120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3091 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2387  C-methyltransferase  85.15 
 
 		 402 aa  727    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3091  C-methyltransferase  100 
 
 		 406 aa  840    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2163  C-methyltransferase  53.09 
 
 		 421 aa  439  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.615529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1565  methyltransferase type 12  53.05 
 
 		 396 aa  424  1e-117  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.663655  normal  0.440278 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6563  C-methyltransferase  52.3 
 
 		 396 aa  403  1e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2391  methyltransferase type 12  46.82 
 
 		 406 aa  370  1e-101  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.044338  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2948  C-methyltransferase  47.72 
 
 		 391 aa  369  1e-101  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.236256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3088  C-methyltransferase  45.74 
 
 		 406 aa  357  1.9999999999999998e-97  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2166  Methyltransferase type 12  39.64 
 
 		 397 aa  342  1e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1566  putative sugar nucleotide processing enzyme  36.16 
 
 		 414 aa  266  7e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.445342 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6557  methyltransferase type 12  35.45 
 
 		 425 aa  250  3e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3347  methyltransferase  30.33 
 
 		 390 aa  176  6e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0988027  normal  0.589908 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1964  methyltransferase type 11  29.95 
 
 		 352 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3959  C-methyltransferase  27.18 
 
 		 414 aa  128  2.0000000000000002e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00636655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02801  hypothetical protein  23.5 
 
 		 411 aa  117  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.484397 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3714  methyltransferase type 11  28.86 
 
 		 361 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4987  C-methyltransferase  25 
 
 		 431 aa  105  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0772  C-methyltransferase  25.12 
 
 		 409 aa  101  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0227083 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4509  C-methyltransferase  24.43 
 
 		 411 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.391824  normal  0.0572283 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2994  methyltransferase type 12  25.44 
 
 		 401 aa  99.8  8e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.290652  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4217  C-methyltransferase  25.19 
 
 		 411 aa  98.2  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.858444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0163  putative methyltransferase  24.75 
 
 		 401 aa  97.1  6e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0150  putative methyltransferase  25.19 
 
 		 401 aa  95.9  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2158  C-methyltransferase  23.96 
 
 		 409 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1513  hypothetical protein  23.6 
 
 		 408 aa  93.6  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4219  methyltransferase type 12  26.18 
 
 		 412 aa  91.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0848  C-methyltransferase  23.59 
 
 		 409 aa  91.3  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.436527  normal  0.303178 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0067  C-methyltransferase  25.71 
 
 		 413 aa  90.5  5e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0480856  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1871  C-methyltransferase  25.81 
 
 		 413 aa  90.5  5e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.804572  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0807  C-methyltransferase  22.91 
 
 		 409 aa  89.7  8e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.409336 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29890  methyltransferase family protein  27.43 
 
 		 408 aa  88.6  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.942698 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3060  C-methyltransferase  20.39 
 
 		 406 aa  89  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2880  Methyltransferase type 11  28.14 
 
 		 383 aa  88.2  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.252544  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1809  putative sugar transferase  20.67 
 
 		 401 aa  88.2  3e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0629  hypothetical protein  23.57 
 
 		 409 aa  87.8  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0635  methyltransferase, putative  25.19 
 
 		 411 aa  86.7  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3716  C-methyltransferase  25.77 
 
 		 407 aa  86.7  6e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3350  C-methyltransferase  25.26 
 
 		 400 aa  86.3  8e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.295208  normal  0.715465 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2770  methyltransferase type 12  23.26 
 
 		 408 aa  86.3  9e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0438  methyltransferase, putative  23.1 
 
 		 433 aa  85.9  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.874295  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0381  putative methyltransferase  23.35 
 
 		 433 aa  85.5  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3390  C-methyltransferase  24.62 
 
 		 420 aa  83.6  0.000000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0218606  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0363  C-methyltransferase  25.69 
 
 		 416 aa  83.2  0.000000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3333  C-methyltransferase  22.92 
 
 		 413 aa  83.2  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0594  C-methyltransferase  24.12 
 
 		 407 aa  82.4  0.00000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.881628  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3375  methyltransferase  23.35 
 
 		 407 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27750  hypothetical protein  24.09 
 
 		 373 aa  82.4  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2386  C-methyltransferase  26.74 
 
 		 410 aa  82  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4417  C-methyltransferase  23.63 
 
 		 438 aa  80.9  0.00000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5197  C-methyltransferase  23.12 
 
 		 415 aa  80.9  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0790  C-methyltransferase  25.26 
 
 		 427 aa  80.1  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00493713  normal  0.231188 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1962  C-methyltransferase  22.39 
 
 		 407 aa  80.1  0.00000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3071  methyltransferase  22.34 
 
 		 407 aa  79.7  0.00000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3401  methyltransferase  22.39 
 
 		 407 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2784  C-methyltransferase  22.64 
 
 		 413 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.611308 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0776  C-methyltransferase  21.14 
 
 		 411 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3397  methyltransferase, putative  22.39 
 
 		 407 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1221  C-methyltransferase  25.5 
 
 		 419 aa  77  0.0000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.38117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14051  hypothetical protein  20.92 
 
 		 402 aa  75.9  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5658  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  23.31 
 
 		 421 aa  75.9  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4225  C-methyltransferase  23.59 
 
 		 407 aa  75.9  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.791496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3938  methyltransferase type 12  24.62 
 
 		 444 aa  75.1  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.16065  normal  0.145676 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2947  C-methyltransferase  23.51 
 
 		 415 aa  75.5  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00433807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6562  C-methyltransferase  25.69 
 
 		 410 aa  74.3  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2265  C-methyltransferase  21.23 
 
 		 436 aa  71.6  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1758  C-methyltransferase  21.8 
 
 		 409 aa  72  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.651546  normal  0.587212 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3092  C-methyltransferase  27.98 
 
 		 410 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.763523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1048  putative SAM-dependent methyltransferase  23.71 
 
 		 420 aa  71.6  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195919  normal  0.773577 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0057  putative C-3 methyl transferase  23.68 
 
 		 410 aa  68.6  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00760269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3991  NDP-hexose 3-C-methyltransferase TylCIII  22.31 
 
 		 413 aa  67.4  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0809  NDP-hexose 3-C-methyltransferase TylCIII  20.85 
 
 		 412 aa  64.3  0.000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0705  methyltransferase  20.85 
 
 		 412 aa  63.9  0.000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0365  C-methyltransferase  29.38 
 
 		 376 aa  63.9  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.131067  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2759  C-methyltransferase  24.75 
 
 		 405 aa  63.5  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.13285  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1799  methyltransferase domain-containing protein  21.75 
 
 		 378 aa  62  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.2313  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2118  C-methyltransferase  24.69 
 
 		 406 aa  62.4  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.510018  normal  0.0302661 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2122  NDP-hexose 3-C-methyltransferase TylCIII  19.25 
 
 		 409 aa  61.2  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0486559  normal  0.0722153 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07271  hypothetical protein  20.53 
 
 		 418 aa  58.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.298061  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2430  C-methyltransferase  20.51 
 
 		 400 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0126  Methyltransferase type 12  21.39 
 
 		 415 aa  55.8  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0105171  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2886  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  25.1 
 
 		 277 aa  55.8  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00412088 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2379  C-methyltransferase  20.25 
 
 		 400 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5655  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  24.48 
 
 		 392 aa  54.7  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3380  Methyltransferase type 12  23.1 
 
 		 391 aa  53.1  0.000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3053  methyltransferase type 12  26.44 
 
 		 332 aa  52.8  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0453  hypothetical protein  27.7 
 
 		 305 aa  51.6  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0212  C-methyltransferase  28.25 
 
 		 359 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821739 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3910  hypothetical protein  30.72 
 
 		 305 aa  52  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.230808  normal  0.860748 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0535  hypothetical protein  17.73 
 
 		 379 aa  51.6  0.00002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3104  methyltransferase type 12  24.87 
 
 		 396 aa  51.2  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1121  methyltransferase type 11  25.7 
 
 		 293 aa  50.1  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.536452  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1484  glycosyl transferase WecB/TagA/CpsF  26.7 
 
 		 574 aa  49.3  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.000853936  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1321  methyltransferase type 12  24.19 
 
 		 396 aa  49.3  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2740  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  23.15 
 
 		 238 aa  48.5  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2403  C-methyltransferase  21.22 
 
 		 400 aa  48.1  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1599  D-mycarose 3-C-methyltransferase  20.65 
 
 		 416 aa  47.8  0.0004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1578  hypothetical protein  23.11 
 
 		 447 aa  47.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.365139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0420  Methyltransferase type 11  27.59 
 
 		 335 aa  47.4  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.849842 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1554  hypothetical protein  23.11 
 
 		 447 aa  47.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0071  aminotransferase class-III  27.33 
 
 		 817 aa  47  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>