53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_17780 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_17780  hypothetical protein  100 
 
 		 231 aa  465  9.999999999999999e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.656728  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2478  methyltransferase type 11  60.27 
 
 		 229 aa  259  4e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.525369  normal  0.225788 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4372  hypothetical protein  55.91 
 
 		 226 aa  255  4e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4068  hypothetical protein  56.36 
 
 		 226 aa  255  5e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0610803  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0903  methyltransferase type 11  54.79 
 
 		 226 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0942  methyltransferase type 11  54.79 
 
 		 226 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4484  methyltransferase type 11  53.88 
 
 		 226 aa  241  9e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.377467  normal  0.853243 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56930  hypothetical protein  52.97 
 
 		 227 aa  239  2e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0971  methyltransferase type 11  54.34 
 
 		 226 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0797238 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4950  hypothetical protein  52.51 
 
 		 227 aa  236  2e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4496  hypothetical protein  51.36 
 
 		 222 aa  231  5e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000259931 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5578  hypothetical protein  47.51 
 
 		 226 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.992022  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0134  Methyltransferase type 11  28.49 
 
 		 225 aa  53.1  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0559128  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2831  Methyltransferase type 11  32.56 
 
 		 235 aa  51.6  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1078  SAM-dependent methyltransferase  23.67 
 
 		 201 aa  50.8  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.215412  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4293  Methyltransferase type 11  35.09 
 
 		 305 aa  49.3  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6814  Methyltransferase type 11  31.25 
 
 		 219 aa  49.3  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1305  Methyltransferase type 11  31.01 
 
 		 235 aa  49.3  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0419  hypothetical protein  24.66 
 
 		 230 aa  48.9  0.00007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.271566 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6862  Methyltransferase type 11  25 
 
 		 227 aa  47.4  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0254  methyltransferase type 11  22.29 
 
 		 230 aa  47  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.753586 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0498  methyltransferase type 11  31.82 
 
 		 235 aa  46.6  0.0003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0390  Methyltransferase type 11  31.09 
 
 		 194 aa  45.8  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2233  Methyltransferase type 11  26 
 
 		 204 aa  45.8  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.569046  hitchhiker  0.00169364 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3215  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1, 4-benzoquinol methylase  23.81 
 
 		 320 aa  45.1  0.0008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.409549  normal  0.479491 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2049  methyltransferase type 12  36.36 
 
 		 246 aa  44.3  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.690149  normal  0.594586 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2252  methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 266 aa  45.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3047  Methyltransferase type 11  29.13 
 
 		 244 aa  44.7  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0374295  normal  0.16298 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2754  biotin biosynthesis protein BioC  30.99 
 
 		 272 aa  44.7  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.32969  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1511  methyltransferase type 11  32.14 
 
 		 208 aa  43.5  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.298686 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3138  Methyltransferase type 11  30.53 
 
 		 255 aa  43.9  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.893116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0078  methyltransferase type 11  32.05 
 
 		 259 aa  44.3  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0105  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 247 aa  43.5  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.342387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4778  Methyltransferase type 11  30.65 
 
 		 242 aa  43.5  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.683048  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3701  Methyltransferase type 11  30.65 
 
 		 242 aa  43.5  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.260893 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2358  Methyltransferase type 11  35.71 
 
 		 634 aa  43.1  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.295252  hitchhiker  0.00225016 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0248  methyltransferase type 11  26.83 
 
 		 195 aa  43.1  0.004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1721  Methyltransferase type 11  31.48 
 
 		 277 aa  43.1  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0285  hypothetical protein  26.73 
 
 		 242 aa  43.1  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.218355  normal  0.197708 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0162  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  34.12 
 
 		 277 aa  43.1  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.466565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1845  methyltransferase type 11  33.96 
 
 		 234 aa  42.7  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0944  hypothetical protein  29.13 
 
 		 242 aa  42.7  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.162173  normal  0.410696 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2461  Methyltransferase type 11  28.7 
 
 		 265 aa  42  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1168  Methyltransferase type 11  29.45 
 
 		 267 aa  42  0.008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2840  MCP methyltransferase, CheR-type  30.71 
 
 		 207 aa  42  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.698056  normal  0.8759 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2606  Methyltransferase type 11  26.15 
 
 		 232 aa  42  0.008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2905  Methyltransferase type 11  27.87 
 
 		 234 aa  42  0.009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08050  methyltransferase family protein  25.44 
 
 		 207 aa  42  0.009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.853516  hitchhiker  0.0000000452502 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1959  methyltransferase type 12  26.47 
 
 		 204 aa  41.6  0.009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.21046 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02860  hypothetical protein  22.98 
 
 		 215 aa  41.6  0.009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.584838  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2515  putative SAM-dependent methyltransferase, SmtA  32.41 
 
 		 277 aa  41.6  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0247067 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0462  methyltransferase type 11  25 
 
 		 215 aa  41.6  0.01  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0744  methyltransferase type 11  32.46 
 
 		 256 aa  41.6  0.01  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>