52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1959 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1959  methyltransferase type 12  100 
 
 
204 aa  431  1e-120  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.21046 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001055  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1, 4-benzoquinol methylase  49.24 
 
 
214 aa  198  6e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.829142  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3711  Methyltransferase type 11  38.38 
 
 
208 aa  152  4e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.157205  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2494  hypothetical protein  31.12 
 
 
194 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00130351  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0390  Methyltransferase type 11  32.77 
 
 
194 aa  94.4  9e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1298  Methyltransferase type 11  30.97 
 
 
210 aa  65.9  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.356445  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0212  hypothetical protein  31.68 
 
 
231 aa  59.3  0.00000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0141  methyltransferase type 11  31.63 
 
 
233 aa  53.9  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1876  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  25.57 
 
 
282 aa  49.3  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183068  normal  0.315435 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4583  Methyltransferase type 11  25.67 
 
 
220 aa  48.5  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.130075 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0865  Methyltransferase type 12  28.95 
 
 
232 aa  48.1  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2391  methyltransferase type 12  24.52 
 
 
406 aa  48.1  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.044338  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0439  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  24.06 
 
 
229 aa  47.8  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.255286 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3630  Methyltransferase type 11  29.73 
 
 
272 aa  47.8  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72030  hypothetical protein  28.48 
 
 
287 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  24.05 
 
 
240 aa  47.4  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1209  Methyltransferase type 11  28.23 
 
 
210 aa  47  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4886  methyltransferase type 12  32.63 
 
 
259 aa  46.6  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0785  methyltransferase type 11  32.67 
 
 
267 aa  47.4  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3088  C-methyltransferase  25 
 
 
406 aa  46.2  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2478  methyltransferase type 11  27.45 
 
 
229 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.525369  normal  0.225788 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1352  hypothetical protein  26.5 
 
 
206 aa  45.4  0.0006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1078  SAM-dependent methyltransferase  26.53 
 
 
201 aa  45.1  0.0007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.215412  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3106  generic methyltransferase  26.81 
 
 
311 aa  44.7  0.0008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.33572  normal  0.0489041 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5678  hypothetical protein  25.53 
 
 
294 aa  44.7  0.0009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.622302  normal  0.945039 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1507  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  35.48 
 
 
247 aa  44.7  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.148991  normal  0.0208491 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1729  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.05 
 
 
243 aa  44.3  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  27.27 
 
 
402 aa  44.7  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.280031  unclonable  0.0000000000741696 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0458  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.05 
 
 
234 aa  44.3  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4748  hypothetical protein  26.47 
 
 
273 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000104492 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26450  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  32.63 
 
 
244 aa  44.3  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.765571 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01971  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  30.08 
 
 
232 aa  43.5  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10090  methyltransferase  28.26 
 
 
197 aa  43.9  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.542368  normal  0.16327 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0981  Methyltransferase type 11  29.03 
 
 
221 aa  43.9  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3814  Methyltransferase type 11  30.48 
 
 
230 aa  43.5  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.212556  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4934  Methyltransferase type 11  30.34 
 
 
332 aa  43.1  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.310878 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4566  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  27.4 
 
 
285 aa  43.1  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.343396 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0228  Methyltransferase type 11  27.4 
 
 
243 aa  42.7  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000960813  normal  0.184474 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3033  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
304 aa  43.1  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3517  methyltransferase type 11  25.81 
 
 
278 aa  43.1  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000171496  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2400  methyltransferase type 11  34.12 
 
 
330 aa  43.1  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00744372 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1651  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
260 aa  42.4  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.131421  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1423  methyltransferase type 11  27.73 
 
 
279 aa  42.4  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  26.82 
 
 
236 aa  42.4  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17780  hypothetical protein  26.47 
 
 
231 aa  42  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.656728  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3815  methyltransferase type 11  28.57 
 
 
271 aa  41.6  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.577541  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2639  hypothetical protein  23.72 
 
 
318 aa  41.6  0.007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1847  methyltransferase type 11  25.66 
 
 
195 aa  41.6  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.512652  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6087  Methyltransferase type 12  23.84 
 
 
263 aa  41.6  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  29.67 
 
 
265 aa  41.6  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02860  hypothetical protein  32.32 
 
 
215 aa  41.6  0.009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.584838  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3215  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1, 4-benzoquinol methylase  21.05 
 
 
320 aa  41.2  0.01  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.409549  normal  0.479491 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>