91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_4739 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010678  Rpic_4739  Methyltransferase type 12  100 
 
 		 391 aa  812    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.751981  normal  0.502527 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3662  Methyltransferase type 12  100 
 
 		 391 aa  812    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.563292 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3088  C-methyltransferase  22.92 
 
 		 406 aa  65.1  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6557  methyltransferase type 12  23.79 
 
 		 425 aa  61.6  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1566  putative sugar nucleotide processing enzyme  25.19 
 
 		 414 aa  62  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.445342 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1135  putative NDP-hexose methyltransferase protein  26.9 
 
 		 407 aa  59.3  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2391  methyltransferase type 12  22.14 
 
 		 406 aa  57.4  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.044338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3272  methyltransferase type 11  25.52 
 
 		 202 aa  57  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.554198  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0126  Methyltransferase type 12  24.85 
 
 		 415 aa  54.3  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0105171  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0835  Methyltransferase type 12  28.19 
 
 		 273 aa  54.3  0.000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0535  hypothetical protein  23.12 
 
 		 379 aa  53.5  0.000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0420  Methyltransferase type 11  24.9 
 
 		 335 aa  53.5  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.849842 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5520  Methyltransferase type 12  32.18 
 
 		 306 aa  53.5  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.281271 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3053  methyltransferase type 12  23.02 
 
 		 332 aa  53.5  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1325  methyltransferase type 12  23.08 
 
 		 240 aa  53.1  0.000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000858625 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3477  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 187 aa  52.8  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.124831  normal  0.285215 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1799  methyltransferase domain-containing protein  20.21 
 
 		 378 aa  52  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.2313  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3910  hypothetical protein  28.93 
 
 		 305 aa  51.6  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.230808  normal  0.860748 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2123  hypothetical protein  32.61 
 
 		 264 aa  51.2  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0296  Methyltransferase type 12  22.78 
 
 		 326 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2886  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  26.87 
 
 		 277 aa  51.2  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00412088 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2291  methyltransferase type 11  31.13 
 
 		 270 aa  50.4  0.00006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0189  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  24.6 
 
 		 275 aa  50.1  0.00008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4444  glycosyl transferase family protein  25.88 
 
 		 519 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0296  Methyltransferase type 12  24 
 
 		 326 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0160  UbiE/COQ5 methyltransferase  23.9 
 
 		 293 aa  48.1  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0360  lipopolysaccharide biosynthesis protein (WbpM)-like  30.19 
 
 		 649 aa  48.5  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2880  Methyltransferase type 11  26.55 
 
 		 383 aa  48.5  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.252544  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0617  Methyltransferase type 12  27.03 
 
 		 310 aa  48.1  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0164647 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3105  methyltransferase type 12  22.18 
 
 		 391 aa  48.5  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2170  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  28.04 
 
 		 303 aa  48.1  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0560601  hitchhiker  0.0000129076 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0317  Methyltransferase type 12  31.3 
 
 		 241 aa  47.8  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3991  NDP-hexose 3-C-methyltransferase TylCIII  22.39 
 
 		 413 aa  48.1  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3380  Methyltransferase type 12  24.27 
 
 		 391 aa  47.4  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6054  methyltransferase type 11  25.15 
 
 		 241 aa  47.4  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.202203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2423  methyltransferase type 11  27.72 
 
 		 254 aa  47.4  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0780053 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4080  methyltransferase type 12  22.86 
 
 		 274 aa  47.4  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0971  methyltransferase type 11  23.04 
 
 		 330 aa  47.4  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3232  hypothetical protein  25.41 
 
 		 323 aa  47.4  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.470904  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0891  methyltransferase type 11  29.25 
 
 		 267 aa  47.4  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.304203  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2627  methyltransferase type 11  29.14 
 
 		 306 aa  47  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  26.74 
 
 		 255 aa  46.6  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1306  hypothetical protein  25.79 
 
 		 297 aa  46.6  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.782095 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1324  methyltransferase type 11  24.86 
 
 		 248 aa  46.6  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.386033  hitchhiker  0.000000000822833 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1490  Methyltransferase type 11  27.83 
 
 		 288 aa  47  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000818174 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3091  C-methyltransferase  23.72 
 
 		 406 aa  46.6  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1513  hypothetical protein  20.96 
 
 		 408 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  33.78 
 
 		 1177 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6261  Methyltransferase type 12  20.72 
 
 		 298 aa  45.8  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1014  Methyltransferase type 11  28.47 
 
 		 1155 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3716  C-methyltransferase  26.61 
 
 		 407 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  33.78 
 
 		 1177 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0233  Methyltransferase type 12  23.65 
 
 		 305 aa  45.8  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2682  Methyltransferase type 12  29.66 
 
 		 358 aa  46.2  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.454648  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3445  Methyltransferase type 11  27.75 
 
 		 269 aa  46.2  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2117  Methyltransferase type 11  25.9 
 
 		 221 aa  46.2  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2948  C-methyltransferase  23.71 
 
 		 391 aa  45.1  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.236256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2034  methyltransferase  24.31 
 
 		 202 aa  45.4  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00341547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0355  methyltransferase type 12  30.08 
 
 		 342 aa  45.1  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.896215 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4447  Methyltransferase type 11  26.76 
 
 		 219 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2387  C-methyltransferase  21.82 
 
 		 402 aa  45.1  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14431  hypothetical protein  23.32 
 
 		 341 aa  44.7  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.131958  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0965  methyltransferase type 11  25.85 
 
 		 217 aa  44.7  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00498957  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28280  methyltransferase family protein  33.63 
 
 		 258 aa  44.7  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.639383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0646  UbiE/COQ5 methyltransferase  23.89 
 
 		 253 aa  44.7  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1513  hypothetical protein  35.37 
 
 		 308 aa  44.3  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0813678  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2122  NDP-hexose 3-C-methyltransferase TylCIII  20.29 
 
 		 409 aa  44.7  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0486559  normal  0.0722153 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4987  C-methyltransferase  23.78 
 
 		 431 aa  44.7  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3351  methyltransferase type 11  22.81 
 
 		 324 aa  44.7  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3475  Methyltransferase type 11  21.97 
 
 		 268 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2759  C-methyltransferase  27.49 
 
 		 405 aa  44.3  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.13285  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2641  Methyltransferase type 11  21.97 
 
 		 268 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.307371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1171  hypothetical protein  27.03 
 
 		 351 aa  43.9  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5837  Methyltransferase type 11  24.55 
 
 		 206 aa  44.3  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.735155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6563  C-methyltransferase  22.33 
 
 		 396 aa  43.9  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2138  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 237 aa  43.9  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2851  hypothetical protein  24.49 
 
 		 286 aa  43.5  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0952286  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  34.88 
 
 		 1162 aa  43.5  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2291  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 251 aa  43.5  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.453235 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0866  hypothetical protein  35.06 
 
 		 224 aa  43.1  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4293  glycosyl transferase family protein  25.62 
 
 		 531 aa  43.5  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0605  polysaccharide biosynthesis protein CapD  37.33 
 
 		 666 aa  43.5  0.007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0935812  normal  0.274375 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4865  Methyltransferase type 11  23.95 
 
 		 218 aa  43.1  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.743669  normal  0.127304 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1462  methyltransferase type 11  22.69 
 
 		 285 aa  43.1  0.008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.032097 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3503  SAM-dependent methyltransferase  21.52 
 
 		 287 aa  43.1  0.009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0311533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  27.22 
 
 		 240 aa  43.1  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1484  glycosyl transferase WecB/TagA/CpsF  25.68 
 
 		 574 aa  43.1  0.009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.000853936  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0607  methyltransferase type 11  22.69 
 
 		 285 aa  43.1  0.009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.21069  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1781  methyltransferase type 11  22.69 
 
 		 285 aa  43.1  0.009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.33334  hitchhiker  0.000337573 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1001  methyltransferase type 11  25.58 
 
 		 282 aa  42.7  0.01  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2382  generic methyltransferase  23.18 
 
 		 243 aa  42.7  0.01  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.680927  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>