70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_2994 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_2994  methyltransferase type 12  100 
 
 
401 aa  825    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.290652  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0163  putative methyltransferase  76.81 
 
 
401 aa  648    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0150  putative methyltransferase  76.31 
 
 
401 aa  644    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3959  C-methyltransferase  61.81 
 
 
414 aa  521  1e-147  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00636655  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02801  hypothetical protein  43.92 
 
 
411 aa  379  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.484397 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3347  methyltransferase  28.9 
 
 
390 aa  135  9e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0988027  normal  0.589908 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2391  methyltransferase type 12  27.03 
 
 
406 aa  127  5e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.044338  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3088  C-methyltransferase  25.27 
 
 
406 aa  106  9e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1565  methyltransferase type 12  25.68 
 
 
396 aa  105  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.663655  normal  0.440278 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3091  C-methyltransferase  25.44 
 
 
406 aa  104  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2166  Methyltransferase type 12  25.13 
 
 
397 aa  104  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6563  C-methyltransferase  24.88 
 
 
396 aa  101  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3714  methyltransferase type 11  27.1 
 
 
361 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2948  C-methyltransferase  23.58 
 
 
391 aa  96.3  9e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.236256  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2387  C-methyltransferase  24.94 
 
 
402 aa  95.1  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6557  methyltransferase type 12  27.57 
 
 
425 aa  94.4  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1566  putative sugar nucleotide processing enzyme  26.23 
 
 
414 aa  89.7  7e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.445342 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2163  C-methyltransferase  21.55 
 
 
421 aa  80.1  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.615529  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1964  methyltransferase type 11  22.3 
 
 
352 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4712  C-methyltransferase  24.93 
 
 
408 aa  72.8  0.000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.844153 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3380  Methyltransferase type 12  26.63 
 
 
391 aa  68.2  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2880  Methyltransferase type 11  27.71 
 
 
383 aa  63.9  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.252544  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4509  C-methyltransferase  22.47 
 
 
411 aa  63.5  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.391824  normal  0.0572283 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3401  methyltransferase  20.6 
 
 
407 aa  63.2  0.000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2759  C-methyltransferase  24.86 
 
 
405 aa  62.8  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.13285  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3375  methyltransferase  20.6 
 
 
407 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3397  methyltransferase, putative  20.35 
 
 
407 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3071  methyltransferase  20.25 
 
 
407 aa  60.1  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1809  putative sugar transferase  19.21 
 
 
401 aa  60.1  0.00000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1135  putative NDP-hexose methyltransferase protein  29.67 
 
 
407 aa  59.3  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0363  C-methyltransferase  24.13 
 
 
416 aa  58.5  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4217  C-methyltransferase  23.59 
 
 
411 aa  57.8  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.858444  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2118  C-methyltransferase  28.24 
 
 
406 aa  57.8  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.510018  normal  0.0302661 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29890  methyltransferase family protein  24.44 
 
 
408 aa  57.4  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.942698 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5655  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  24.69 
 
 
392 aa  56.6  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1758  C-methyltransferase  20.11 
 
 
409 aa  55.1  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.651546  normal  0.587212 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3333  C-methyltransferase  19.35 
 
 
413 aa  53.5  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6562  C-methyltransferase  24.03 
 
 
410 aa  52.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4987  C-methyltransferase  21.57 
 
 
431 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4588  Methyltransferase type 12  29.58 
 
 
457 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.28526  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5658  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  21.39 
 
 
421 aa  51.6  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311747  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0067  C-methyltransferase  24.5 
 
 
413 aa  50.8  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0480856  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1871  C-methyltransferase  23.5 
 
 
413 aa  50.8  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.804572  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4219  methyltransferase type 12  23.47 
 
 
412 aa  50.4  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0635  methyltransferase, putative  23.85 
 
 
411 aa  49.7  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3910  hypothetical protein  25.1 
 
 
305 aa  49.7  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.230808  normal  0.860748 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2784  C-methyltransferase  19.3 
 
 
413 aa  49.7  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.611308 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3105  methyltransferase type 12  22.67 
 
 
391 aa  48.9  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1402  Methyltransferase type 11  23.08 
 
 
394 aa  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2770  methyltransferase type 12  20.05 
 
 
408 aa  47.4  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3803  Methyltransferase type 12  22.04 
 
 
300 aa  47.8  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157905  normal  0.599602 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1306  hypothetical protein  28.03 
 
 
297 aa  47  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.782095 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3390  C-methyltransferase  21.45 
 
 
420 aa  46.6  0.0008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0218606  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3716  C-methyltransferase  21.43 
 
 
407 aa  46.6  0.0009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2158  C-methyltransferase  23.68 
 
 
409 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1221  C-methyltransferase  24.33 
 
 
419 aa  45.1  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.38117  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0438  methyltransferase, putative  20.38 
 
 
433 aa  45.4  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.874295  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27750  hypothetical protein  22.13 
 
 
373 aa  45.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0057  putative C-3 methyl transferase  22.65 
 
 
410 aa  45.1  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00760269  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0381  putative methyltransferase  20.38 
 
 
433 aa  45.1  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0629  hypothetical protein  23.55 
 
 
409 aa  44.7  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3060  C-methyltransferase  19.69 
 
 
406 aa  43.9  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1631  Methyltransferase type 12  29.08 
 
 
318 aa  43.5  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1556  Methyltransferase type 12  29.08 
 
 
318 aa  43.5  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1082  methyltransferase type 12  24.65 
 
 
215 aa  43.5  0.007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.578159  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1749  Methyltransferase type 11  27.81 
 
 
323 aa  43.1  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.16946 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1471  methyltransferase type 11  27.81 
 
 
323 aa  43.1  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0736602 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0752  methyltransferase type 11  26.19 
 
 
214 aa  43.1  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4417  C-methyltransferase  21.73 
 
 
438 aa  43.1  0.008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1471  Methyltransferase type 11  28.34 
 
 
333 aa  43.1  0.01  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.133968 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>