54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_5578 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_5578  hypothetical protein  100 
 
 		 226 aa  472  1e-132  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.992022  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4484  methyltransferase type 11  66.22 
 
 		 226 aa  327  7e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.377467  normal  0.853243 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0903  methyltransferase type 11  65.78 
 
 		 226 aa  326  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0942  methyltransferase type 11  65.78 
 
 		 226 aa  326  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4372  hypothetical protein  66.22 
 
 		 226 aa  326  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4950  hypothetical protein  68.47 
 
 		 227 aa  325  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0971  methyltransferase type 11  66.22 
 
 		 226 aa  324  6e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0797238 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56930  hypothetical protein  67.57 
 
 		 227 aa  322  4e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4068  hypothetical protein  65.33 
 
 		 226 aa  321  5e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0610803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4496  hypothetical protein  66.22 
 
 		 222 aa  320  9.999999999999999e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000259931 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2478  methyltransferase type 11  60.36 
 
 		 229 aa  271  6e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.525369  normal  0.225788 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17780  hypothetical protein  47.03 
 
 		 231 aa  214  9.999999999999999e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.656728  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2831  Methyltransferase type 11  26.97 
 
 		 235 aa  60.8  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0134  Methyltransferase type 11  27.17 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0559128  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2905  Methyltransferase type 11  24.83 
 
 		 234 aa  53.1  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1305  Methyltransferase type 11  23.68 
 
 		 235 aa  52.8  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2252  methyltransferase type 11  31.62 
 
 		 266 aa  51.6  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3206  Methyltransferase type 11  24.16 
 
 		 234 aa  50.1  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.457665  normal  0.153588 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0168  UbiE/COQ5 family methlytransferase  26.67 
 
 		 207 aa  48.5  0.00009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2220  Methyltransferase type 11  26.61 
 
 		 314 aa  48.1  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2926  transcriptional regulator ArsR family  30.15 
 
 		 341 aa  48.1  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0164  UbiE/COQ5 family methlytransferase  25.83 
 
 		 207 aa  47.4  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2187  putative methyltransferase  31.58 
 
 		 330 aa  47  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000631484  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0551  Methyltransferase type 11  22.98 
 
 		 255 aa  46.6  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0245261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0214  UbiE/COQ5 family methlytransferase  25.9 
 
 		 256 aa  46.2  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00594444  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0215  UbiE/COQ5 family methlytransferase  25.9 
 
 		 256 aa  46.2  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.383656  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0224  UbiE/COQ5 family methlytransferase  27.01 
 
 		 256 aa  46.2  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.234424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3047  Methyltransferase type 11  28.21 
 
 		 244 aa  45.4  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0374295  normal  0.16298 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2358  Methyltransferase type 11  29.47 
 
 		 634 aa  45.4  0.0007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.295252  hitchhiker  0.00225016 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0320  hypothetical protein  24.42 
 
 		 290 aa  45.4  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1327  methyltransferase  22.05 
 
 		 258 aa  44.3  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0582471  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10980  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  24.03 
 
 		 296 aa  44.7  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3222  methyltransferase type 12  23.11 
 
 		 255 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.361207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2754  biotin biosynthesis protein BioC  33.06 
 
 		 272 aa  44.7  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.32969  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4293  Methyltransferase type 11  29.73 
 
 		 305 aa  44.3  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2578  methyltransferase  26.71 
 
 		 330 aa  43.9  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000179081  decreased coverage  0.000000541539 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2992  methyltransferase type 11  27.37 
 
 		 229 aa  43.9  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.547914  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1846  methyltransferase, putative  30.63 
 
 		 330 aa  44.3  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.528406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12280  predicted protein  33.02 
 
 		 285 aa  44.3  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0372336  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1737  Methyltransferase type 11  33.57 
 
 		 283 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0817864  normal  0.19788 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2935  methyltransferase type 11  30.36 
 
 		 249 aa  43.9  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2082  putative methyltransferase  28.48 
 
 		 330 aa  43.1  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0434288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  30 
 
 		 282 aa  42.7  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0212  hypothetical protein  26.14 
 
 		 231 aa  43.1  0.004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1237  hypothetical protein  27.69 
 
 		 230 aa  42.7  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2619  transcriptional regulator, ArsR family  27.66 
 
 		 341 aa  43.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.38929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02611  methyltransferase in menaquinone/biotin biosynthesis  29.86 
 
 		 261 aa  42.7  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1903  methyltransferase type 11  26.24 
 
 		 282 aa  43.1  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000234501  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3701  Methyltransferase type 11  30.43 
 
 		 242 aa  42.4  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.260893 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4778  Methyltransferase type 11  30.43 
 
 		 242 aa  42.4  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.683048  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0944  hypothetical protein  27.35 
 
 		 242 aa  42.7  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.162173  normal  0.410696 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1890  methyltransferase, putative  29.82 
 
 		 330 aa  42.4  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000006524  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1409  methyltransferase type 11  32.93 
 
 		 243 aa  42.4  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4090  methyltransferase type 11  26.88 
 
 		 239 aa  41.6  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860776  normal  0.999549 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>