118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4217 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_4217  C-methyltransferase  100 
 
 
411 aa  845    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.858444  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4509  C-methyltransferase  92.21 
 
 
411 aa  790    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.391824  normal  0.0572283 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4987  C-methyltransferase  56.48 
 
 
431 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3333  C-methyltransferase  54.72 
 
 
413 aa  494  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2784  C-methyltransferase  54.24 
 
 
413 aa  488  1e-137  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.611308 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5197  C-methyltransferase  54.99 
 
 
415 aa  482  1e-135  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4219  methyltransferase type 12  54.23 
 
 
412 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0772  C-methyltransferase  55.37 
 
 
409 aa  456  1e-127  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0227083 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0848  C-methyltransferase  54.88 
 
 
409 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.436527  normal  0.303178 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0594  C-methyltransferase  54.43 
 
 
407 aa  446  1.0000000000000001e-124  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.881628  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0807  C-methyltransferase  54.63 
 
 
409 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.409336 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2770  methyltransferase type 12  52.09 
 
 
408 aa  439  9.999999999999999e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3390  C-methyltransferase  50.12 
 
 
420 aa  433  1e-120  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0218606  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3350  C-methyltransferase  53.81 
 
 
400 aa  430  1e-119  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.295208  normal  0.715465 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0438  methyltransferase, putative  48.89 
 
 
433 aa  424  1e-117  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.874295  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0363  C-methyltransferase  51.6 
 
 
416 aa  422  1e-117  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1513  hypothetical protein  50 
 
 
408 aa  419  1e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1871  C-methyltransferase  53.58 
 
 
413 aa  420  1e-116  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.804572  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1048  putative SAM-dependent methyltransferase  50.49 
 
 
420 aa  415  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195919  normal  0.773577 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0381  putative methyltransferase  48.4 
 
 
433 aa  416  9.999999999999999e-116  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1962  C-methyltransferase  49.51 
 
 
407 aa  412  1e-114  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3397  methyltransferase, putative  48.3 
 
 
407 aa  408  1e-113  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3060  C-methyltransferase  51.23 
 
 
406 aa  410  1e-113  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3716  C-methyltransferase  52.57 
 
 
407 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0635  methyltransferase, putative  50 
 
 
411 aa  411  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3375  methyltransferase  48.3 
 
 
407 aa  410  1e-113  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0629  hypothetical protein  51.48 
 
 
409 aa  411  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3071  methyltransferase  47.8 
 
 
407 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3401  methyltransferase  48.06 
 
 
407 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0057  putative C-3 methyl transferase  50.39 
 
 
410 aa  396  1e-109  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00760269  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4417  C-methyltransferase  49.14 
 
 
438 aa  395  1e-109  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0776  C-methyltransferase  46.1 
 
 
411 aa  398  1e-109  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27750  hypothetical protein  54.45 
 
 
373 aa  397  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0067  C-methyltransferase  48.39 
 
 
413 aa  393  1e-108  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0480856  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3938  methyltransferase type 12  49.39 
 
 
444 aa  363  2e-99  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.16065  normal  0.145676 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14051  hypothetical protein  44.44 
 
 
402 aa  353  5e-96  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2947  C-methyltransferase  45.45 
 
 
415 aa  344  1e-93  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00433807  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0790  C-methyltransferase  47.36 
 
 
427 aa  335  1e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00493713  normal  0.231188 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6562  C-methyltransferase  45.21 
 
 
410 aa  330  4e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2386  C-methyltransferase  44.97 
 
 
410 aa  325  7e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2158  C-methyltransferase  41.77 
 
 
409 aa  323  4e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3092  C-methyltransferase  45.3 
 
 
410 aa  318  1e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.763523  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1221  C-methyltransferase  40.2 
 
 
419 aa  293  3e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.38117  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4225  C-methyltransferase  34.74 
 
 
407 aa  266  5.999999999999999e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.791496  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2430  C-methyltransferase  35 
 
 
400 aa  249  9e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2379  C-methyltransferase  35 
 
 
400 aa  248  2e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29890  methyltransferase family protein  34.55 
 
 
408 aa  240  2.9999999999999997e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.942698 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2118  C-methyltransferase  35.61 
 
 
406 aa  239  5e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.510018  normal  0.0302661 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5658  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  31.84 
 
 
421 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311747  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4712  C-methyltransferase  34.55 
 
 
408 aa  223  4.9999999999999996e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.844153 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07271  hypothetical protein  28.99 
 
 
418 aa  221  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.298061  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2759  C-methyltransferase  34.55 
 
 
405 aa  217  2e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.13285  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2265  C-methyltransferase  27.63 
 
 
436 aa  183  5.0000000000000004e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1599  D-mycarose 3-C-methyltransferase  28.46 
 
 
416 aa  180  4e-44  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1758  C-methyltransferase  28.22 
 
 
409 aa  174  1.9999999999999998e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.651546  normal  0.587212 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2403  C-methyltransferase  30.71 
 
 
400 aa  171  3e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3991  NDP-hexose 3-C-methyltransferase TylCIII  29.61 
 
 
413 aa  165  1.0000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2122  NDP-hexose 3-C-methyltransferase TylCIII  26.15 
 
 
409 aa  162  9e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0486559  normal  0.0722153 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0705  methyltransferase  26.77 
 
 
412 aa  148  2.0000000000000003e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0809  NDP-hexose 3-C-methyltransferase TylCIII  26.77 
 
 
412 aa  147  2.0000000000000003e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1565  methyltransferase type 12  29.16 
 
 
396 aa  123  7e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.663655  normal  0.440278 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6563  C-methyltransferase  25.54 
 
 
396 aa  111  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2387  C-methyltransferase  27.18 
 
 
402 aa  110  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2948  C-methyltransferase  23.94 
 
 
391 aa  109  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.236256  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0365  C-methyltransferase  27.88 
 
 
376 aa  103  5e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.131067  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1270  NDP-hexose 3-C-methyltransferase TylCIII  33.13 
 
 
178 aa  99  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0673649 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3091  C-methyltransferase  25.19 
 
 
406 aa  98.2  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2391  methyltransferase type 12  26.21 
 
 
406 aa  98.2  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.044338  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3088  C-methyltransferase  25.65 
 
 
406 aa  95.5  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0212  C-methyltransferase  27.5 
 
 
359 aa  89.7  9e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.821739 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2880  Methyltransferase type 11  27.87 
 
 
383 aa  82.8  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.252544  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0071  aminotransferase class-III  27 
 
 
817 aa  79  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3347  methyltransferase  26.52 
 
 
390 aa  77.8  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0988027  normal  0.589908 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2163  C-methyltransferase  24.45 
 
 
421 aa  77.8  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.615529  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3959  C-methyltransferase  25 
 
 
414 aa  70.5  0.00000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00636655  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1799  methyltransferase domain-containing protein  21.59 
 
 
378 aa  67  0.0000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.2313  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2166  Methyltransferase type 12  20.53 
 
 
397 aa  66.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6557  methyltransferase type 12  25 
 
 
425 aa  64.7  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1566  putative sugar nucleotide processing enzyme  26.45 
 
 
414 aa  63.9  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.445342 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5655  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  21.58 
 
 
392 aa  62  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3714  methyltransferase type 11  23.67 
 
 
361 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0453  hypothetical protein  27.11 
 
 
305 aa  57.8  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1487  hypothetical protein  25.17 
 
 
300 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.767872 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0126  Methyltransferase type 12  22.77 
 
 
415 aa  55.1  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0105171  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1964  methyltransferase type 11  21.59 
 
 
352 aa  55.5  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0535  hypothetical protein  19.14 
 
 
379 aa  52.8  0.00001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02801  hypothetical protein  20.74 
 
 
411 aa  51.6  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.484397 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1325  methyltransferase type 12  24.52 
 
 
240 aa  51.6  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000858625 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1471  Methyltransferase type 11  25 
 
 
333 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.133968 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0369  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.43 
 
 
248 aa  50.4  0.00005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2963  methyltransferase type 12  29.09 
 
 
303 aa  50.4  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0106  methyltransferase type 12  21.09 
 
 
306 aa  50.4  0.00006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000284903 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0617  Methyltransferase type 12  26 
 
 
310 aa  49.7  0.00008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0164647 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2994  methyltransferase type 12  23.08 
 
 
401 aa  49.7  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.290652  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3267  hypothetical protein  27.56 
 
 
303 aa  48.5  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1471  methyltransferase type 11  24.57 
 
 
323 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0736602 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4848  Methyltransferase type 11  26.9 
 
 
310 aa  48.5  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1749  Methyltransferase type 11  24.57 
 
 
323 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.16946 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2886  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  22.49 
 
 
277 aa  47.8  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00412088 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3949  methyltransferase type 11  23.75 
 
 
513 aa  47  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>