102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0848 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_0848  C-methyltransferase  100 
 
 
409 aa  832    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.436527  normal  0.303178 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0772  C-methyltransferase  94.38 
 
 
409 aa  787    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0227083 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0807  C-methyltransferase  97.56 
 
 
409 aa  815    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.409336 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3333  C-methyltransferase  52.55 
 
 
413 aa  472  1e-132  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2784  C-methyltransferase  52.31 
 
 
413 aa  469  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.611308 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4987  C-methyltransferase  54.7 
 
 
431 aa  455  1e-127  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4509  C-methyltransferase  54.88 
 
 
411 aa  457  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.391824  normal  0.0572283 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4217  C-methyltransferase  54.88 
 
 
411 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.858444  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5197  C-methyltransferase  53.17 
 
 
415 aa  453  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3071  methyltransferase  52.21 
 
 
407 aa  435  1e-121  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3401  methyltransferase  51.47 
 
 
407 aa  435  1e-121  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3375  methyltransferase  50.98 
 
 
407 aa  435  1e-121  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3397  methyltransferase, putative  51.47 
 
 
407 aa  434  1e-120  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4219  methyltransferase type 12  52.87 
 
 
412 aa  434  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1048  putative SAM-dependent methyltransferase  52.83 
 
 
420 aa  432  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195919  normal  0.773577 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0776  C-methyltransferase  49.51 
 
 
411 aa  431  1e-119  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3390  C-methyltransferase  49.63 
 
 
420 aa  425  1e-118  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0218606  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1513  hypothetical protein  50.74 
 
 
408 aa  422  1e-117  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0594  C-methyltransferase  53.6 
 
 
407 aa  424  1e-117  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.881628  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0438  methyltransferase, putative  49.38 
 
 
433 aa  419  1e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.874295  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0381  putative methyltransferase  49.13 
 
 
433 aa  419  1e-116  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2770  methyltransferase type 12  50.12 
 
 
408 aa  416  9.999999999999999e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3350  C-methyltransferase  52.41 
 
 
400 aa  417  9.999999999999999e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.295208  normal  0.715465 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0629  hypothetical protein  54.19 
 
 
409 aa  415  9.999999999999999e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3716  C-methyltransferase  51.48 
 
 
407 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0363  C-methyltransferase  51.6 
 
 
416 aa  410  1e-113  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1962  C-methyltransferase  50.12 
 
 
407 aa  402  1e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27750  hypothetical protein  55.91 
 
 
373 aa  397  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1871  C-methyltransferase  53.69 
 
 
413 aa  395  1e-109  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.804572  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3060  C-methyltransferase  47.9 
 
 
406 aa  382  1e-105  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0057  putative C-3 methyl transferase  48.54 
 
 
410 aa  377  1e-103  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00760269  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4417  C-methyltransferase  50.36 
 
 
438 aa  376  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0635  methyltransferase, putative  45.3 
 
 
411 aa  372  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14051  hypothetical protein  46.42 
 
 
402 aa  359  5e-98  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0067  C-methyltransferase  44.03 
 
 
413 aa  352  5.9999999999999994e-96  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0480856  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2947  C-methyltransferase  47.03 
 
 
415 aa  334  1e-90  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00433807  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3938  methyltransferase type 12  46.45 
 
 
444 aa  312  7.999999999999999e-84  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.16065  normal  0.145676 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0790  C-methyltransferase  44.19 
 
 
427 aa  299  6e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00493713  normal  0.231188 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6562  C-methyltransferase  44.03 
 
 
410 aa  297  2e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4225  C-methyltransferase  36.91 
 
 
407 aa  281  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.791496  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2158  C-methyltransferase  37.31 
 
 
409 aa  276  3e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3092  C-methyltransferase  41 
 
 
410 aa  271  1e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.763523  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2386  C-methyltransferase  40.51 
 
 
410 aa  269  8e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1221  C-methyltransferase  38.33 
 
 
419 aa  256  4e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.38117  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4712  C-methyltransferase  36.27 
 
 
408 aa  233  4.0000000000000004e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.844153 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2379  C-methyltransferase  32.15 
 
 
400 aa  230  3e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5658  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  31.92 
 
 
421 aa  228  1e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311747  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2430  C-methyltransferase  31.9 
 
 
400 aa  228  1e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29890  methyltransferase family protein  34.65 
 
 
408 aa  223  4e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.942698 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2118  C-methyltransferase  34.9 
 
 
406 aa  219  6e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.510018  normal  0.0302661 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2759  C-methyltransferase  34.16 
 
 
405 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.13285  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07271  hypothetical protein  27.43 
 
 
418 aa  193  4e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.298061  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2265  C-methyltransferase  27.23 
 
 
436 aa  182  9.000000000000001e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1599  D-mycarose 3-C-methyltransferase  28.95 
 
 
416 aa  180  4.999999999999999e-44  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1758  C-methyltransferase  28.4 
 
 
409 aa  173  5.999999999999999e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.651546  normal  0.587212 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2122  NDP-hexose 3-C-methyltransferase TylCIII  26.1 
 
 
409 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0486559  normal  0.0722153 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3991  NDP-hexose 3-C-methyltransferase TylCIII  28.27 
 
 
413 aa  164  3e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2403  C-methyltransferase  32.43 
 
 
400 aa  159  9e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0705  methyltransferase  28.23 
 
 
412 aa  147  3e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0809  NDP-hexose 3-C-methyltransferase TylCIII  28.23 
 
 
412 aa  147  3e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0365  C-methyltransferase  30.46 
 
 
376 aa  114  3e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.131067  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2387  C-methyltransferase  26.25 
 
 
402 aa  108  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0212  C-methyltransferase  32.89 
 
 
359 aa  107  5e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.821739 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0071  aminotransferase class-III  28.18 
 
 
817 aa  103  7e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2948  C-methyltransferase  25.25 
 
 
391 aa  97.1  5e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.236256  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1565  methyltransferase type 12  24.1 
 
 
396 aa  92.4  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.663655  normal  0.440278 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3091  C-methyltransferase  23.59 
 
 
406 aa  91.3  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6563  C-methyltransferase  23.48 
 
 
396 aa  83.6  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1270  NDP-hexose 3-C-methyltransferase TylCIII  35.94 
 
 
178 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0673649 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3088  C-methyltransferase  26.5 
 
 
406 aa  79.7  0.00000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2880  Methyltransferase type 11  24.57 
 
 
383 aa  79.3  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.252544  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2391  methyltransferase type 12  25.31 
 
 
406 aa  77  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.044338  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3347  methyltransferase  25.56 
 
 
390 aa  69.3  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0988027  normal  0.589908 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3714  methyltransferase type 11  26.84 
 
 
361 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2163  C-methyltransferase  19.89 
 
 
421 aa  63.9  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.615529  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1964  methyltransferase type 11  23.8 
 
 
352 aa  61.6  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1566  putative sugar nucleotide processing enzyme  24.76 
 
 
414 aa  60.5  0.00000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.445342 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6557  methyltransferase type 12  24.87 
 
 
425 aa  60.1  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1809  putative sugar transferase  22.17 
 
 
401 aa  59.7  0.00000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3959  C-methyltransferase  25 
 
 
414 aa  59.7  0.00000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00636655  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2164  methyltransferase type 11  27.23 
 
 
346 aa  59.3  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02801  hypothetical protein  21.48 
 
 
411 aa  57  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.484397 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2166  Methyltransferase type 12  20.51 
 
 
397 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0617  Methyltransferase type 12  23.5 
 
 
310 aa  51.6  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0164647 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1799  methyltransferase domain-containing protein  21.37 
 
 
378 aa  51.6  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.2313  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5655  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  21.6 
 
 
392 aa  49.7  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0453  hypothetical protein  28.71 
 
 
305 aa  48.9  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3267  hypothetical protein  33.01 
 
 
303 aa  48.1  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0369  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.81 
 
 
248 aa  48.1  0.0002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4274  methyltransferase type 11  29.52 
 
 
222 aa  48.1  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.254306  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2963  methyltransferase type 12  31.13 
 
 
303 aa  47.8  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1581  methyltransferase type 11  21.38 
 
 
232 aa  47.4  0.0005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000326286  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0370  methyltransferase type 12  28.57 
 
 
382 aa  47  0.0006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2327  methylase  22.5 
 
 
241 aa  45.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.102662  normal  0.330615 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33332  predicted protein  23.46 
 
 
430 aa  45.1  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.32323 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4412  methyltransferase type 11  25.29 
 
 
303 aa  44.7  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.033739  normal  0.97195 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2384  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  24.12 
 
 
258 aa  45.1  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.528666  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0106  methyltransferase type 12  22.14 
 
 
306 aa  44.3  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000284903 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3002  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.46 
 
 
253 aa  43.9  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3351  methyltransferase type 11  25.75 
 
 
324 aa  43.9  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>