128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3088 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3088  C-methyltransferase  100 
 
 		 406 aa  846    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2391  methyltransferase type 12  68.64 
 
 		 406 aa  598  1e-170  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.044338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2166  Methyltransferase type 12  45 
 
 		 397 aa  377  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3091  C-methyltransferase  45.74 
 
 		 406 aa  357  1.9999999999999998e-97  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2163  C-methyltransferase  42.64 
 
 		 421 aa  353  2e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.615529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2387  C-methyltransferase  44.01 
 
 		 402 aa  347  2e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1566  putative sugar nucleotide processing enzyme  43.07 
 
 		 414 aa  309  6.999999999999999e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.445342 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6557  methyltransferase type 12  41.31 
 
 		 425 aa  303  4.0000000000000003e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1565  methyltransferase type 12  38.32 
 
 		 396 aa  283  3.0000000000000004e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.663655  normal  0.440278 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6563  C-methyltransferase  38.07 
 
 		 396 aa  279  7e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2948  C-methyltransferase  37.4 
 
 		 391 aa  249  4e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.236256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3347  methyltransferase  30.61 
 
 		 390 aa  187  2e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0988027  normal  0.589908 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3714  methyltransferase type 11  30.93 
 
 		 361 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1964  methyltransferase type 11  27.4 
 
 		 352 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02801  hypothetical protein  25 
 
 		 411 aa  129  7.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.484397 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3959  C-methyltransferase  28.57 
 
 		 414 aa  127  3e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00636655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0163  putative methyltransferase  27.81 
 
 		 401 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0150  putative methyltransferase  28.06 
 
 		 401 aa  121  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2880  Methyltransferase type 11  26.59 
 
 		 383 aa  107  4e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.252544  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1809  putative sugar transferase  22.68 
 
 		 401 aa  102  1e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2994  methyltransferase type 12  24.46 
 
 		 401 aa  101  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.290652  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4987  C-methyltransferase  25.37 
 
 		 431 aa  99.4  9e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0629  hypothetical protein  25.95 
 
 		 409 aa  98.6  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0067  C-methyltransferase  27.86 
 
 		 413 aa  97.8  3e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0480856  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1221  C-methyltransferase  27.46 
 
 		 419 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.38117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4217  C-methyltransferase  25.65 
 
 		 411 aa  95.5  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.858444  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27750  hypothetical protein  29.07 
 
 		 373 aa  93.2  7e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4509  C-methyltransferase  26.1 
 
 		 411 aa  92  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.391824  normal  0.0572283 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4219  methyltransferase type 12  26.76 
 
 		 412 aa  90.9  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1513  hypothetical protein  25.55 
 
 		 408 aa  89  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0363  C-methyltransferase  27.53 
 
 		 416 aa  89  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5197  C-methyltransferase  24.87 
 
 		 415 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3938  methyltransferase type 12  25.58 
 
 		 444 aa  88.2  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.16065  normal  0.145676 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0594  C-methyltransferase  27.34 
 
 		 407 aa  85.9  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.881628  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4712  C-methyltransferase  25.55 
 
 		 408 aa  84.7  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.844153 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4225  C-methyltransferase  23.79 
 
 		 407 aa  83.6  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.791496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3333  C-methyltransferase  25.5 
 
 		 413 aa  83.2  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0438  methyltransferase, putative  22.85 
 
 		 433 aa  81.3  0.00000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.874295  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1962  C-methyltransferase  24.19 
 
 		 407 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2118  C-methyltransferase  28.24 
 
 		 406 aa  81.3  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.510018  normal  0.0302661 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3716  C-methyltransferase  25.32 
 
 		 407 aa  80.5  0.00000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2784  C-methyltransferase  25.25 
 
 		 413 aa  80.5  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.611308 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0848  C-methyltransferase  26.5 
 
 		 409 aa  79.7  0.00000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.436527  normal  0.303178 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4417  C-methyltransferase  26.43 
 
 		 438 aa  79  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0381  putative methyltransferase  22.85 
 
 		 433 aa  79  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3375  methyltransferase  24.27 
 
 		 407 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0807  C-methyltransferase  26.5 
 
 		 409 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.409336 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0772  C-methyltransferase  25.82 
 
 		 409 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0227083 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2158  C-methyltransferase  23.06 
 
 		 409 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1871  C-methyltransferase  25.76 
 
 		 413 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.804572  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0635  methyltransferase, putative  27.9 
 
 		 411 aa  77.4  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0790  C-methyltransferase  23.57 
 
 		 427 aa  76.6  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00493713  normal  0.231188 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2947  C-methyltransferase  22.9 
 
 		 415 aa  76.6  0.0000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00433807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3390  C-methyltransferase  22.81 
 
 		 420 aa  76.3  0.0000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0218606  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6562  C-methyltransferase  23.86 
 
 		 410 aa  75.9  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3060  C-methyltransferase  22.92 
 
 		 406 aa  74.3  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3401  methyltransferase  22.98 
 
 		 407 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3350  C-methyltransferase  24.93 
 
 		 400 aa  73.6  0.000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.295208  normal  0.715465 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3397  methyltransferase, putative  22.98 
 
 		 407 aa  72.8  0.000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2759  C-methyltransferase  25.26 
 
 		 405 aa  72.4  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.13285  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3071  methyltransferase  22.65 
 
 		 407 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2265  C-methyltransferase  25.17 
 
 		 436 aa  71.6  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3092  C-methyltransferase  28.45 
 
 		 410 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.763523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29890  methyltransferase family protein  26.55 
 
 		 408 aa  71.6  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.942698 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5658  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  23.36 
 
 		 421 aa  70.9  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1048  putative SAM-dependent methyltransferase  27.17 
 
 		 420 aa  69.7  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195919  normal  0.773577 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0809  NDP-hexose 3-C-methyltransferase TylCIII  23.76 
 
 		 412 aa  69.7  0.00000000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0705  methyltransferase  23.76 
 
 		 412 aa  68.9  0.0000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07271  hypothetical protein  21.13 
 
 		 418 aa  68.2  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.298061  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2770  methyltransferase type 12  22.77 
 
 		 408 aa  68.2  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14051  hypothetical protein  22.13 
 
 		 402 aa  67.4  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2386  C-methyltransferase  23.32 
 
 		 410 aa  67  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0776  C-methyltransferase  25.33 
 
 		 411 aa  67  0.0000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1135  putative NDP-hexose methyltransferase protein  26.94 
 
 		 407 aa  65.1  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1599  D-mycarose 3-C-methyltransferase  19.62 
 
 		 416 aa  65.5  0.000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4739  Methyltransferase type 12  22.92 
 
 		 391 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.751981  normal  0.502527 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3662  Methyltransferase type 12  22.92 
 
 		 391 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.563292 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0057  putative C-3 methyl transferase  22.59 
 
 		 410 aa  60.5  0.00000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00760269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2122  NDP-hexose 3-C-methyltransferase TylCIII  23.98 
 
 		 409 aa  60.1  0.00000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0486559  normal  0.0722153 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3105  methyltransferase type 12  21.26 
 
 		 391 aa  60.1  0.00000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1799  methyltransferase domain-containing protein  26.13 
 
 		 378 aa  60.1  0.00000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.2313  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1321  methyltransferase type 12  23.86 
 
 		 396 aa  57.8  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1487  hypothetical protein  36.36 
 
 		 300 aa  56.6  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.767872 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1758  C-methyltransferase  20.41 
 
 		 409 aa  56.6  0.0000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.651546  normal  0.587212 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0365  C-methyltransferase  28.49 
 
 		 376 aa  56.6  0.0000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.131067  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3991  NDP-hexose 3-C-methyltransferase TylCIII  21.3 
 
 		 413 aa  56.2  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0126  Methyltransferase type 12  20.22 
 
 		 415 aa  54.7  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0105171  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1320  methyltransferase type 12  19.74 
 
 		 401 aa  53.5  0.000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3264  hypothetical protein  23.68 
 
 		 395 aa  52.4  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5655  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  26.77 
 
 		 392 aa  52.8  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5520  Methyltransferase type 12  28.32 
 
 		 306 aa  52  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.281271 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3910  hypothetical protein  29.45 
 
 		 305 aa  51.2  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.230808  normal  0.860748 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0535  hypothetical protein  22.53 
 
 		 379 aa  50.8  0.00004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3104  methyltransferase type 12  21.15 
 
 		 396 aa  50.1  0.00007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3380  Methyltransferase type 12  21.11 
 
 		 391 aa  50.1  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1775  methyltransferase type 12  25.6 
 
 		 298 aa  49.7  0.00009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2886  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  23.47 
 
 		 277 aa  49.3  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00412088 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3351  methyltransferase type 11  34.62 
 
 		 324 aa  49.3  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0865  Methyltransferase type 12  26.88 
 
 		 232 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1513  hypothetical protein  29.33 
 
 		 308 aa  48.5  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0813678  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>