126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6557 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6557  methyltransferase type 12  100 
 
 		 425 aa  857    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1566  putative sugar nucleotide processing enzyme  73.43 
 
 		 414 aa  583  1.0000000000000001e-165  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.445342 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2391  methyltransferase type 12  43.83 
 
 		 406 aa  311  2e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.044338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3088  C-methyltransferase  41.31 
 
 		 406 aa  303  4.0000000000000003e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2166  Methyltransferase type 12  31.83 
 
 		 397 aa  262  1e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2387  C-methyltransferase  36.41 
 
 		 402 aa  258  2e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3091  C-methyltransferase  35.45 
 
 		 406 aa  250  3e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2163  C-methyltransferase  33 
 
 		 421 aa  239  6.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.615529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1565  methyltransferase type 12  36.52 
 
 		 396 aa  224  3e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.663655  normal  0.440278 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6563  C-methyltransferase  35.07 
 
 		 396 aa  219  7e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2948  C-methyltransferase  34.65 
 
 		 391 aa  207  2e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.236256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3347  methyltransferase  32.1 
 
 		 390 aa  188  1e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0988027  normal  0.589908 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1964  methyltransferase type 11  29.26 
 
 		 352 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3714  methyltransferase type 11  30.93 
 
 		 361 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3959  C-methyltransferase  24.77 
 
 		 414 aa  112  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00636655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0163  putative methyltransferase  26.04 
 
 		 401 aa  99.8  8e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02801  hypothetical protein  24.29 
 
 		 411 aa  99.4  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.484397 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0150  putative methyltransferase  25.63 
 
 		 401 aa  97.4  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2880  Methyltransferase type 11  28.36 
 
 		 383 aa  96.7  7e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.252544  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2994  methyltransferase type 12  25.69 
 
 		 401 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.290652  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1809  putative sugar transferase  19.13 
 
 		 401 aa  84  0.000000000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0635  methyltransferase, putative  28.73 
 
 		 411 aa  77.4  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0363  C-methyltransferase  28.24 
 
 		 416 aa  76.6  0.0000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0057  putative C-3 methyl transferase  24.86 
 
 		 410 aa  75.5  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00760269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5197  C-methyltransferase  24.02 
 
 		 415 aa  73.9  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3716  C-methyltransferase  25.38 
 
 		 407 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2784  C-methyltransferase  24.42 
 
 		 413 aa  72.4  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.611308 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14051  hypothetical protein  22.43 
 
 		 402 aa  71.6  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1758  C-methyltransferase  24.16 
 
 		 409 aa  72  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.651546  normal  0.587212 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3333  C-methyltransferase  24.42 
 
 		 413 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4987  C-methyltransferase  24.73 
 
 		 431 aa  71.6  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2770  methyltransferase type 12  24.14 
 
 		 408 aa  71.2  0.00000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1513  hypothetical protein  23.31 
 
 		 408 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3401  methyltransferase  22.07 
 
 		 407 aa  67  0.0000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3397  methyltransferase, putative  22.58 
 
 		 407 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3071  methyltransferase  22 
 
 		 407 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0067  C-methyltransferase  29.48 
 
 		 413 aa  65.1  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0480856  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4217  C-methyltransferase  25 
 
 		 411 aa  64.7  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.858444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3375  methyltransferase  22.78 
 
 		 407 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0772  C-methyltransferase  24.94 
 
 		 409 aa  63.5  0.000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0227083 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3910  hypothetical protein  29.08 
 
 		 305 aa  63.2  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.230808  normal  0.860748 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1487  hypothetical protein  27.48 
 
 		 300 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.767872 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3318  methyltransferase type 12  27.42 
 
 		 383 aa  61.6  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.434757 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0629  hypothetical protein  25.79 
 
 		 409 aa  62.4  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3662  Methyltransferase type 12  23.79 
 
 		 391 aa  61.6  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.563292 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4739  Methyltransferase type 12  23.79 
 
 		 391 aa  61.6  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.751981  normal  0.502527 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0807  C-methyltransferase  25.06 
 
 		 409 aa  60.8  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.409336 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3060  C-methyltransferase  22.84 
 
 		 406 aa  60.5  0.00000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0848  C-methyltransferase  24.87 
 
 		 409 aa  60.1  0.00000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.436527  normal  0.303178 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4509  C-methyltransferase  27.93 
 
 		 411 aa  59.3  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.391824  normal  0.0572283 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2265  C-methyltransferase  21.91 
 
 		 436 aa  58.5  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1135  putative NDP-hexose methyltransferase protein  27.06 
 
 		 407 aa  57.8  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4219  methyltransferase type 12  23.77 
 
 		 412 aa  57.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5658  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  23.38 
 
 		 421 aa  57.8  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3105  methyltransferase type 12  24.27 
 
 		 391 aa  57.4  0.0000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0365  C-methyltransferase  32.77 
 
 		 376 aa  57.4  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.131067  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4417  C-methyltransferase  26.55 
 
 		 438 aa  57  0.0000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0382  Methyltransferase type 11  24.3 
 
 		 298 aa  57  0.0000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1871  C-methyltransferase  25.97 
 
 		 413 aa  57  0.0000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.804572  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0438  methyltransferase, putative  25.64 
 
 		 433 aa  56.6  0.0000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.874295  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1048  putative SAM-dependent methyltransferase  25.13 
 
 		 420 aa  56.2  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195919  normal  0.773577 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0594  C-methyltransferase  26.27 
 
 		 407 aa  55.8  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.881628  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0381  putative methyltransferase  25.38 
 
 		 433 aa  55.8  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0370  methyltransferase type 12  27.06 
 
 		 382 aa  55.5  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6562  C-methyltransferase  24.77 
 
 		 410 aa  55.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1962  C-methyltransferase  25.78 
 
 		 407 aa  54.7  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0420  Methyltransferase type 11  24.9 
 
 		 335 aa  55.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.849842 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0126  Methyltransferase type 12  19.91 
 
 		 415 aa  54.3  0.000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0105171  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4444  glycosyl transferase family protein  28.09 
 
 		 519 aa  54.3  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3053  methyltransferase type 12  25.6 
 
 		 332 aa  53.9  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0535  hypothetical protein  17.51 
 
 		 379 aa  53.9  0.000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1578  hypothetical protein  29.82 
 
 		 447 aa  53.5  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.365139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1554  hypothetical protein  29.82 
 
 		 447 aa  53.5  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3104  methyltransferase type 12  22.83 
 
 		 396 aa  52.4  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1320  methyltransferase type 12  22.18 
 
 		 401 aa  52.8  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0776  C-methyltransferase  21.89 
 
 		 411 aa  52.8  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2158  C-methyltransferase  24.08 
 
 		 409 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3938  methyltransferase type 12  25.12 
 
 		 444 aa  51.6  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.16065  normal  0.145676 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4432  glycosyl transferase family 2  27.53 
 
 		 527 aa  51.6  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2947  C-methyltransferase  23.21 
 
 		 415 aa  51.2  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00433807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4453  glycosyl transferase family 2  27.53 
 
 		 527 aa  51.2  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1402  Methyltransferase type 11  23.69 
 
 		 394 aa  51.2  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1350  methyltransferase type 12  31.29 
 
 		 1046 aa  50.4  0.00005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.041094  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0705  methyltransferase  21.99 
 
 		 412 aa  50.8  0.00005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2886  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  27.05 
 
 		 277 aa  50.4  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00412088 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3390  C-methyltransferase  24.35 
 
 		 420 aa  50.4  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0218606  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1318  glycosyl transferase family protein  26.83 
 
 		 1314 aa  50.4  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.581884  normal  0.368047 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1285  hypothetical protein  28 
 
 		 249 aa  50.4  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4293  glycosyl transferase family protein  26.4 
 
 		 531 aa  50.1  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0809  NDP-hexose 3-C-methyltransferase TylCIII  21.99 
 
 		 412 aa  50.1  0.00008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27750  hypothetical protein  25 
 
 		 373 aa  49.7  0.00009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5655  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  25.31 
 
 		 392 aa  49.3  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0742  Methyltransferase type 12  31.55 
 
 		 275 aa  49.7  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1513  hypothetical protein  29.75 
 
 		 308 aa  48.5  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0813678  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4712  C-methyltransferase  25.32 
 
 		 408 aa  48.5  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.844153 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14091  hypothetical protein  20 
 
 		 310 aa  48.9  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0863653  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1321  methyltransferase type 12  20.94 
 
 		 396 aa  48.9  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0790  C-methyltransferase  24.5 
 
 		 427 aa  48.9  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00493713  normal  0.231188 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0296  Methyltransferase type 12  29.89 
 
 		 326 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0296  Methyltransferase type 12  29.89 
 
 		 326 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>