94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0635 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_0635  methyltransferase, putative  100 
 
 
411 aa  835    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0067  C-methyltransferase  67.81 
 
 
413 aa  580  1e-164  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0480856  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0363  C-methyltransferase  62.72 
 
 
416 aa  521  1e-147  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3390  C-methyltransferase  48.65 
 
 
420 aa  431  1e-119  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0218606  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0438  methyltransferase, putative  48.4 
 
 
433 aa  431  1e-119  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.874295  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0381  putative methyltransferase  48.16 
 
 
433 aa  427  1e-118  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3333  C-methyltransferase  45.72 
 
 
413 aa  415  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4509  C-methyltransferase  49.26 
 
 
411 aa  414  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.391824  normal  0.0572283 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2784  C-methyltransferase  45.23 
 
 
413 aa  409  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.611308 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4987  C-methyltransferase  47.65 
 
 
431 aa  410  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4217  C-methyltransferase  50 
 
 
411 aa  411  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.858444  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4219  methyltransferase type 12  47.54 
 
 
412 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1048  putative SAM-dependent methyltransferase  47.77 
 
 
420 aa  391  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195919  normal  0.773577 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5197  C-methyltransferase  45.07 
 
 
415 aa  386  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3350  C-methyltransferase  47.59 
 
 
400 aa  379  1e-104  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.295208  normal  0.715465 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0594  C-methyltransferase  46.42 
 
 
407 aa  379  1e-104  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.881628  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1513  hypothetical protein  45.83 
 
 
408 aa  377  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0057  putative C-3 methyl transferase  47.95 
 
 
410 aa  373  1e-102  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00760269  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0848  C-methyltransferase  45.3 
 
 
409 aa  372  1e-102  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.436527  normal  0.303178 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0772  C-methyltransferase  45.54 
 
 
409 aa  372  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0227083 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0807  C-methyltransferase  44.8 
 
 
409 aa  370  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.409336 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0776  C-methyltransferase  42.47 
 
 
411 aa  368  1e-101  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1962  C-methyltransferase  44.2 
 
 
407 aa  366  1e-100  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3716  C-methyltransferase  45.81 
 
 
407 aa  363  4e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3397  methyltransferase, putative  43.46 
 
 
407 aa  362  5.0000000000000005e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3401  methyltransferase  43.21 
 
 
407 aa  362  8e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3375  methyltransferase  42.72 
 
 
407 aa  361  1e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3060  C-methyltransferase  44.12 
 
 
406 aa  361  1e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3071  methyltransferase  43.46 
 
 
407 aa  359  4e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2770  methyltransferase type 12  41.48 
 
 
408 aa  352  5.9999999999999994e-96  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0629  hypothetical protein  43.84 
 
 
409 aa  352  8e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4417  C-methyltransferase  47.43 
 
 
438 aa  350  4e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14051  hypothetical protein  42.57 
 
 
402 aa  340  2.9999999999999998e-92  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1871  C-methyltransferase  43.98 
 
 
413 aa  329  6e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.804572  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27750  hypothetical protein  45.26 
 
 
373 aa  322  9.999999999999999e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6562  C-methyltransferase  41.32 
 
 
410 aa  310  2.9999999999999997e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2158  C-methyltransferase  38.92 
 
 
409 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3938  methyltransferase type 12  42.47 
 
 
444 aa  308  1.0000000000000001e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.16065  normal  0.145676 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3092  C-methyltransferase  41.73 
 
 
410 aa  293  3e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.763523  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2386  C-methyltransferase  40.76 
 
 
410 aa  290  2e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2947  C-methyltransferase  40.34 
 
 
415 aa  287  2e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00433807  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0790  C-methyltransferase  40.1 
 
 
427 aa  281  2e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00493713  normal  0.231188 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5658  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  34.88 
 
 
421 aa  274  3e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311747  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4225  C-methyltransferase  35.02 
 
 
407 aa  272  7e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.791496  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07271  hypothetical protein  30.98 
 
 
418 aa  262  8.999999999999999e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.298061  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1221  C-methyltransferase  37.65 
 
 
419 aa  261  1e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.38117  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2118  C-methyltransferase  36.1 
 
 
406 aa  239  5e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.510018  normal  0.0302661 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2379  C-methyltransferase  32.35 
 
 
400 aa  230  4e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2430  C-methyltransferase  32.35 
 
 
400 aa  230  4e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29890  methyltransferase family protein  35.21 
 
 
408 aa  229  5e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.942698 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2759  C-methyltransferase  34.64 
 
 
405 aa  228  2e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.13285  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4712  C-methyltransferase  36.03 
 
 
408 aa  226  6e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.844153 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1758  C-methyltransferase  29.47 
 
 
409 aa  195  1e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.651546  normal  0.587212 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2265  C-methyltransferase  29.88 
 
 
436 aa  192  1e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2122  NDP-hexose 3-C-methyltransferase TylCIII  27.67 
 
 
409 aa  189  7e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0486559  normal  0.0722153 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3991  NDP-hexose 3-C-methyltransferase TylCIII  29.67 
 
 
413 aa  187  2e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1599  D-mycarose 3-C-methyltransferase  26.7 
 
 
416 aa  176  9e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0809  NDP-hexose 3-C-methyltransferase TylCIII  27.74 
 
 
412 aa  171  2e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0705  methyltransferase  27.74 
 
 
412 aa  171  3e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2403  C-methyltransferase  29.93 
 
 
400 aa  142  8e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0365  C-methyltransferase  29.75 
 
 
376 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.131067  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1565  methyltransferase type 12  27.27 
 
 
396 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.663655  normal  0.440278 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6563  C-methyltransferase  25 
 
 
396 aa  102  9e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1270  NDP-hexose 3-C-methyltransferase TylCIII  36.88 
 
 
178 aa  100  7e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0673649 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0071  aminotransferase class-III  27.34 
 
 
817 aa  99  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0212  C-methyltransferase  27 
 
 
359 aa  97.8  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.821739 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2387  C-methyltransferase  25.51 
 
 
402 aa  88.6  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3091  C-methyltransferase  25.19 
 
 
406 aa  86.7  6e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2948  C-methyltransferase  23.43 
 
 
391 aa  85.9  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.236256  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2391  methyltransferase type 12  28.08 
 
 
406 aa  80.5  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.044338  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1566  putative sugar nucleotide processing enzyme  27.27 
 
 
414 aa  79.7  0.00000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.445342 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2163  C-methyltransferase  24.12 
 
 
421 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.615529  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3088  C-methyltransferase  27.9 
 
 
406 aa  77.4  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6557  methyltransferase type 12  28.73 
 
 
425 aa  77.4  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2166  Methyltransferase type 12  23.1 
 
 
397 aa  70.5  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3347  methyltransferase  24.46 
 
 
390 aa  69.7  0.00000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0988027  normal  0.589908 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2880  Methyltransferase type 11  24.16 
 
 
383 aa  68.6  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.252544  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0370  methyltransferase type 12  27.33 
 
 
382 aa  59.3  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3714  methyltransferase type 11  24.85 
 
 
361 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1964  methyltransferase type 11  23.32 
 
 
352 aa  55.8  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5655  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  22.34 
 
 
392 aa  54.7  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0453  hypothetical protein  23.78 
 
 
305 aa  53.5  0.000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1320  methyltransferase type 12  21.65 
 
 
401 aa  50.8  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1794  methyltransferase type 12  26.32 
 
 
336 aa  49.7  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02801  hypothetical protein  20.19 
 
 
411 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.484397 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2555  methyltransferase type 12  23.81 
 
 
226 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0699179  decreased coverage  0.00777364 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0617  Methyltransferase type 12  24.85 
 
 
310 aa  48.5  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0164647 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3959  C-methyltransferase  25.22 
 
 
414 aa  48.1  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00636655  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2164  methyltransferase type 11  26.54 
 
 
346 aa  47  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3267  hypothetical protein  24.66 
 
 
303 aa  46.6  0.0007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1775  methyltransferase type 12  20.21 
 
 
298 aa  45.4  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2963  methyltransferase type 12  34.21 
 
 
303 aa  44.7  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1130  Methyltransferase type 11  27.72 
 
 
269 aa  43.5  0.007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.052187  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0814  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  21.22 
 
 
411 aa  43.1  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>