83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4496 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_4496  hypothetical protein  100 
 
 		 222 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000259931 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0903  methyltransferase type 11  75.56 
 
 		 226 aa  358  5e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0942  methyltransferase type 11  75.56 
 
 		 226 aa  358  5e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4484  methyltransferase type 11  75.11 
 
 		 226 aa  357  7e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.377467  normal  0.853243 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4372  hypothetical protein  73.89 
 
 		 226 aa  356  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4068  hypothetical protein  73.45 
 
 		 226 aa  351  4e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0610803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0971  methyltransferase type 11  74.22 
 
 		 226 aa  351  5e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0797238 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56930  hypothetical protein  72.07 
 
 		 227 aa  331  4e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4950  hypothetical protein  72.52 
 
 		 227 aa  330  2e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5578  hypothetical protein  66.22 
 
 		 226 aa  320  9.999999999999999e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.992022  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2478  methyltransferase type 11  66.52 
 
 		 229 aa  295  3e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.525369  normal  0.225788 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17780  hypothetical protein  50 
 
 		 231 aa  224  9e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.656728  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2831  Methyltransferase type 11  31.79 
 
 		 235 aa  67.8  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2754  biotin biosynthesis protein BioC  36.65 
 
 		 272 aa  62.4  0.000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.32969  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2905  Methyltransferase type 11  31.25 
 
 		 234 aa  57.8  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0134  Methyltransferase type 11  26.29 
 
 		 225 aa  57  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0559128  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3047  Methyltransferase type 11  31.58 
 
 		 244 aa  57  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0374295  normal  0.16298 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0944  hypothetical protein  31.33 
 
 		 242 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.162173  normal  0.410696 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1305  Methyltransferase type 11  27.15 
 
 		 235 aa  56.2  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2102  hypothetical protein  32.86 
 
 		 269 aa  53.9  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0551  Methyltransferase type 11  28.68 
 
 		 255 aa  52  0.000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0245261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3006  methyltransferase type 11  29.27 
 
 		 305 aa  50.1  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3459  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  29.56 
 
 		 503 aa  49.7  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0707  methyltransferase type 11  31.91 
 
 		 250 aa  49.3  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3615  methyltransferase type 11  25.97 
 
 		 239 aa  48.9  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.106494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4090  methyltransferase type 11  26.11 
 
 		 239 aa  48.5  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860776  normal  0.999549 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0211  methyltransferase type 11  29.94 
 
 		 266 aa  48.5  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4293  Methyltransferase type 11  34 
 
 		 305 aa  48.5  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3206  Methyltransferase type 11  26.49 
 
 		 234 aa  48.1  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.457665  normal  0.153588 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1237  hypothetical protein  27.62 
 
 		 230 aa  47  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0390  Methyltransferase type 11  28.15 
 
 		 194 aa  47.8  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4086  methyltransferase type 11  33.64 
 
 		 249 aa  47  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.315577  normal  0.173874 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6862  Methyltransferase type 11  33 
 
 		 227 aa  46.2  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1543  methyltransferase type 11  31.78 
 
 		 259 aa  45.8  0.0005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9446  predicted protein  23.13 
 
 		 220 aa  45.8  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0469  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.93 
 
 		 234 aa  45.8  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0357  transcriptional regulator, ArsR family  29.08 
 
 		 310 aa  45.4  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366158  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3630  Methyltransferase type 11  35.71 
 
 		 291 aa  45.8  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6814  Methyltransferase type 11  30.28 
 
 		 219 aa  45.4  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1693  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.2 
 
 		 234 aa  45.4  0.0007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0972  Methyltransferase type 11  26.67 
 
 		 269 aa  45.1  0.0009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.191025  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  26.21 
 
 		 211 aa  44.7  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0182  Methyltransferase type 11  32 
 
 		 263 aa  44.7  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0334724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2546  Methyltransferase type 11  30.65 
 
 		 244 aa  45.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0272722 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4140  putative methyltransferase  31.43 
 
 		 255 aa  44.3  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10980  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  25.34 
 
 		 296 aa  45.1  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2252  methyltransferase type 11  30.1 
 
 		 266 aa  44.7  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2332  methyltransferase type 11  25.42 
 
 		 279 aa  43.5  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.214932 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2233  Methyltransferase type 11  30.19 
 
 		 204 aa  44.3  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.569046  hitchhiker  0.00169364 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07171  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  30.09 
 
 		 231 aa  43.9  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2150  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.53 
 
 		 234 aa  44.3  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000360433  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1139  methyltransferase type 11  24.36 
 
 		 222 aa  43.9  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4388  methyltransferase type 11  22.56 
 
 		 267 aa  43.9  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0989044  normal  0.24508 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05119  tRNA methyltransferase (Eurofung)  26 
 
 		 228 aa  43.5  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0237  methyltransferase type 11  29.59 
 
 		 259 aa  43.1  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.635147  decreased coverage  0.000545483 
 
 
-
 
NC_002936  DET0212  hypothetical protein  27.78 
 
 		 231 aa  43.5  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1640  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.87 
 
 		 237 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.169643  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1686  hypothetical protein  25.51 
 
 		 287 aa  43.1  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.280854  hitchhiker  0.00385522 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2080  Methyltransferase type 11  24.73 
 
 		 211 aa  43.1  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.587807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0168  UbiE/COQ5 family methlytransferase  25 
 
 		 207 aa  43.1  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3981  methyltransferase type 12  28 
 
 		 235 aa  43.1  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.457714  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07151  methylase  30.09 
 
 		 235 aa  42.7  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.353179  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08050  methyltransferase family protein  25 
 
 		 207 aa  42.7  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.853516  hitchhiker  0.0000000452502 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05789  methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G06380)  30 
 
 		 279 aa  42.7  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.761453 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3701  Methyltransferase type 11  29.63 
 
 		 242 aa  42.4  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.260893 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4778  Methyltransferase type 11  29.63 
 
 		 242 aa  42.4  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.683048  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1129  Methyltransferase type 11  28.04 
 
 		 274 aa  42.7  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0978373  normal  0.945525 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2358  Methyltransferase type 11  26.72 
 
 		 634 aa  42.4  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.295252  hitchhiker  0.00225016 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_34078  predicted protein  26.36 
 
 		 260 aa  42  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0000133596  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0224  UbiE/COQ5 family methlytransferase  29.08 
 
 		 256 aa  42  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.234424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0164  UbiE/COQ5 family methlytransferase  25 
 
 		 207 aa  42  0.007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5105  hypothetical protein  30.61 
 
 		 239 aa  42  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2577  Methyltransferase type 11  28 
 
 		 227 aa  42  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4895  methyltransferase type 11  36.17 
 
 		 242 aa  42  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00265389 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0215  UbiE/COQ5 family methlytransferase  27.97 
 
 		 256 aa  42  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.383656  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0214  UbiE/COQ5 family methlytransferase  27.97 
 
 		 256 aa  42  0.008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00594444  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0321  Methyltransferase type 11  30.83 
 
 		 207 aa  41.6  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02230  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  28 
 
 		 224 aa  41.6  0.01  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2486  23S rRNA methyltransferase A  33.33 
 
 		 268 aa  41.6  0.01  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.228527  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0509  methyltransferase type 11  37.66 
 
 		 210 aa  41.6  0.01  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1078  SAM-dependent methyltransferase  25.78 
 
 		 201 aa  41.6  0.01  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.215412  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0880  amidohydrolase  29.13 
 
 		 629 aa  41.6  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0328  Methyltransferase type 11  30.83 
 
 		 207 aa  41.6  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>