40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2478 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2478  methyltransferase type 11  100 
 
 		 229 aa  472  1e-132  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.525369  normal  0.225788 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0971  methyltransferase type 11  69.2 
 
 		 226 aa  317  1e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0797238 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4484  methyltransferase type 11  68.75 
 
 		 226 aa  317  1e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.377467  normal  0.853243 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0903  methyltransferase type 11  69.2 
 
 		 226 aa  316  2e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0942  methyltransferase type 11  69.2 
 
 		 226 aa  316  2e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4950  hypothetical protein  68.92 
 
 		 227 aa  312  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56930  hypothetical protein  68.02 
 
 		 227 aa  311  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4372  hypothetical protein  66.52 
 
 		 226 aa  309  2e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4068  hypothetical protein  66.97 
 
 		 226 aa  308  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0610803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4496  hypothetical protein  67.26 
 
 		 222 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000259931 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5578  hypothetical protein  60.36 
 
 		 226 aa  282  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.992022  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17780  hypothetical protein  60.27 
 
 		 231 aa  256  3e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.656728  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2754  biotin biosynthesis protein BioC  36.73 
 
 		 272 aa  54.3  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.32969  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2831  Methyltransferase type 11  32.2 
 
 		 235 aa  53.9  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4090  methyltransferase type 11  27.93 
 
 		 239 aa  51.2  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860776  normal  0.999549 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3615  methyltransferase type 11  29.35 
 
 		 239 aa  50.8  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.106494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0134  Methyltransferase type 11  28.07 
 
 		 225 aa  49.3  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0559128  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6814  Methyltransferase type 11  34.34 
 
 		 219 aa  47  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1959  methyltransferase type 12  27.45 
 
 		 204 aa  45.1  0.0008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.21046 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1305  Methyltransferase type 11  26.95 
 
 		 235 aa  44.7  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6718  Methyltransferase type 11  27.33 
 
 		 252 aa  44.7  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0182  Methyltransferase type 11  28.47 
 
 		 263 aa  44.7  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0334724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3630  Methyltransferase type 11  35.71 
 
 		 291 aa  44.3  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4293  Methyltransferase type 11  34.62 
 
 		 305 aa  44.7  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3047  Methyltransferase type 11  27.2 
 
 		 244 aa  43.9  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0374295  normal  0.16298 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1198  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 272 aa  43.9  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0078  methyltransferase type 11  36 
 
 		 259 aa  43.5  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4086  methyltransferase type 11  29.24 
 
 		 249 aa  43.9  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.315577  normal  0.173874 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1078  SAM-dependent methyltransferase  27.27 
 
 		 201 aa  44.3  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.215412  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0224  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.04 
 
 		 256 aa  43.1  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.234424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0214  UbiE/COQ5 family methlytransferase  32.14 
 
 		 256 aa  43.1  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00594444  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9446  predicted protein  23.31 
 
 		 220 aa  42.7  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0215  UbiE/COQ5 family methlytransferase  32.14 
 
 		 256 aa  42.7  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.383656  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3981  methyltransferase type 12  31.4 
 
 		 235 aa  42.4  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.457714  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0572  hypothetical protein  25.62 
 
 		 243 aa  42.4  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.519811  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3006  methyltransferase type 11  29.3 
 
 		 305 aa  42  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4778  Methyltransferase type 11  31.97 
 
 		 242 aa  42  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.683048  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3701  Methyltransferase type 11  31.97 
 
 		 242 aa  42  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.260893 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 282 aa  42  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2252  methyltransferase type 11  33.68 
 
 		 266 aa  42  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>