83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4372 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4372  hypothetical protein  100 
 
 		 226 aa  471  1e-132  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4068  hypothetical protein  96.02 
 
 		 226 aa  456  1e-127  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0610803  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0903  methyltransferase type 11  74.67 
 
 		 226 aa  361  6e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0942  methyltransferase type 11  74.67 
 
 		 226 aa  361  6e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4484  methyltransferase type 11  74.22 
 
 		 226 aa  360  1e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.377467  normal  0.853243 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4496  hypothetical protein  73.89 
 
 		 222 aa  356  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000259931 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0971  methyltransferase type 11  73.33 
 
 		 226 aa  354  5e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0797238 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4950  hypothetical protein  71.49 
 
 		 227 aa  338  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56930  hypothetical protein  70.59 
 
 		 227 aa  336  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5578  hypothetical protein  66.22 
 
 		 226 aa  326  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.992022  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2478  methyltransferase type 11  66.52 
 
 		 229 aa  297  1e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.525369  normal  0.225788 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17780  hypothetical protein  55.91 
 
 		 231 aa  245  4e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.656728  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0134  Methyltransferase type 11  30.08 
 
 		 225 aa  60.5  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0559128  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2831  Methyltransferase type 11  31.71 
 
 		 235 aa  60.1  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2754  biotin biosynthesis protein BioC  32.86 
 
 		 272 aa  55.1  0.0000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.32969  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1305  Methyltransferase type 11  31 
 
 		 235 aa  53.1  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4090  methyltransferase type 11  29.34 
 
 		 239 aa  53.5  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860776  normal  0.999549 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3615  methyltransferase type 11  28.74 
 
 		 239 aa  52.8  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.106494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4293  Methyltransferase type 11  35.14 
 
 		 305 aa  51.2  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0182  Methyltransferase type 11  31.25 
 
 		 263 aa  48.9  0.00007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0334724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2905  Methyltransferase type 11  29.2 
 
 		 234 aa  48.5  0.00008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3630  Methyltransferase type 11  36.73 
 
 		 291 aa  48.5  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10980  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  26.95 
 
 		 296 aa  48.1  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1198  Methyltransferase type 11  31.48 
 
 		 272 aa  48.1  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3006  methyltransferase type 11  29.01 
 
 		 305 aa  47  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2358  Methyltransferase type 11  32.63 
 
 		 634 aa  47.4  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.295252  hitchhiker  0.00225016 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3206  Methyltransferase type 11  30 
 
 		 234 aa  47  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.457665  normal  0.153588 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  24.55 
 
 		 250 aa  45.8  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0551  Methyltransferase type 11  28.46 
 
 		 255 aa  45.4  0.0006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0245261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0078  methyltransferase type 11  34.67 
 
 		 259 aa  45.8  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0214  UbiE/COQ5 family methlytransferase  29.05 
 
 		 256 aa  45.4  0.0007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00594444  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0215  UbiE/COQ5 family methlytransferase  29.05 
 
 		 256 aa  45.4  0.0007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.383656  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0224  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.14 
 
 		 256 aa  45.4  0.0007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.234424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4778  Methyltransferase type 11  26.38 
 
 		 242 aa  45.4  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.683048  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3701  Methyltransferase type 11  26.38 
 
 		 242 aa  45.4  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.260893 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2578  methyltransferase  31.58 
 
 		 330 aa  45.1  0.0009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000179081  decreased coverage  0.000000541539 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3630  Methyltransferase type 11  27.86 
 
 		 272 aa  44.7  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0707  methyltransferase type 11  25.44 
 
 		 250 aa  44.3  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2187  putative methyltransferase  30.77 
 
 		 330 aa  45.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000631484  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0972  Methyltransferase type 11  27.54 
 
 		 269 aa  44.3  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.191025  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  31.07 
 
 		 265 aa  43.9  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1142  trans-aconitate 2-methyltransferase  32.65 
 
 		 258 aa  44.3  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5105  hypothetical protein  27.34 
 
 		 239 aa  44.3  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0427  hypothetical protein  26.43 
 
 		 241 aa  43.9  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.142898  normal  0.178021 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0944  hypothetical protein  27.97 
 
 		 242 aa  44.3  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.162173  normal  0.410696 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0374  methyltransferase  29.28 
 
 		 245 aa  43.9  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0168  UbiE/COQ5 family methlytransferase  24.66 
 
 		 207 aa  43.5  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2252  methyltransferase type 11  31.07 
 
 		 266 aa  43.9  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4620  methyltransferase type 11  33.73 
 
 		 235 aa  44.3  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0418721  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0357  transcriptional regulator, ArsR family  31.43 
 
 		 310 aa  43.1  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366158  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0469  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.21 
 
 		 234 aa  43.5  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0164  UbiE/COQ5 family methlytransferase  25 
 
 		 207 aa  43.5  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  27.43 
 
 		 257 aa  43.5  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02230  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  34.62 
 
 		 224 aa  43.5  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0084  methyltransferase type 11  26.47 
 
 		 208 aa  43.1  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.559166  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2412  Methyltransferase type 11  26.67 
 
 		 240 aa  43.1  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.125357  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1561  Methyltransferase type 11  25.26 
 
 		 283 aa  43.5  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.160915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2693  methyltransferase type 11  28.12 
 
 		 256 aa  43.5  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.218252 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0529  Methyltransferase type 11  31.11 
 
 		 268 aa  43.5  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.636084 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3423  Methyltransferase type 11  33.58 
 
 		 241 aa  42.7  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.248602  normal  0.101773 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10857  hypothetical protein  27.78 
 
 		 270 aa  42.7  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.530808  hitchhiker  0.000000211273 
 
 
-
 
NC_002936  DET0212  hypothetical protein  23.15 
 
 		 231 aa  42.7  0.004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0756  Methyltransferase type 11  33.94 
 
 		 207 aa  43.1  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2403  Methyltransferase type 11  31 
 
 		 262 aa  42.7  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3047  Methyltransferase type 11  27.12 
 
 		 244 aa  42.4  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0374295  normal  0.16298 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2840  MCP methyltransferase, CheR-type  28.03 
 
 		 207 aa  42.4  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.698056  normal  0.8759 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3981  methyltransferase type 12  29.52 
 
 		 235 aa  42.4  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.457714  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0222  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  31.79 
 
 		 256 aa  42.4  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.188409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0390  Methyltransferase type 11  26.72 
 
 		 194 aa  42.4  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0991  methyltransferase type 11  30.39 
 
 		 225 aa  42.4  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  31 
 
 		 282 aa  42.4  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03996  conserved hypothetical protein  30.56 
 
 		 221 aa  42  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0273649  normal  0.194457 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1139  methyltransferase type 11  24.23 
 
 		 222 aa  42.4  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2566  Methyltransferase type 11  31.82 
 
 		 221 aa  42  0.008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.120407 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2546  Methyltransferase type 11  29.46 
 
 		 244 aa  42  0.008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0272722 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3996  putative methyltransferase  27.41 
 
 		 289 aa  42  0.008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3815  methyltransferase type 11  25.71 
 
 		 271 aa  42  0.009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.577541  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2082  putative methyltransferase  30.7 
 
 		 330 aa  42  0.009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0434288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02611  methyltransferase in menaquinone/biotin biosynthesis  30.56 
 
 		 261 aa  42  0.009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  28.66 
 
 		 211 aa  41.6  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2150  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.17 
 
 		 234 aa  41.6  0.01  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000360433  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4216  methyltransferase type 11  28.7 
 
 		 277 aa  41.6  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9446  predicted protein  23.02 
 
 		 220 aa  41.6  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>