65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_4484 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_4484  methyltransferase type 11  100 
 
 		 226 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.377467  normal  0.853243 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0903  methyltransferase type 11  99.12 
 
 		 226 aa  462  1e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0942  methyltransferase type 11  99.12 
 
 		 226 aa  462  1e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0971  methyltransferase type 11  95.13 
 
 		 226 aa  444  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0797238 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4372  hypothetical protein  74.22 
 
 		 226 aa  360  1e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4496  hypothetical protein  75.11 
 
 		 222 aa  357  8e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000259931 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4068  hypothetical protein  73.33 
 
 		 226 aa  357  9e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0610803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4950  hypothetical protein  73.42 
 
 		 227 aa  349  2e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56930  hypothetical protein  72.97 
 
 		 227 aa  347  8e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5578  hypothetical protein  66.22 
 
 		 226 aa  327  7e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.992022  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2478  methyltransferase type 11  68.75 
 
 		 229 aa  301  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.525369  normal  0.225788 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17780  hypothetical protein  53.88 
 
 		 231 aa  228  5e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.656728  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2831  Methyltransferase type 11  28.38 
 
 		 235 aa  57.8  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0134  Methyltransferase type 11  29.24 
 
 		 225 aa  55.5  0.0000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0559128  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2905  Methyltransferase type 11  29.66 
 
 		 234 aa  55.5  0.0000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2754  biotin biosynthesis protein BioC  35.71 
 
 		 272 aa  55.5  0.0000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.32969  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1139  methyltransferase type 11  29.88 
 
 		 222 aa  53.5  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1305  Methyltransferase type 11  28.29 
 
 		 235 aa  52.8  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0944  hypothetical protein  30.99 
 
 		 242 aa  52.4  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.162173  normal  0.410696 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3047  Methyltransferase type 11  30.28 
 
 		 244 aa  51.6  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0374295  normal  0.16298 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4086  methyltransferase type 11  34.58 
 
 		 249 aa  51.6  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.315577  normal  0.173874 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0551  Methyltransferase type 11  29.53 
 
 		 255 aa  50.8  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0245261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0078  methyltransferase type 11  34.31 
 
 		 259 aa  50.1  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2102  hypothetical protein  33.07 
 
 		 269 aa  50.1  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4293  Methyltransferase type 11  35.78 
 
 		 305 aa  49.7  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4090  methyltransferase type 11  27.12 
 
 		 239 aa  48.5  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860776  normal  0.999549 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3615  methyltransferase type 11  27.78 
 
 		 239 aa  47.8  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.106494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0334  Methyltransferase type 11  30.94 
 
 		 257 aa  47  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000194414  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0707  methyltransferase type 11  28.41 
 
 		 250 aa  47.4  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3206  Methyltransferase type 11  30.69 
 
 		 234 aa  46.2  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.457665  normal  0.153588 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3981  methyltransferase type 12  29.52 
 
 		 235 aa  45.8  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.457714  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4895  methyltransferase type 11  37.63 
 
 		 242 aa  45.8  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00265389 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1129  Methyltransferase type 11  30.61 
 
 		 274 aa  45.8  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0978373  normal  0.945525 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3006  methyltransferase type 11  30.61 
 
 		 305 aa  45.4  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4778  Methyltransferase type 11  27.71 
 
 		 242 aa  45.8  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.683048  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3701  Methyltransferase type 11  27.71 
 
 		 242 aa  45.8  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.260893 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1512  methyltransferase type 11  24.84 
 
 		 190 aa  45.4  0.0007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.358179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2412  Methyltransferase type 11  26.67 
 
 		 240 aa  45.4  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.125357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6814  Methyltransferase type 11  31.48 
 
 		 219 aa  45.4  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0212  hypothetical protein  24.55 
 
 		 231 aa  45.4  0.0008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0182  Methyltransferase type 11  31 
 
 		 263 aa  45.1  0.0009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0334724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  31.13 
 
 		 211 aa  44.7  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3630  Methyltransferase type 11  34.29 
 
 		 291 aa  44.7  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2461  Methyltransferase type 11  27.78 
 
 		 265 aa  44.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4140  putative methyltransferase  34.88 
 
 		 255 aa  45.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0991  methyltransferase type 11  34.55 
 
 		 225 aa  44.7  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0211  methyltransferase type 11  30.06 
 
 		 266 aa  44.7  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4216  methyltransferase type 11  34.18 
 
 		 277 aa  45.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0357  transcriptional regulator, ArsR family  31.88 
 
 		 310 aa  44.3  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366158  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2252  methyltransferase type 11  27.33 
 
 		 266 aa  43.9  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0427  hypothetical protein  32.29 
 
 		 241 aa  44.3  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.142898  normal  0.178021 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.85 
 
 		 201 aa  43.9  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1737  Methyltransferase type 11  29.71 
 
 		 283 aa  42.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0817864  normal  0.19788 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1686  hypothetical protein  28.21 
 
 		 287 aa  42.7  0.005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.280854  hitchhiker  0.00385522 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5105  hypothetical protein  32.99 
 
 		 239 aa  42.7  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  26.35 
 
 		 257 aa  42.7  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0390  Methyltransferase type 11  27.73 
 
 		 194 aa  42.7  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2840  MCP methyltransferase, CheR-type  32.71 
 
 		 207 aa  42.4  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.698056  normal  0.8759 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3996  putative methyltransferase  26.11 
 
 		 289 aa  42.4  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0607  methyltransferase type 11  27.55 
 
 		 285 aa  42  0.008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.21069  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  27.54 
 
 		 282 aa  42  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9446  predicted protein  22.56 
 
 		 220 aa  42  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1781  methyltransferase type 11  27.55 
 
 		 285 aa  42  0.008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.33334  hitchhiker  0.000337573 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02230  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  35.58 
 
 		 224 aa  42  0.009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5097  methyltransferase type 11  32.35 
 
 		 260 aa  41.6  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.715377  normal  0.3355 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>