72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1320 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1320  methyltransferase type 12  100 
 
 		 401 aa  833    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3104  methyltransferase type 12  40.9 
 
 		 396 aa  298  1e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1321  methyltransferase type 12  39.39 
 
 		 396 aa  286  5.999999999999999e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3105  methyltransferase type 12  36.2 
 
 		 391 aa  266  7e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0382  Methyltransferase type 11  21.33 
 
 		 298 aa  59.3  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2391  methyltransferase type 12  20.85 
 
 		 406 aa  58.2  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.044338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0742  Methyltransferase type 12  26.73 
 
 		 275 aa  57.8  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1806  methyltransferase type 11  25.47 
 
 		 310 aa  57.4  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1402  Methyltransferase type 11  24.92 
 
 		 394 aa  57.4  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1471  methyltransferase type 11  26.14 
 
 		 323 aa  57  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0736602 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1749  Methyltransferase type 11  26.14 
 
 		 323 aa  57  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.16946 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3351  methyltransferase type 11  27.27 
 
 		 324 aa  56.6  0.0000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1471  Methyltransferase type 11  25.49 
 
 		 333 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.133968 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14091  hypothetical protein  25 
 
 		 310 aa  55.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0863653  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  23.32 
 
 		 1162 aa  54.3  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1566  putative sugar nucleotide processing enzyme  25.08 
 
 		 414 aa  53.5  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.445342 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3088  C-methyltransferase  19.74 
 
 		 406 aa  53.5  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2814  glycosyl transferase family protein  24.84 
 
 		 457 aa  53.1  0.000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6557  methyltransferase type 12  22.18 
 
 		 425 aa  52.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4464  Methyltransferase type 12  23.39 
 
 		 543 aa  52.8  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3232  hypothetical protein  27.7 
 
 		 323 aa  52.8  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.470904  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1484  glycosyl transferase WecB/TagA/CpsF  22.81 
 
 		 574 aa  52.4  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.000853936  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4274  methyltransferase type 11  26.67 
 
 		 222 aa  51.6  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.254306  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3347  methyltransferase  30.39 
 
 		 390 aa  51.2  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0988027  normal  0.589908 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0635  methyltransferase, putative  21.65 
 
 		 411 aa  50.8  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02801  hypothetical protein  22.02 
 
 		 411 aa  50.4  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.484397 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3714  methyltransferase type 11  30 
 
 		 361 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1556  Methyltransferase type 12  28.83 
 
 		 318 aa  50.4  0.00006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1631  Methyltransferase type 12  36.36 
 
 		 318 aa  50.1  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2546  Methyltransferase type 11  23.46 
 
 		 244 aa  49.7  0.00009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0272722 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3380  Methyltransferase type 12  24.2 
 
 		 391 aa  49.7  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1285  hypothetical protein  24.18 
 
 		 249 aa  49.3  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0057  putative C-3 methyl transferase  24.54 
 
 		 410 aa  48.9  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00760269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0490  Methyltransferase type 11  21.94 
 
 		 222 aa  48.9  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2386  C-methyltransferase  27.45 
 
 		 410 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3910  hypothetical protein  30.12 
 
 		 305 aa  48.9  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.230808  normal  0.860748 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1306  hypothetical protein  28.98 
 
 		 297 aa  47.8  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.782095 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1314  hypothetical protein  34.57 
 
 		 298 aa  48.1  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2166  Methyltransferase type 12  19.53 
 
 		 397 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1318  glycosyl transferase family protein  24 
 
 		 1314 aa  47.8  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.581884  normal  0.368047 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0971  methyltransferase type 11  23.9 
 
 		 330 aa  48.1  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0106  methyltransferase type 12  22.37 
 
 		 306 aa  47.8  0.0004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000284903 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1006  Methyltransferase type 11  23.33 
 
 		 242 aa  47.4  0.0004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00471985  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5454  methyltransferase type 11  23.08 
 
 		 317 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.80361 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3503  SAM-dependent methyltransferase  26.9 
 
 		 287 aa  47.4  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0311533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1809  putative sugar transferase  25.16 
 
 		 401 aa  47.4  0.0005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  24.71 
 
 		 240 aa  47  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1240  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.6 
 
 		 362 aa  47  0.0006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0688232  normal  0.839739 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5655  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  28.92 
 
 		 392 aa  46.2  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2158  C-methyltransferase  28.37 
 
 		 409 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0296  Methyltransferase type 12  35.06 
 
 		 326 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0296  Methyltransferase type 12  35.06 
 
 		 326 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4142  glycosyl transferase family protein  24.71 
 
 		 1287 aa  45.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000068759 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2682  Methyltransferase type 12  25.97 
 
 		 358 aa  44.7  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.454648  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3053  methyltransferase type 12  27.74 
 
 		 332 aa  44.7  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0420  Methyltransferase type 11  20.25 
 
 		 335 aa  44.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.849842 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5502  Methyltransferase type 12  22.16 
 
 		 217 aa  44.7  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.222085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2453  methyltransferase type 12  29.63 
 
 		 542 aa  44.7  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2948  C-methyltransferase  22.7 
 
 		 391 aa  44.3  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.236256  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1345  hypothetical protein  27.69 
 
 		 231 aa  44.3  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2627  methyltransferase type 11  20.77 
 
 		 306 aa  44.3  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0142  methyltransferase type 12  24.84 
 
 		 309 aa  44.3  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0355  methyltransferase type 12  25.42 
 
 		 342 aa  43.9  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.896215 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3318  hypothetical protein  25 
 
 		 243 aa  44.3  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3318  methyltransferase type 12  22.41 
 
 		 383 aa  43.9  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.434757 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2592  methyltransferase type 11  22.08 
 
 		 219 aa  43.9  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1578  hypothetical protein  23.92 
 
 		 447 aa  43.5  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.365139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1554  hypothetical protein  23.92 
 
 		 447 aa  43.5  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0126  Methyltransferase type 12  21.32 
 
 		 415 aa  43.9  0.006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0105171  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4412  methyltransferase type 11  22.78 
 
 		 303 aa  43.5  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.033739  normal  0.97195 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1135  putative NDP-hexose methyltransferase protein  21.4 
 
 		 407 aa  43.1  0.009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1565  methyltransferase type 12  23.97 
 
 		 396 aa  43.1  0.01  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.663655  normal  0.440278 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>