80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_4068 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_4068  hypothetical protein  100 
 
 		 226 aa  472  1e-132  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0610803  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4372  hypothetical protein  96.02 
 
 		 226 aa  456  1e-127  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0903  methyltransferase type 11  73.78 
 
 		 226 aa  358  4e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0942  methyltransferase type 11  73.78 
 
 		 226 aa  358  4e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4484  methyltransferase type 11  73.33 
 
 		 226 aa  357  9e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.377467  normal  0.853243 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0971  methyltransferase type 11  72.89 
 
 		 226 aa  352  2e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0797238 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4496  hypothetical protein  73.45 
 
 		 222 aa  351  5e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000259931 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4950  hypothetical protein  71.95 
 
 		 227 aa  338  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56930  hypothetical protein  71.04 
 
 		 227 aa  336  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5578  hypothetical protein  65.33 
 
 		 226 aa  321  5e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.992022  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2478  methyltransferase type 11  66.97 
 
 		 229 aa  297  8e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.525369  normal  0.225788 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17780  hypothetical protein  56.36 
 
 		 231 aa  248  6e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.656728  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2831  Methyltransferase type 11  32.52 
 
 		 235 aa  61.6  0.000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0134  Methyltransferase type 11  29.24 
 
 		 225 aa  57.8  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0559128  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2754  biotin biosynthesis protein BioC  35 
 
 		 272 aa  56.2  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.32969  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4293  Methyltransferase type 11  36.04 
 
 		 305 aa  53.5  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1305  Methyltransferase type 11  31 
 
 		 235 aa  53.1  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3615  methyltransferase type 11  28.22 
 
 		 239 aa  52.4  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.106494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4090  methyltransferase type 11  28.22 
 
 		 239 aa  51.6  0.000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860776  normal  0.999549 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1198  Methyltransferase type 11  32.41 
 
 		 272 aa  49.7  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0182  Methyltransferase type 11  30.56 
 
 		 263 aa  48.9  0.00007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0334724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2905  Methyltransferase type 11  29.2 
 
 		 234 aa  48.9  0.00007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3630  Methyltransferase type 11  36.73 
 
 		 291 aa  47.8  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3206  Methyltransferase type 11  30 
 
 		 234 aa  47.4  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.457665  normal  0.153588 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2358  Methyltransferase type 11  32.63 
 
 		 634 aa  47  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.295252  hitchhiker  0.00225016 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2252  methyltransferase type 11  32.04 
 
 		 266 aa  47  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3701  Methyltransferase type 11  26.35 
 
 		 242 aa  47  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.260893 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10980  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  26.95 
 
 		 296 aa  46.6  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4778  Methyltransferase type 11  26.35 
 
 		 242 aa  47  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.683048  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0944  hypothetical protein  25.45 
 
 		 242 aa  46.2  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.162173  normal  0.410696 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0551  Methyltransferase type 11  28.46 
 
 		 255 aa  46.2  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0245261  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5105  hypothetical protein  28.06 
 
 		 239 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0078  methyltransferase type 11  34.67 
 
 		 259 aa  45.8  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3047  Methyltransferase type 11  27.97 
 
 		 244 aa  44.3  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0374295  normal  0.16298 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2102  hypothetical protein  34.15 
 
 		 269 aa  45.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2578  methyltransferase  30.7 
 
 		 330 aa  44.7  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000179081  decreased coverage  0.000000541539 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1142  trans-aconitate 2-methyltransferase  37.93 
 
 		 258 aa  44.7  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2187  putative methyltransferase  30.77 
 
 		 330 aa  44.7  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000631484  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0972  Methyltransferase type 11  27.54 
 
 		 269 aa  44.3  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.191025  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  32 
 
 		 282 aa  44.7  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1139  methyltransferase type 11  24.23 
 
 		 222 aa  44.3  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3006  methyltransferase type 11  27.88 
 
 		 305 aa  44.7  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1237  hypothetical protein  26.67 
 
 		 230 aa  44.3  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0211  methyltransferase type 11  26.73 
 
 		 266 aa  44.7  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0374  methyltransferase  38.37 
 
 		 245 aa  43.9  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0756  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 207 aa  43.9  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0224  UbiE/COQ5 family methlytransferase  29.45 
 
 		 256 aa  44.3  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.234424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  30.29 
 
 		 257 aa  44.3  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0215  UbiE/COQ5 family methlytransferase  28.38 
 
 		 256 aa  44.3  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.383656  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0214  UbiE/COQ5 family methlytransferase  28.38 
 
 		 256 aa  44.3  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00594444  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0427  hypothetical protein  26.57 
 
 		 241 aa  43.9  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.142898  normal  0.178021 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2546  Methyltransferase type 11  30.23 
 
 		 244 aa  43.5  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0272722 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0529  Methyltransferase type 11  31.11 
 
 		 268 aa  43.5  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.636084 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2693  methyltransferase type 11  28.12 
 
 		 256 aa  43.1  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.218252 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0164  UbiE/COQ5 family methlytransferase  25 
 
 		 207 aa  43.1  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0469  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.21 
 
 		 234 aa  42.7  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0880  amidohydrolase  31.73 
 
 		 629 aa  42.7  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0168  UbiE/COQ5 family methlytransferase  24.6 
 
 		 207 aa  42.7  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2403  Methyltransferase type 11  31 
 
 		 262 aa  43.1  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0212  hypothetical protein  23.15 
 
 		 231 aa  42.7  0.005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0357  transcriptional regulator, ArsR family  31.43 
 
 		 310 aa  42.7  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366158  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0237  methyltransferase type 11  26.5 
 
 		 259 aa  42.4  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.635147  decreased coverage  0.000545483 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2932  methyltransferase type 12  27.97 
 
 		 246 aa  42.7  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.445827  normal  0.519548 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0991  methyltransferase type 11  30.39 
 
 		 225 aa  42.4  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0198  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  26.98 
 
 		 251 aa  42.4  0.006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0707  methyltransferase type 11  26.11 
 
 		 250 aa  42.4  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2566  Methyltransferase type 11  31.82 
 
 		 221 aa  42.4  0.006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.120407 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  28.66 
 
 		 211 aa  42  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0390  Methyltransferase type 11  26.72 
 
 		 194 aa  42.4  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4427  methyltransferase type 11  27.94 
 
 		 273 aa  42  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.799504 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4620  methyltransferase type 11  32.53 
 
 		 235 aa  42  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0418721  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2840  MCP methyltransferase, CheR-type  27.85 
 
 		 207 aa  41.6  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.698056  normal  0.8759 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1002  Methyltransferase type 11  36.63 
 
 		 226 aa  41.6  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4086  methyltransferase type 11  28.68 
 
 		 249 aa  42  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.315577  normal  0.173874 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2461  Methyltransferase type 11  28.7 
 
 		 265 aa  42  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3981  methyltransferase type 12  29.52 
 
 		 235 aa  41.6  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.457714  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0084  methyltransferase type 11  25.36 
 
 		 208 aa  41.6  0.01  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.559166  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4026  putative methyltransferase  29.36 
 
 		 323 aa  41.6  0.01  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10857  hypothetical protein  31.78 
 
 		 270 aa  41.6  0.01  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.530808  hitchhiker  0.000000211273 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25 
 
 		 250 aa  41.6  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>