101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1962 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1962  C-methyltransferase  100 
 
 		 407 aa  845    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2770  methyltransferase type 12  63.14 
 
 		 408 aa  551  1e-156  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0594  C-methyltransferase  63.39 
 
 		 407 aa  551  1e-156  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.881628  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3060  C-methyltransferase  64.37 
 
 		 406 aa  532  1e-150  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3350  C-methyltransferase  55.67 
 
 		 400 aa  458  9.999999999999999e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.295208  normal  0.715465 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0438  methyltransferase, putative  51.36 
 
 		 433 aa  433  1e-120  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.874295  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2784  C-methyltransferase  49.88 
 
 		 413 aa  431  1e-120  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.611308 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3390  C-methyltransferase  51.36 
 
 		 420 aa  429  1e-119  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0218606  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3716  C-methyltransferase  54.55 
 
 		 407 aa  431  1e-119  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3333  C-methyltransferase  49.88 
 
 		 413 aa  431  1e-119  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0629  hypothetical protein  52.58 
 
 		 409 aa  431  1e-119  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1513  hypothetical protein  51.72 
 
 		 408 aa  426  1e-118  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4417  C-methyltransferase  52.2 
 
 		 438 aa  425  1e-118  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0381  putative methyltransferase  50.86 
 
 		 433 aa  426  1e-118  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4219  methyltransferase type 12  50.12 
 
 		 412 aa  422  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1048  putative SAM-dependent methyltransferase  51.74 
 
 		 420 aa  422  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195919  normal  0.773577 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5197  C-methyltransferase  51.6 
 
 		 415 aa  422  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4509  C-methyltransferase  50 
 
 		 411 aa  422  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.391824  normal  0.0572283 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4217  C-methyltransferase  49.51 
 
 		 411 aa  412  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.858444  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27750  hypothetical protein  55.38 
 
 		 373 aa  410  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0848  C-methyltransferase  50.12 
 
 		 409 aa  402  1e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.436527  normal  0.303178 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0807  C-methyltransferase  50.12 
 
 		 409 aa  404  1e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.409336 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0057  putative C-3 methyl transferase  51.6 
 
 		 410 aa  401  9.999999999999999e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00760269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4987  C-methyltransferase  48.03 
 
 		 431 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14051  hypothetical protein  49.01 
 
 		 402 aa  397  1e-109  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0772  C-methyltransferase  49.63 
 
 		 409 aa  392  1e-108  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0227083 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3397  methyltransferase, putative  48.28 
 
 		 407 aa  379  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0776  C-methyltransferase  47.29 
 
 		 411 aa  380  1e-104  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3401  methyltransferase  48.28 
 
 		 407 aa  380  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3071  methyltransferase  48.28 
 
 		 407 aa  378  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3375  methyltransferase  47.54 
 
 		 407 aa  375  1e-103  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0363  C-methyltransferase  45.43 
 
 		 416 aa  370  1e-101  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0635  methyltransferase, putative  44.2 
 
 		 411 aa  366  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0067  C-methyltransferase  44.8 
 
 		 413 aa  363  3e-99  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0480856  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1871  C-methyltransferase  45.81 
 
 		 413 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.804572  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2386  C-methyltransferase  44.95 
 
 		 410 aa  328  1.0000000000000001e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2947  C-methyltransferase  44.44 
 
 		 415 aa  320  3.9999999999999996e-86  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00433807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6562  C-methyltransferase  42.86 
 
 		 410 aa  317  3e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2158  C-methyltransferase  41.13 
 
 		 409 aa  311  9e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3938  methyltransferase type 12  44.42 
 
 		 444 aa  311  2e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.16065  normal  0.145676 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3092  C-methyltransferase  43.39 
 
 		 410 aa  310  4e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.763523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0790  C-methyltransferase  43.18 
 
 		 427 aa  293  4e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00493713  normal  0.231188 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4225  C-methyltransferase  33.83 
 
 		 407 aa  269  7e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.791496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29890  methyltransferase family protein  34.24 
 
 		 408 aa  256  3e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.942698 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4712  C-methyltransferase  35.32 
 
 		 408 aa  249  6e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.844153 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2118  C-methyltransferase  33.58 
 
 		 406 aa  246  4.9999999999999997e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.510018  normal  0.0302661 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2759  C-methyltransferase  33.17 
 
 		 405 aa  244  3e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.13285  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5658  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  32.09 
 
 		 421 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1221  C-methyltransferase  32.77 
 
 		 419 aa  226  4e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.38117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07271  hypothetical protein  29.34 
 
 		 418 aa  217  2.9999999999999998e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.298061  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2379  C-methyltransferase  30.47 
 
 		 400 aa  210  3e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2430  C-methyltransferase  29.98 
 
 		 400 aa  205  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2265  C-methyltransferase  28.68 
 
 		 436 aa  192  1e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1758  C-methyltransferase  26.59 
 
 		 409 aa  184  2.0000000000000003e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.651546  normal  0.587212 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1599  D-mycarose 3-C-methyltransferase  26.52 
 
 		 416 aa  176  9.999999999999999e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2403  C-methyltransferase  33 
 
 		 400 aa  171  2e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2122  NDP-hexose 3-C-methyltransferase TylCIII  24.94 
 
 		 409 aa  169  1e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0486559  normal  0.0722153 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3991  NDP-hexose 3-C-methyltransferase TylCIII  25.85 
 
 		 413 aa  155  1e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0809  NDP-hexose 3-C-methyltransferase TylCIII  24.87 
 
 		 412 aa  152  8e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0705  methyltransferase  24.87 
 
 		 412 aa  152  1e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0212  C-methyltransferase  32.64 
 
 		 359 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821739 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1565  methyltransferase type 12  25.82 
 
 		 396 aa  103  7e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.663655  normal  0.440278 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0071  aminotransferase class-III  32.29 
 
 		 817 aa  102  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1270  NDP-hexose 3-C-methyltransferase TylCIII  31.29 
 
 		 178 aa  101  3e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0673649 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6563  C-methyltransferase  23.81 
 
 		 396 aa  99.8  7e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0365  C-methyltransferase  26.74 
 
 		 376 aa  92.8  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.131067  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2880  Methyltransferase type 11  27.87 
 
 		 383 aa  90.9  4e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.252544  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2948  C-methyltransferase  24.44 
 
 		 391 aa  84.7  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.236256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3088  C-methyltransferase  24.19 
 
 		 406 aa  81.3  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3091  C-methyltransferase  22.39 
 
 		 406 aa  80.1  0.00000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2391  methyltransferase type 12  24.42 
 
 		 406 aa  77  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.044338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2387  C-methyltransferase  21.1 
 
 		 402 aa  76.3  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2163  C-methyltransferase  21.63 
 
 		 421 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.615529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3714  methyltransferase type 11  24.65 
 
 		 361 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3959  C-methyltransferase  21.89 
 
 		 414 aa  65.1  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00636655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0370  methyltransferase type 12  27.81 
 
 		 382 aa  63.2  0.000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3347  methyltransferase  23.16 
 
 		 390 aa  62.4  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0988027  normal  0.589908 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1566  putative sugar nucleotide processing enzyme  25.08 
 
 		 414 aa  59.3  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.445342 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0617  Methyltransferase type 12  25.52 
 
 		 310 aa  55.8  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0164647 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6557  methyltransferase type 12  25.78 
 
 		 425 aa  54.7  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1809  putative sugar transferase  19.69 
 
 		 401 aa  53.9  0.000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1799  methyltransferase domain-containing protein  20.82 
 
 		 378 aa  53.5  0.000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.2313  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1964  methyltransferase type 11  24.57 
 
 		 352 aa  53.5  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2963  methyltransferase type 12  28.04 
 
 		 303 aa  50.8  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2166  Methyltransferase type 12  19.03 
 
 		 397 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0453  hypothetical protein  27.18 
 
 		 305 aa  50.4  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  26.42 
 
 		 1177 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3160  methyltransferase type 12  22.7 
 
 		 222 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.657234  normal  0.0993246 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  25.91 
 
 		 1177 aa  47  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5655  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  23.92 
 
 		 392 aa  47  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02801  hypothetical protein  19.54 
 
 		 411 aa  45.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.484397 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3267  hypothetical protein  26.17 
 
 		 303 aa  44.7  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4934  Methyltransferase type 11  28.95 
 
 		 332 aa  43.9  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.310878 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0994  methyltransferase type 11  29.51 
 
 		 245 aa  43.9  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.295346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0106  methyltransferase type 12  25.96 
 
 		 306 aa  43.9  0.006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000284903 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2555  methyltransferase type 12  22.89 
 
 		 226 aa  43.5  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0699179  decreased coverage  0.00777364 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1306  hypothetical protein  22.36 
 
 		 297 aa  43.5  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.782095 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2164  methyltransferase type 11  27.33 
 
 		 346 aa  43.5  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4655  Methyltransferase type 11  30.69 
 
 		 310 aa  43.5  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0904903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1001  methyltransferase type 11  22.89 
 
 		 282 aa  43.1  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>