0000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.280854  hitchhiker  0.00385522 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2494  hypothetical protein  27.54 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00130351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1113  methyltransferase type 11  34 
 
 		 319 aa  55.5  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0629842  normal  0.748747 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4425  methyltransferase type 11  35.25 
 
 		 262 aa  55.5  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.102836  normal  0.287125 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3685  amine oxidase  26.35 
 
 		 687 aa  55.5  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.336746  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1979  23S rRNA methyltransferase A  34.31 
 
 		 269 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0761  Methyltransferase type 11  26.57 
 
 		 198 aa  53.5  0.000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.266045  normal  0.818805 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5332  Methyltransferase type 11  29.31 
 
 		 199 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  29.55 
 
 		 240 aa  54.3  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0686  methyltransferase type 11  29.27 
 
 		 201 aa  53.9  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.896648  normal  0.0113897 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_74165  predicted protein  30.43 
 
 		 275 aa  53.5  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.426608 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1198  Methyltransferase type 11  32.17 
 
 		 272 aa  53.1  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0355  methyltransferase type 11  32.48 
 
 		 299 aa  53.1  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.970356 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1592  methyltransferase type 11  25.17 
 
 		 225 aa  53.5  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.367784  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0026  methyltransferase type 11  38.61 
 
 		 262 aa  53.1  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2596  Methyltransferase type 11  28.36 
 
 		 311 aa  52.8  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3263  methyltransferase type 11  31.07 
 
 		 229 aa  52.8  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1026  Methyltransferase type 11  36.9 
 
 		 235 aa  52.8  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2116  methyltransferase  25.77 
 
 		 226 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2233  Methyltransferase type 11  32.63 
 
 		 204 aa  52.4  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.569046  hitchhiker  0.00169364 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0780  Methyltransferase type 11  29.27 
 
 		 200 aa  52.4  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0807  Methyltransferase type 11  29.27 
 
 		 200 aa  52.4  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1690  Methyltransferase type 11  28.86 
 
 		 285 aa  52.4  0.000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0193071 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3630  Methyltransferase type 11  32.17 
 
 		 272 aa  52.4  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2091  methyltransferase type 11  31.68 
 
 		 278 aa  52.4  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00620726  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3198  methyltransferase  29.57 
 
 		 226 aa  52.4  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2185  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.42 
 
 		 238 aa  52  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.120523  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2279  hypothetical protein  28.24 
 
 		 284 aa  52  0.000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2358  Methyltransferase type 11  32.84 
 
 		 634 aa  52  0.000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.295252  hitchhiker  0.00225016 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0758  methyltransferase type 11  29.27 
 
 		 261 aa  52  0.000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00805232  hitchhiker  0.00000000000141502 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13700  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  26.97 
 
 		 200 aa  51.6  0.000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1664  Methyltransferase type 11  29 
 
 		 271 aa  51.6  0.000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2486  23S rRNA methyltransferase A  37.04 
 
 		 268 aa  51.6  0.000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.228527  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2251  hypothetical protein  28.24 
 
 		 284 aa  50.8  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10980  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  30.61 
 
 		 296 aa  51.2  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2743  methyltransferase type 12  31.71 
 
 		 290 aa  51.2  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2758  Methyltransferase type 11  29.84 
 
 		 263 aa  51.2  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000336599  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2989  Methyltransferase type 11  30.06 
 
 		 270 aa  51.2  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000120063  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0084  methyltransferase type 11  30.09 
 
 		 208 aa  51.2  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.559166  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0368  Methyltransferase type 11  35 
 
 		 365 aa  50.8  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3234  Methyltransferase type 11  36.9 
 
 		 235 aa  51.6  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002905  rRNA (guanine-N1-)-methyltransferase  28.67 
 
 		 275 aa  50.8  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0109  methyltransferase type 11  30.34 
 
 		 236 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5779  Methyltransferase type 11  32.99 
 
 		 270 aa  51.2  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0611  hypothetical protein  33.64 
 
 		 224 aa  50.4  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1958  hypothetical protein  28.7 
 
 		 236 aa  50.1  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1937  methyltransferase  28.7 
 
 		 236 aa  50.8  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1913  methyltransferase  28.7 
 
 		 236 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1613  23S rRNA methyltransferase A  33.33 
 
 		 270 aa  50.8  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0846237  hitchhiker  0.00925315 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1864  hypothetical protein  28.85 
 
 		 221 aa  50.4  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0010  Methyltransferase type 11  32.99 
 
 		 248 aa  50.4  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1633  Methyltransferase type 11  28.93 
 
 		 264 aa  50.4  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0213004 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1113  methyltransferase type 11  30.91 
 
 		 226 aa  50.4  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3111  Methyltransferase type 11  37.11 
 
 		 241 aa  50.1  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2140  hypothetical protein  28.7 
 
 		 236 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1430  Methyltransferase type 11  37.37 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.406205  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5212  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  30.77 
 
 		 200 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0540942  normal  0.787552 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0367  Methyltransferase type 11  26.03 
 
 		 317 aa  50.1  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2200  hypothetical protein  28.7 
 
 		 236 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.029444  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.69 
 
 		 205 aa  49.7  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0146  methionine biosynthesis protein MetW  35.71 
 
 		 194 aa  50.1  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.990375  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>