66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_0163 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_0163  putative methyltransferase  100 
 
 		 401 aa  815    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0150  putative methyltransferase  98.25 
 
 		 401 aa  804    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2994  methyltransferase type 12  76.81 
 
 		 401 aa  620  1e-176  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.290652  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3959  C-methyltransferase  62.59 
 
 		 414 aa  527  1e-148  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00636655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02801  hypothetical protein  44.91 
 
 		 411 aa  383  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.484397 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3347  methyltransferase  29.52 
 
 		 390 aa  134  3e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0988027  normal  0.589908 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3088  C-methyltransferase  27.81 
 
 		 406 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2391  methyltransferase type 12  28 
 
 		 406 aa  119  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.044338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2166  Methyltransferase type 12  26.53 
 
 		 397 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3714  methyltransferase type 11  26.75 
 
 		 361 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2948  C-methyltransferase  25.32 
 
 		 391 aa  101  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.236256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6557  methyltransferase type 12  26.04 
 
 		 425 aa  99.8  7e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3091  C-methyltransferase  24.75 
 
 		 406 aa  97.1  6e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2387  C-methyltransferase  25.06 
 
 		 402 aa  93.6  6e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1565  methyltransferase type 12  23.88 
 
 		 396 aa  87.8  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.663655  normal  0.440278 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1566  putative sugar nucleotide processing enzyme  26.11 
 
 		 414 aa  87  5e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.445342 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1964  methyltransferase type 11  25.22 
 
 		 352 aa  86.7  6e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6563  C-methyltransferase  24.01 
 
 		 396 aa  86.7  7e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2163  C-methyltransferase  22.83 
 
 		 421 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.615529  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4712  C-methyltransferase  25 
 
 		 408 aa  73.2  0.000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.844153 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1809  putative sugar transferase  18.57 
 
 		 401 aa  64.3  0.000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4987  C-methyltransferase  20.44 
 
 		 431 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2880  Methyltransferase type 11  26.33 
 
 		 383 aa  59.3  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.252544  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1135  putative NDP-hexose methyltransferase protein  28.96 
 
 		 407 aa  57.4  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29890  methyltransferase family protein  23.99 
 
 		 408 aa  55.1  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.942698 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4509  C-methyltransferase  23.96 
 
 		 411 aa  54.7  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.391824  normal  0.0572283 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4219  methyltransferase type 12  22.64 
 
 		 412 aa  54.3  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0363  C-methyltransferase  26.17 
 
 		 416 aa  53.9  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3105  methyltransferase type 12  21.72 
 
 		 391 aa  52  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2759  C-methyltransferase  23.81 
 
 		 405 aa  50.8  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.13285  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2118  C-methyltransferase  25.08 
 
 		 406 aa  50.4  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.510018  normal  0.0302661 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1402  Methyltransferase type 11  24.16 
 
 		 394 aa  50.1  0.00007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1631  Methyltransferase type 12  30.82 
 
 		 318 aa  50.1  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1556  Methyltransferase type 12  30.82 
 
 		 318 aa  50.1  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2122  NDP-hexose 3-C-methyltransferase TylCIII  20.24 
 
 		 409 aa  49.7  0.00008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0486559  normal  0.0722153 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1471  methyltransferase type 11  33.55 
 
 		 323 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0736602 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1749  Methyltransferase type 11  33.55 
 
 		 323 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.16946 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1758  C-methyltransferase  19.39 
 
 		 409 aa  49.7  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.651546  normal  0.587212 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1471  Methyltransferase type 11  31.79 
 
 		 333 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.133968 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27750  hypothetical protein  24.92 
 
 		 373 aa  48.5  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4588  Methyltransferase type 12  26.06 
 
 		 457 aa  47.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.28526  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3949  methyltransferase type 11  32.65 
 
 		 513 aa  47.4  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1871  C-methyltransferase  23.69 
 
 		 413 aa  47.4  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.804572  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3910  hypothetical protein  24.6 
 
 		 305 aa  46.2  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.230808  normal  0.860748 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5655  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  25.33 
 
 		 392 aa  45.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4217  C-methyltransferase  23.45 
 
 		 411 aa  45.8  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.858444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2164  methyltransferase type 11  22.22 
 
 		 346 aa  45.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3397  methyltransferase, putative  19.93 
 
 		 407 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5520  Methyltransferase type 12  22.4 
 
 		 306 aa  44.7  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.281271 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3716  C-methyltransferase  20.81 
 
 		 407 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6562  C-methyltransferase  22.03 
 
 		 410 aa  44.3  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1306  hypothetical protein  23.94 
 
 		 297 aa  44.3  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.782095 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3401  methyltransferase  20.13 
 
 		 407 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1082  methyltransferase type 12  27.16 
 
 		 215 aa  43.9  0.005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.578159  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2947  C-methyltransferase  23.86 
 
 		 415 aa  43.5  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00433807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5658  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  19.95 
 
 		 421 aa  43.5  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4417  C-methyltransferase  22.7 
 
 		 438 aa  43.5  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02860  hypothetical protein  22.92 
 
 		 215 aa  43.5  0.007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.584838  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1278  hypothetical protein  29.84 
 
 		 226 aa  43.5  0.007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0772  C-methyltransferase  23.33 
 
 		 409 aa  43.5  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0227083 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6253  methyltransferase domain-containing protein  25.16 
 
 		 276 aa  43.1  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.812952  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0629  hypothetical protein  23.51 
 
 		 409 aa  43.1  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2510  hypothetical protein  31.25 
 
 		 308 aa  43.1  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3803  Methyltransferase type 12  23.41 
 
 		 300 aa  43.1  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157905  normal  0.599602 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5240  hypothetical protein  31.91 
 
 		 245 aa  43.1  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.313704  normal  0.432968 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0067  C-methyltransferase  21.84 
 
 		 413 aa  42.7  0.01  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0480856  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>